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将networkx图转换为Gephi

我正在尝试将一个Pythonnetworkx图形转换为一个与Gephi兼容的文件。然而,我遇到了一些我不知道如何解决的问题: 问题: 如何将节点特征向量合并到gexf文件中?我一直收到错误:";TypeError:不允许属性值类型:<;class‘numpy.ndarray’>;";。如果我删除下面的节点功能代码,则它可以工作,但理想情况下,我希望包括节点功能。 ..
发布时间:2022-03-31 22:40:48 Python

为 NetworkX 上的节点添加颜色属性以导出到 Gephi

我正在使用 NetworkX 制作图表以导出以使用 Gephi 进行可视化.我一直在向图表中的节点添加各种属性,没有问题,直到我尝试添加颜色.有谁知道如何使用networkx导出带有“彩色"节点的图形?(我一直在写一个gexf文件,不过不管是不是别的格式,只要和Gephi兼容就行.) 这是我制作图表的代码: defconstruct_weighted_graph(nodes, distan ..
发布时间:2022-01-13 18:10:58 其他开发

图可视化框架

我想在图形应用程序中可视化 Neo4j 数据库.(我这样做主要是作为一种学习练习). 我希望它的行为与 Neo4j 的 WebAdmin 中的可视化几乎相同:当图形出现时,我希望看到节点在它们固定到最终位置时四处移动,并且我希望用户能够单击并拖动屏幕周围的节点图标,并让它们粘在它们被放置的地方,图表的其余部分会根据变化进行调整. 我有两个问题. 上一段中粗略描述的三个要求的技术术 ..
发布时间:2021-12-28 17:29:26 前端开发

Neo4j 可视化 - 操作图形

我目前正在使用 Neo4j Python rest 客户端,我想可视化图表并能够修改它,添加新的节点关系等.此外,我还希望 Neo4j 数据库中的更改.那可能吗?也可以可视化自循环吗?我在 http://www.neo4j.org/develop/visualize 中阅读了有关 D3.js、Neoclipse 和 Gephi 的内容 但我不确定该使用哪个. 提前致谢. 解决方案 您 ..
发布时间:2021-12-28 17:12:17 其他开发

通过Gremlin控制台将Titan图形数据库连接到Gephi

我正在尝试通过gremlin控制台连接到gephi(0.9.1).我的泰坦数据库中有一张图.我还在gephi中启用了流服务器.通过gremlin我执行了以下命令: :插件使用tinkerpop.gephi g = TinkerFactory.createModern() :远程连接tinkerpop.gephi 所有这些都工作正常.但是当我运行最后一条命令时: ..
发布时间:2020-11-20 21:03:50 其他开发

Python:如何将列表列表的元素转换为无向图?

我有一个程序可以检索PubMed出版物的清单,并希望建立共同作者的图表,这意味着我想为每篇文章添加每位作者(如果尚不存在)作为顶点并添加无方向的边(或增加其权重). 我设法编写了该程序的第一个程序,该程序检索每个出版物的作者列表,并且理解我可以使用NetworkX库构建图形(然后将其导出到GraphML for Gephi),但无法全神贯注于将“列表列表"转换为图形. 这里是我的代码. ..
发布时间:2020-11-20 18:50:44 Python

在Play应用程序中使用Gephi

我目前正在Scala中构建一个Play框架应用程序,该应用程序需要使用Gephi Java库. 我尝试将Gephi添加为SBT中的托管依赖项,但是SBT无法解决所有Gephi依赖项.这是已知问题.然后,我只是尝试将整个Gephi JAR添加到我的lib/文件夹中,作为非托管依赖项. IntelliJ可以很好地检测到库,并且我可以完美地编译我的应用程序.问题是启动应用程序后立即发生异常,它似乎 ..
发布时间:2020-05-28 02:30:10 其他开发

从GML格式将多图导入Gephi

我使用NetworkX创建一组节点和边线并将其导出为GML格式,以便可以在Gephi 0.9.1版本上查看它们.当我导入以下GML时: graph [ multigraph 1 directed 0 node [ id 0 label 1 ] node [ id 1 label 2 ] edge [ source 0 ..
发布时间:2020-05-17 19:06:55 其他开发

在Gephi中打开之前,请在Networkx write_graphml中添加属性

我有一个数据框,该数据框由格式为df = pd.DataFrame(["A", "B", "Count", "some_attribute"])的可能的网络连接组成.此数据框表示这样的连接: A与B有联系 此连接发生了“计数"次 此连接具有特定的属性(即特定的联系人类型) 我想将此数据框导出为graphml格式.使用以下代码可以正常工作: import networkx as ..
发布时间:2020-05-17 19:05:32 Python

如何从Python创建Gephi网络图?

我刚刚发现有关GephiStreamer的信息. https://pypi.python.org/pypi/GephiStreamer 使用此程序包可以将指令从python发送到Gephi,以在Gephi中创建节点和边. # Create a node with a custom_property node_a = graph.Node("A",custom_property=1) ..
发布时间:2020-05-17 19:00:19 Python

在NetworkX上的节点上添加颜色属性以导出到Gephi

我正在使用NetworkX制作图形以导出以使用Gephi进行可视化.我一直在为图表中的节点添加各种属性,没有问题,直到尝试添加颜色为止.有谁知道如何使用networkx导出带有“彩色"节点的图形? (我一直在写入gexf文件,但是只要它与Gephi兼容,就不必担心它是否是另一种格式.) 以下是我制作图表的代码: def construct_weighted_graph(nodes, d ..
发布时间:2020-05-17 18:58:14 其他开发

将NetLogo数据导出到带有节点和边的图形

我已经在NetLogo中创建了代理(乌龟)之间的一些链接.此链接将在每个时间步更改.我的目的是将这些数据(即乌龟及其链接b/w)导出到具有顶点(乌龟)边缘(链接)的图形,可以将其作为Gephi的输入.当它与Gephi链接时,是否有可能看到图表中的netlogo中发生的更改.有人可以帮我吗.谢谢. 解决方案 要以Gephi可用的格式导出网络数据,我建议使用我想您可以在每个时间段重新保存您的网 ..
发布时间:2020-05-17 02:49:07 其他开发

Neo4j出口到Gephi

如何将neo4j数据库中的数据导出以用于gephi程序?您可以在仪表板中将其导出为json或csv,但在gephi中不起作用.我现在正在使用neoclient来管理密码查询,但是似乎他们没有执行此操作的方法. 解决方案 有一个 Neo4j-Gephi插件,但我认为它不支持Neo4j的最新版本. 最好的方法可能是在 neo4j-shell-tools 导出为CSV或GraphML. ..
发布时间:2020-05-17 00:50:17 其他开发

两方布局Gephi 0.9.1

我的问题很简单: 我如何在Gephi中绘制一个二分图,其布局与您在所附图像中看到的布局类似? 我真的无法在Gephi的选项中找到合适的布局 谢谢 解决方案 Gephi 0.9.1版具有一个“事件图布局"插件,该插件将执行以下操作:Tools -> Plugins -> Available Plugins.在数据实验室下,您需要向节点数据表中添加一个整数级变量(例如“模式" ..
发布时间:2020-04-30 07:44:37 其他开发

图形可视化框架

我想在图形应用程序中可视化Neo4j数据库。 (我这样做主要是为了学习练习)。 我希望它的行为几乎与Neo4j的WebAdmin中的可视化相同:当图形出现时,我想看到节点在它们最终位置时移动,我希望用户能够点击并拖动屏幕周围的节点图标,让它们粘在它们被丢弃的地方,图表的其余部分进行调整以适应变化。 我有两个问题。 上段粗略描述的三项要求的技术术语是什么? 我是一名没有JavaS ..
发布时间:2019-05-27 11:52:28 前端开发

使用工具包将流图传送给Gephi:NullPointerException

我试图创建一个正常的图形,并使用Gephi工具包将其传输到Gephi GUI。我正在关注该工具包和流式插件教程。 我的代码无法工作,因为查找API没有返回有效的值。在调试时,我可以发现下面的两种查找方法都返回空值,因为我在使用这些对象访问其他方法时遇到问题。 StreamingServer server = Lookup。 getDefault()。lookup(StreamingServ ..
发布时间:2018-05-25 17:46:24 Java开发

Gephi的Neo4j配置

我想用Neo4j来存储我在python中创建的许多图。我使用Gephi进行可视化,并且我认为导出为Neo4j插件将是获取数据的一种非常简单的方法。问题是,服务器似乎没有识别Gephi生成的neostore ... db文件。 我猜我配置错误,但有没有办法解决这个问题? 或者,我也直接导入文件。我有两个文件:一个带有节点标题和属性,另一个带有标题标题边缘清单。 我猜我需要将标题转换 ..
发布时间:2018-05-25 17:35:12 其他开发