在 R 和 rJava 中使用 Travis [英] Using Travis with R and rJava

问题描述

我有一个依赖于 rJava 的 R 包.我正在使用 travis 的 R 支持

I have an R package which depends on rJava. I am using the R support for travis

language: r

sudo: required

warnings_are_errors: true

r_github_packages:
 - keboola/redshift-r-client

但它失败并出现错误:

Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
  call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  error: unable to load shared object '/usr/local/lib/R/site-library/rJava/libs/rJava.so':
  libjvm.so: cannot open shared object file: No such file or directory

完整日志:https://travis-ci.org/keboola/provisioning-r-client/builds/61021633

我尝试添加:

apt_packages:
 - openjdk-7-jre

或

jdk:
- oraclejdk8

但似乎没有任何效果.

language: r

sudo: required

apt_packages:
 - r-cran-rjava

解决方案 2:

language: r

sudo: required

apt_packages:
 - openjdk-7-jre

before_install:
 - export JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre
 - export PATH=$PATH:$JAVA_HOME/bin
 - export LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib/jvm/java-8-oracle/lib/amd64:/usr/lib/jvm/java-8-oracle/jre/lib/amd64/server
 - sudo R CMD javareconf 

推荐答案

请尝试通过apt-get直接安装r-cran-rjava.

这里有许多与 r-cran-rjava 相关的 SO 问题，因此浏览这些问题也可能有所帮助.这个包的 Build-Depends 当前是 default-jdk，Depends 在 openjdk-7-jre | 上.默认-jre.不过，依靠软件包应该可以帮助您.

There are a number of questions here on SO related to r-cran-rjava so glancing at those may help too. The Build-Depends for this package currently are default-jdk and the Depends is on openjdk-7-jre | default-jre. Relying on the package should help you there though.

FWIW 我仍然使用以前的 Travis 设置，因为我发现它加载速度更快.

FWIW I still use the previous Travis setup as I find it loads faster.

这篇关于在 R 和 rJava 中使用 Travis的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！