在R中以对数方式绘制散点图，数据包含零 [英] Plotting scatterplots with pairs in R, in log scale with data containing zeros

问题描述

我试图用对来绘制一些散点图。
我的数据框看起来像：

 > e 
 XYZ 
 0 0 0 
 2 3 4 
 0 3 4 
 3 3 3 
  

标准数据框在这里。

我用这个来绘制我的散点图，再也没有什么好奇的：

  pair（〜X + Y + Z，data = e，log =xy）
  

它的效果很好，但它并不绘制标签。但是，如果我删除命令中的log =xy，那么标签很好地绘制。所以我想这是与我想要我的散点图成对数的事实有关。

所以我的问题是我该怎么办？
我要用手之前删除所有的行（如何做？）
有没有魔术可以让我有log =xy和我的散点图标签？

感谢您的帮助，
如果不清楚请让我知道。

解决方案

你忽略了这个（在那里我打电话给你的数据框架 DF ）：

  R>对（〜X + Y + Z，data = df，log =xy）
有30个警告（使用warnings（）来查看它们）
  

如果你看这三十个警告，你会看到

• log 不是 pair（）的公认参数（）

所以如果你想在日志中使用对，你可能需要自己记录日志（并且添加一个小的epsilon或者使用像 log（1 + x）并为该数据调用 pair（）。

编辑最简单的可能是 pair（〜X + Y + Z，data = log（1 + DF））

I am trying to plot some pairs of scatterplots using "pairs". My dataframe look like :

    >e
    X Y Z
    0 0 0
    2 3 4
    0 3 4
    3 3 3

A completely standard dataframe here.

I use this to plot my scatter plots, again nothing fancy:

pairs(~X+Y+Z, data=e, log="xy")

It works great, but it doesn't plot the labels. However if I remove the log="xy" in the command, then the labels are plotted nicely. So I guess it has to do with the fact that I want my scatterplots to be in log scale.

So my question is what shall I do ? Shall I remove all lines with zeros in it before hand (how do you do that?) Is there a magic trick that will let me have log="xy" and my scatterplots labeled ?

Thanks for you help, Please let me know if it is not clear.

解决方案

You ignored this (where I called your data frame DF):

R> pairs(~X+Y+Z, data=df, log="xy")
There were 30 warnings (use warnings() to see them)

and if you look at these thirty warnings, you will see that

• you cannot plot data containing zeros on a log scale (and I guess you know why)

• log is not a recognised parameter for pairs()

So if you want a pairs plot in logs, you may have to takes logs yourself (and either add a small epsilon or use a transformation like log(1 + x) and call pairs() on that data.

Edit The easiest is probably pairs(~X+Y+Z, data=log(1+DF))

这篇关于在R中以对数方式绘制散点图，数据包含零的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！