Biopython - 安装

本节介绍如何在您的计算机上安装Biopython.它非常容易安装,不会超过五分钟.

第1步 : 验证Python安装

Biopython旨在与Python 2.5或更高版本一起使用.因此,必须首先安装python.在命令提示符中运行以下命令 :

 
> python --version

它的定义低于 :

验证Python安装

如果安装正确,它会显示python的版本.否则,下载最新版本的python,安装它然后再次运行命令.

步骤2 : 使用pip安装Biopython

在所有平台上使用命令行中的pip很容易安装Biopython.输入以下命令 :

 
> pip install biopython

屏幕上会显示以下响应 :

使用pip安装Biopython

用于更新旧版本的Biopython :

 
> pip install biopython --upgrade

屏幕上会显示以下响应 :

更新旧版本

执行此命令后,将删除旧版本的Biopython和NumPy(Biopython依赖于它),然后再安装最新版本.

第3步 : 验证Biopython安装

现在,您已在计算机上成功安装了Biopython.要验证是否正确安装了Biopython,请在python控制台上键入以下命令 :

验证Biopython安装

它显示了Biopython的版本.

Alternate Way : 使用Source安装Biopython

要使用源代码安装Biopython,请按照以下说明 :

从下载最新版本的Biopython以下链接 :   https://biopython.org/wiki/Download

<截至目前,最新版本为 biopython-1.72 .

下载文件并解压缩压缩存档文件,进入源代码文件夹并输入以下命令 :

 
> python setup.py build

这将从下面给出的源代码构建Biopython :

使用Source安装Biopython

现在,使用以下命令测试代码 :

 
> python setup.py test


测试代码

最后,使用以下命令安装 :

 
> python setup.py install


最后安装