FASTA:删除长度为n的序列后 [英] fasta: delete sequences after n length
本文介绍了FASTA:删除长度为n的序列后的处理方法,对大家解决问题具有一定的参考价值,需要的朋友们下面随着小编来一起学习吧!
问题描述
我有在不同长度的每个文件seqs的1000多个FASTA文件。我想只保留第200(N)基地从每个序列。我怎样才能做到这一点在Perl?
I have multiple fasta files with 1000s of seqs in each file of varying length. I would like to keep only the first 200 (n) bases from each sequence. How can I do this in Perl?
推荐答案
很难准确地理解你的意思,没有看到一个例子,但如果你只需要每行前200个字符只使用剪切
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Difficult to understand exactly what you mean without seeing an example but if you only need the first 200 characters per line just use cut
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cut -c1-200 file
这篇关于FASTA:删除长度为n的序列后的文章就介绍到这了,希望我们推荐的答案对大家有所帮助,也希望大家多多支持IT屋!
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