将R中的矩阵打印到文件中 [英] print matrix in R to a file
本文介绍了将R中的矩阵打印到文件中的处理方法,对大家解决问题具有一定的参考价值,需要的朋友们下面随着小编来一起学习吧!
问题描述
我正在使用R从文件中选择前两列,并使用函数表"从中创建矩阵,然后将其打印到文件中.问题是页眉向左移动了1个单元格.
I am using R to select the first 2 columns from a file and using a function "table" to make a matrix from it then print it to a file. the problem is that the header is shifted to the left by 1 cell.
输入文件为:
ExoT ID3 99.64 1374 5 0 1 1374 15428 16801 0.0 2510
ExoT ID2 99.64 1374 5 0 1 1374 11168 12541 0.0 2510
ExoT ID1 99.64 1374 5 0 1 1374 11942 13315 0.0 2510
ExoU ID3 100.00 2064 0 0 1 2064 1144684 1146747 0.0 3812
ExoU ID2 100.00 2064 0 0 1 2064 1245564 1247627 0.0 3812
ExoU ID1 100.00 2064 0 0 1 2064 1156352 1158415 0.0 3812
ExoS ID1 100.00 2064 0 0 1 2064 1156352 1158415 0.0 3812
所需的输出是:
ID1 ID2 ID3
ExoS 1 0 0
ExoT 1 1 1
ExoU 1 1 1
实际输出为:
ID1 ID2 ID3
ExoS 1 0 0
ExoT 1 1 1
ExoU 1 1 1
一开始似乎没有Tabb!
It seems that a tabb is missing in the begining!
我的代码是:
args <- commandArgs(TRUE)
blast_file <- read.table(args[1])
selected <- subset(blast_file, select = c(V1, V2))
table (selected)
final <- table (selected)
write.table(final,file=args[2],sep="\t")
任何想法?
推荐答案
要保留row.names
和col.names
并首先具有tabb,可以分两步导出文件:
To keep your row.names
and col.names
and have a tabb at first, you can export your file in two steps :
第一:
write.table(c("",colnames(final)),file=args[2],sep="\t")
然后:
write.table(final,file=args[2],sep="\t",col.names=F,append=T,row.names=T)
这篇关于将R中的矩阵打印到文件中的文章就介绍到这了,希望我们推荐的答案对大家有所帮助,也希望大家多多支持IT屋!
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