使用bash脚本在R中安装库的权限错误 [英] Permissions-error using bash-script to install a library in R
本文介绍了使用bash脚本在R中安装库的权限错误的处理方法,对大家解决问题具有一定的参考价值,需要的朋友们下面随着小编来一起学习吧!
问题描述
我正在Bash脚本中运行名为CNV-Seq的软件,但是我没有运行以下命令的权限:
I am running a software called CNV-Seq in a Bash script but, I do not have permission to run the following command:
R CMD INSTALL cnv/
错误是
* installing to library '/share/apps/r/3.2.2/intel/lib64/R/library'
Error: ERROR: no permission to install to directory '/share/apps/r/3.2.2/intel/lib64/R/library'
我如何在未获得许可的情况下解决此问题.
How can I solve this problem without gaining permission.
推荐答案
一种方法是创建执行R脚本的bash脚本.因此,R脚本将包含:
One approach is creating the bash script that executes R script. So, the R script will contain:
install.packages("package_name")
将其另存为 xyz.r
,bash脚本将包含:
and the bash script will contain:
R -f path_to/xyz.r
将其另存为 abc
.
像这样运行bash脚本:
Run the bash script like this:
bash abc
这篇关于使用bash脚本在R中安装库的权限错误的文章就介绍到这了,希望我们推荐的答案对大家有所帮助,也希望大家多多支持IT屋!
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