awk在字段中输出唯一的文本计数 [英] awk to output unique count of text in field

问题描述

我正在尝试在输入文件中输出唯一文本的计数.它在$2中，但是使用以下代码我似乎只能得到1的计数.谢谢:).

I am trying to output the count of the unique text in the input file. It is in $2 but I can only seem to get a count of 1 using the below. Thank you :).

awk '{sub(/:.*/,"",$2)} !seen[$5]++{unq++} END{print unq}' input.txt > output.txt

input.txt

chrX:48544112-48544235 **WAS**:exon.1;WAS:exon.4;WAS:exon.6 271.171
chr5:1282528-1282754 **TERT**:exon.1;TERT:exon.3 349.08
chrX:48547038-48547465 **WAS**:exon.1;WAS:exon.10;WAS:exon.2 42.459

所需的输出

2

推荐答案

如果将字段分隔符重新定义为冒号或空格"，它将变得更加简单

If you redefine your field separator to "colon or space", it gets a lot simpler

awk -F '[: ]' '!seen[$3]++ {n++} END {print n}' file

这篇关于awk在字段中输出唯一的文本计数的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！