使用 conda 安装软件包如何更改我的 python 版本并删除 conda? [英] How does using conda to install a package change my python version and remove conda?
问题描述
我一直在使用 Anaconda 和 python 2.7
I had been using Anaconda with python 2.7
$ python
Python 2.7.14 |Anaconda custom (64-bit)| (default, Dec 7 2017, 17:05:42)
[GCC 7.2.0] on linux2
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
当我决定安装 tensorflow 时(因为某些原因我有非 GPU 版本)
When I decided to install tensorflow (since for some reason I had the non-gpu version)
我使用的命令是:
$ conda install -c anaconda tensorflow-gpu
但是，完成后(此 cmd 的输出的详细信息将在后面)，我不再有 conda:
However, after it was done (detail on output of this cmd to follow), I no longer had conda:
$ conda install -c conda-forge keras
Traceback (most recent call last):
File "/home/me/anaconda2/bin/conda", line 12, in <module>
from conda.cli import main
ModuleNotFoundError: No module named 'conda'
(注意:我也不再使用 Keras)并且现在运行的是 Python 3.7(！?):
(Note: I also no longer had Keras) and was now running Python 3.7(!?):
$ python
Python 3.6.8 |Anaconda, Inc.| (default, Dec 30 2018, 01:22:34)
[GCC 7.3.0] on linux
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>>
发生了什么?我如何阻止它再次发生?这之前发生过一次，我最终删除了所有 anaconda 文件，然后重新安装.我不想让这成为一种习惯.
What happened? How do I stop it from happening again? This happened once before and I ended up deleting all my anaconda files, then reinstalling. I don't want to make that a habit.
我的 conda install 的输出是:
$ conda install -c anaconda tensorflow-gpu
Collecting package metadata: done
Solving environment: done
## Package Plan ##
environment location: /home/me/anaconda2
added / updated specs:
- tensorflow-gpu
The following packages will be downloaded:
package | build
---------------------------|-----------------
_tflow_190_select-0.0.1 | gpu 2 KB anaconda
absl-py-0.7.0 | py36_0 156 KB anaconda
astor-0.7.1 | py36_0 43 KB anaconda
c-ares-1.15.0 | h7b6447c_1 98 KB anaconda
ca-certificates-2018.12.5 | 0 123 KB anaconda
certifi-2018.11.29 | py36_0 146 KB anaconda
cudatoolkit-9.0 | h13b8566_0 340.4 MB anaconda
cudnn-7.1.2 | cuda9.0_0 367.8 MB anaconda
cupti-9.0.176 | 0 1.6 MB anaconda
curl-7.63.0 | hbc83047_1000 145 KB anaconda
gast-0.2.2 | py36_0 138 KB anaconda
git-2.11.1 | 0 9.5 MB anaconda
grpcio-1.16.1 | py36hf8bcb03_1 1.1 MB anaconda
krb5-1.16.1 | h173b8e3_7 1.4 MB anaconda
libcurl-7.63.0 | h20c2e04_1000 550 KB anaconda
libedit-3.1.20181209 | hc058e9b_0 188 KB anaconda
libssh2-1.8.0 | h1ba5d50_4 233 KB anaconda
markdown-3.0.1 | py36_0 107 KB anaconda
mkl_fft-1.0.10 | py36ha843d7b_0 170 KB anaconda
mkl_random-1.0.2 | py36hd81dba3_0 407 KB anaconda
ncurses-6.1 | he6710b0_1 958 KB anaconda
numpy-1.15.4 | py36h7e9f1db_0 47 KB anaconda
numpy-base-1.15.4 | py36hde5b4d6_0 4.3 MB anaconda
openssl-1.1.1 | h7b6447c_0 5.0 MB anaconda
pip-18.1 | py36_0 1.8 MB anaconda
protobuf-3.5.2 | py36hf484d3e_1 610 KB anaconda
python-3.6.8 | h0371630_0 34.4 MB anaconda
qt-4.8.7 | 2 34.1 MB anaconda
setuptools-40.6.3 | py36_0 625 KB anaconda
six-1.12.0 | py36_0 22 KB anaconda
sqlite-3.26.0 | h7b6447c_0 1.9 MB anaconda
tensorboard-1.9.0 | py36hf484d3e_0 3.3 MB anaconda
tensorflow-1.9.0 |gpu_py36h02c5d5e_1 3 KB anaconda
tensorflow-base-1.9.0 |gpu_py36h6ecc378_0 170.8 MB anaconda
tensorflow-gpu-1.9.0 | hf154084_0 2 KB anaconda
termcolor-1.1.0 | py36_1 7 KB anaconda
tk-8.6.8 | hbc83047_0 3.1 MB anaconda
werkzeug-0.14.1 | py36_0 423 KB anaconda
wheel-0.32.3 | py36_0 35 KB anaconda
------------------------------------------------------------
Total: 985.7 MB
The following NEW packages will be INSTALLED:
_tflow_190_select anaconda/linux-64::_tflow_190_select-0.0.1-gpu
c-ares anaconda/linux-64::c-ares-1.15.0-h7b6447c_1
cudatoolkit anaconda/linux-64::cudatoolkit-9.0-h13b8566_0
cudnn anaconda/linux-64::cudnn-7.1.2-cuda9.0_0
cupti anaconda/linux-64::cupti-9.0.176-0
krb5 anaconda/linux-64::krb5-1.16.1-h173b8e3_7
pip anaconda/linux-64::pip-18.1-py36_0
tensorflow-gpu anaconda/linux-64::tensorflow-gpu-1.9.0-hf154084_0
The following packages will be UPDATED:
absl-py conda-forge/noarch::absl-py-0.1.10-py~ --> anaconda/linux-64::absl-py-0.7.0-py36_0
ca-certificates conda-forge::ca-certificates-2018.11.~ --> anaconda::ca-certificates-2018.12.5-0
curl pkgs/main::curl-7.60.0-h84994c4_0 --> anaconda::curl-7.63.0-hbc83047_1000
gast 0.2.0-py27_0 --> 0.2.2-py36_0
grpcio pkgs/main::grpcio-1.12.1-py27hdbcaa40~ --> anaconda::grpcio-1.16.1-py36hf8bcb03_1
libcurl pkgs/main::libcurl-7.60.0-h1ad7b7a_0 --> anaconda::libcurl-7.63.0-h20c2e04_1000
libedit pkgs/main::libedit-3.1-heed3624_0 --> anaconda::libedit-3.1.20181209-hc058e9b_0
markdown conda-forge/noarch::markdown-2.6.11-p~ --> anaconda/linux-64::markdown-3.0.1-py36_0
mkl_fft pkgs/main::mkl_fft-1.0.6-py27hd81dba3~ --> anaconda::mkl_fft-1.0.10-py36ha843d7b_0
ncurses pkgs/main::ncurses-6.0-h9df7e31_2 --> anaconda::ncurses-6.1-he6710b0_1
openssl conda-forge::openssl-1.0.2p-h14c3975_~ --> anaconda::openssl-1.1.1-h7b6447c_0
protobuf conda-forge::protobuf-3.5.2-py27hd28b~ --> anaconda::protobuf-3.5.2-py36hf484d3e_1
python pkgs/main::python-2.7.14-h1571d57_29 --> anaconda::python-3.6.8-h0371630_0
setuptools pkgs/main::setuptools-38.4.0-py27_0 --> anaconda::setuptools-40.6.3-py36_0
six pkgs/main::six-1.11.0-py27h5f960f1_1 --> anaconda::six-1.12.0-py36_0
sqlite pkgs/main::sqlite-3.23.1-he433501_0 --> anaconda::sqlite-3.26.0-h7b6447c_0
tensorflow conda-forge::tensorflow-1.3.0-py27_0 --> anaconda::tensorflow-1.9.0-gpu_py36h02c5d5e_1
tk pkgs/main::tk-8.6.7-hc745277_3 --> anaconda::tk-8.6.8-hbc83047_0
wheel pkgs/main::wheel-0.30.0-py27h2bc6bb2_1 --> anaconda::wheel-0.32.3-py36_0
The following packages will be SUPERSEDED by a higher-priority channel:
certifi conda-forge::certifi-2018.11.29-py27_~ --> anaconda::certifi-2018.11.29-py36_0
git pkgs/main::git-2.17.0-pl526hb75a9fb_0 --> anaconda::git-2.11.1-0
libssh2 pkgs/main::libssh2-1.8.0-h9cfc8f7_4 --> anaconda::libssh2-1.8.0-h1ba5d50_4
mkl_random pkgs/main::mkl_random-1.0.2-py27hd81d~ --> anaconda::mkl_random-1.0.2-py36hd81dba3_0
numpy pkgs/main::numpy-1.15.4-py27h7e9f1db_0 --> anaconda::numpy-1.15.4-py36h7e9f1db_0
numpy-base pkgs/main::numpy-base-1.15.4-py27hde5~ --> anaconda::numpy-base-1.15.4-py36hde5b4d6_0
qt pkgs/main::qt-5.9.4-h4e5bff0_0 --> anaconda::qt-4.8.7-2
tensorflow-base pkgs/main::tensorflow-base-1.9.0-eige~ --> anaconda::tensorflow-base-1.9.0-gpu_py36h6ecc378_0
werkzeug pkgs/main::werkzeug-0.14.1-py27_0 --> anaconda::werkzeug-0.14.1-py36_0
The following packages will be DOWNGRADED:
astor 0.7.1-py27_0 --> 0.7.1-py36_0
tensorboard 1.10.0-py27hf484d3e_0 --> 1.9.0-py36hf484d3e_0
termcolor 1.1.0-py27_1 --> 1.1.0-py36_1
Proceed ([y]/n)? y
Downloading and Extracting Packages
tensorflow-gpu-1.9.0 | 2 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
absl-py-0.7.0 | 156 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
six-1.12.0 | 22 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
git-2.11.1 | 9.5 MB | ########################################################################################################################################## | 100%
_tflow_190_select-0. | 2 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
setuptools-40.6.3 | 625 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
c-ares-1.15.0 | 98 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
cupti-9.0.176 | 1.6 MB | ########################################################################################################################################## | 100%
libssh2-1.8.0 | 233 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
gast-0.2.2 | 138 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
ncurses-6.1 | 958 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
protobuf-3.5.2 | 610 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
tensorflow-base-1.9. | 170.8 MB | ########################################################################################################################################## | 100%
ca-certificates-2018 | 123 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
python-3.6.8 | 34.4 MB | ########################################################################################################################################## | 100%
cudatoolkit-9.0 | 340.4 MB | ########################################################################################################################################## | 100%
qt-4.8.7 | 34.1 MB | ########################################################################################################################################## | 100%
sqlite-3.26.0 | 1.9 MB | ########################################################################################################################################## | 100%
astor-0.7.1 | 43 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
tensorboard-1.9.0 | 3.3 MB | ########################################################################################################################################## | 100%
mkl_fft-1.0.10 | 170 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
mkl_random-1.0.2 | 407 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
certifi-2018.11.29 | 146 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
wheel-0.32.3 | 35 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
numpy-base-1.15.4 | 4.3 MB | ########################################################################################################################################## | 100%
numpy-1.15.4 | 47 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
curl-7.63.0 | 145 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
openssl-1.1.1 | 5.0 MB | ########################################################################################################################################## | 100%
tk-8.6.8 | 3.1 MB | ########################################################################################################################################## | 100%
libedit-3.1.20181209 | 188 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
markdown-3.0.1 | 107 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
werkzeug-0.14.1 | 423 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
krb5-1.16.1 | 1.4 MB | ########################################################################################################################################## | 100%
termcolor-1.1.0 | 7 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
pip-18.1 | 1.8 MB | ########################################################################################################################################## | 100%
libcurl-7.63.0 | 550 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
tensorflow-1.9.0 | 3 KB | ########################################################################################################################################## | 100%
grpcio-1.16.1 | 1.1 MB | ########################################################################################################################################## | 100%
cudnn-7.1.2 | 367.8 MB | ########################################################################################################################################## | 100%
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done
(好吧 - 我现在看到了对 Python 3.7 的更改，但这仍然是一件令人讨厌的事情，必须小心.有什么方法可以强制它不理会我的 Python 版本?)
(OK - I see the change to Python 3.7 now, but that's still a nasty thing to have to be careful about. Is there some way to force it to leave my Python version alone?)
推荐答案
原因
更改 Python 版本而不更新 conda 包会破坏 Conda..Python 版本更改(2.7.14 -> 3.6.8)造成了这样一种情况:新的 python 有一个新的 site-packages 不再包含 conda 包，而如果您只在 2.7.x 内更新，这将不是问题.
Cause
Changing Python versions without updating the conda package breaks Conda. . The Python version change (2.7.14 -> 3.6.8) created a situation where the new python has a new site-packages which no longer contains a conda package, whereas if you only update within 2.7.x, this wouldn't be an issue.
Conda 包括一组二进制文件(例如，当您在 shell 中键入 conda 时调用的内容)和一个同名的 Python 包.Python 包是 Conda 整体运行所必需的，并且每当您尝试使用 conda 时都会加载它.
Conda includes both a set of binaries (e.g., what you're invoking when you type conda in a shell) and a Python package by the same name. The Python package is necessary for Conda as a whole to function and it get's loaded whenever you try to use conda.
Anaconda 上的许多包似乎会触发 Python 版本更改，但随后不会触发 conda 包更新，这是有问题的.这听起来像是依赖解析器忽略的东西 - 即，默认行为应该是保护 conda 所在的 base 环境的完整性.
It is problematic that many packages on Anaconda seem to be triggering Python version changes, but not subsequently triggering a conda package update. This sounds like something the dependency resolver is overlooking - i.e., default behavior should be to protect integrity of base environment where conda lives.
恢复的一种可能途径是临时使用 conda-exec 的独立版本来修复您的 base 环境.您可以从任何目录执行以下所有操作，因此可以使用临时文件或放置下载的任何位置.如果有效或需要调整，请在评论中报告！
One possible route to recovery is to temporarily use a standalone build of the conda-exec to repair your base env. You can do all the following from any directory, so maybe use a temp or wherever you put downloads. Please report in the comments if this works or needs adjusting!
为您的平台下载合适的独立 Conda(在这里我们将使用
linux-64/conda-standalone-4.9.2).实际的二进制文件将位于 .tar.bz2 文件中的conda_standalone/conda.exe.不要介意.exe它是一个二进制文件，应该在 shell 调用时运行.无论如何，我要将其重命名为conda-exec:
Download the appropriate standalone Conda for your platform (here we'll use
linux-64/conda-standalone-4.9.2). The actual binary will be atconda_standalone/conda.exein the .tar.bz2 file. Don't mind the.exeit's a binary and should run when called at the shell. I'm going to rename it toconda-execanyway:
# download archive
wget -qO conda-standalone-4.9.2.tar.bz2 https://anaconda.org/conda-forge/conda-standalone/4.9.2/download/linux-64/conda-standalone-4.9.2-ha770c72_2.tar.bz2
# extract only the binary and rename
tar -xzOf conda-standalone-4.9.2.tar.bz2 standalone_conda/conda.exe > conda-exec
# add executable permissions
chmod +x conda-exec
暂时将 CONDA_ROOT_PREFIX 设置为安装的基础.通常这是 anaconda3 或 miniconda3 文件夹；在这种情况下，我们将使用 OP 给出的路径:
Temporarily set CONDA_ROOT_PREFIX to the base of your install. Typically this is the anaconda3 or miniconda3 folder; in this case, we'll use the path given by OP:
export CONDA_ROOT_PREFIX=/home/me/anaconda2
测试它是否有效:
Test that it works:
./conda-exec info
要检查的关键是 base environment: 正确识别您的 base env 所在的位置并将其显示为 (writable).您还应该在 包缓存中的 base 环境中看到 .pkgs 文件夹:
The key thing to check for is that base environment: correctly identifies to where your base env is and shows it as (writable). You should also see the pkgs folder in your base env in the package cache: .
选项 1:恢复到以前的修订版
确定当前修订之前的修订(我们在这里用
<k-1>表示)，并尝试恢复它:
Identify the revision immediately before the current one (we'll denote it by
<k-1>here), and attempt to restore it:
./conda-exec list -n base --revisions
./conda-exec install -n base --revision <k-1>
如果这有效，你应该完成.启动一个新的 shell 并再次尝试使用 conda.否则，另一个选择是...
If this works, you should be done. Start a new shell and try using conda again. Otherwise, the other option is...
选项 2:为当前 Python 安装 conda
(重新)在基础环境中安装
conda包:
./conda-exec install -n base conda
确保建议的 Conda 版本与当前安装的 Python 版本相对应.如果 --force-reinstall 标志声称已经满足要求，它可能会很有用.
Make sure that the build of Conda that is suggested corresponds to the version of Python currently installed. The --force-reinstall flag might be useful if it claims the requirement is already satisfed.
尝试一个新的 shell，看看 conda 是否正常工作.您不需要保留 conda-exec.
Try a new shell and see if conda is working. You don't need to keep the conda-exec around.
如果一切都失败了，您可能只需要重新安装.其他人报告说安装在其他目录中并且仍然能够使用和访问他们的环境.
If all else fails you may just have to reinstall. Others have reported installing in other directories and being able to still use and access their envs.
首先，只是一个一般性(固执)建议:更多地利用虚拟环境.这并不能直接解决问题，但它会帮助您拥有一个大大减少遇到此类陷阱的工作流程.您一开始就不应该接受如此巨大的变化，而不是基础.就我个人而言，我很少在基础设施(emacs、jupyter 相关的东西、conda 等)之外的 base 中安装东西.1 软件包去进入特定于项目或至少是开发类型的环境.
First, just a general (opinionated) recommendation: leverage virtual envs more. This isn't directly solving the problem, but it will help you have a workflow that is significantly less prone to encountering such pitfalls. You shouldn't have accepted such a huge change in the first place, not to base. Personally, I rarely install things in base outside of infrastructure (emacs, jupyter-related things, conda, etc.).1 Software packages go into project-specific or at least development-type envs.
例如，如果我进行了所示的安装，我会为它创建一个新的环境
For example, were I doing the install shown, I would have made a new env for it
conda create -n tf36 anaconda::tensorflow-gpu python=3.6
或您真正希望使用的任何 Python 版本.
or whatever Python version you actually wish to work in.
Conda 确实支持包固定，这是确保您永远不会通过将 Python 2 转换为 3 再次破坏您的基础安装的更直接的方法.即，在 env 的 conda-meta 中 文件夹创建一个文件，pinned 并添加行
Conda does support package pinning, and this is the more direct way to ensure you never ruin your base install again by transitioning Python 2 to 3. Namely, in the env's conda-meta folder create a file, pinned and add the line
python 2.7.*
请注意，一些用户报告了 3.6 的类似问题 ->3.7 转换，所以我相信在这里包括次要版本是必要的.请参阅 关于固定的文档.
Note that some users have reported similar issues for 3.6 -> 3.7 transitions, so I believe including the minor version here is necessary. See the documentation on pinning.
[1] 请注意，我使用的是 Miniconda，而不是 Anaconda 安装程序，因此我从一开始就可以更好地控制 base.
这篇关于使用 conda 安装软件包如何更改我的 python 版本并删除 conda?的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！
