Snakemake-无法根据输出文件确定输入文件中的通配符
我对Snakemaker非常陌生，也不太会说Python(抱歉，这可能是一个非常基本的愚蠢问题)： 我目前正在构建一个管道来使用atlas分析一组bamfile。这些bamfile位于不同的文件夹中，不应移动到公共文件夹中。因此，我决定提供一个示例列表，如下所示(这只是一个示例，实际上示例可能位于完全不同的驱动器上)： Sample Path Sample1 /some/
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GitLab CI子渠道
我对GitLab ci子管道有问题。 需要在回购中有多个应用程序的每次提交后自动触发CI管道。需要配置以检测哪些文件夹/文件被修改，以便知道要触发哪个应用程序管道 结构示例 Main/ ---- applicationsA/ -------- appA1/ -------- appA2/ -------- appA3/ ---- applicationsB/ -------- appB
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来自管道组件的动态SFTP
我正在尝试为BizTalk 2016从管道组件创建动态sftp。我需要知道用于创建sftp连接的上下文属性中使用的名称空间。我将在代码和BizTalk之外配置基本端口、服务器、用户名、密码、目的地和连接限制。这就是为什么我需要知道SFTP位置将在代码中使用的命名空间。 推荐答案 只需查看BizTalk.System，您会发现名为SFTP.bts_sftp_properties的架构具有
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Sklearn.eline中的LeaveOneOutEncode
我使用LeaveOneOutEncode创建了一个管道。当然，我用了一个玩具的例子。Leave One Out用于转换类别变量 import pandas as pd import numpy as np from sklearn import preprocessing import sklearn from sklearn.pipeline import Pipeline from sk
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在AWS中横向扩展内存消耗较高但计算能力较低的作业，并使用Docker：寻找最佳解决方案
冗长的标题但重点是，我有一些具有以下要求的数据科学管道(基于python)： 与基于服务器的内部&orchestrator进行协调 跨多个用户/产品/等运行，其中N可能相对较高 要分发且不受Orchestrator服务器限制的此作业的加载(&I) 这些作业由坞站映像支持 这些作业运行相对较快(从1秒到20秒，POST数据加载) 这些作业通常需要大量的I/O进出。 否spark必填
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数据依赖与控制依赖的区别
我很难理解数据依赖和控件依赖之间的区别。 我看到的一个例子是： 数据依赖例如，指令使用另一条指令创建的数据 控制相关性例如，指令等待更新的注册表进行比较 我很难理解的是，例如在BEQ中，我等待寄存器更新，但我也依赖他的数据。 所以我不知道如何区分它们之间的区别。 推荐答案 指令等待更新注册表进行比较是对控制相关性的错误描述，难怪 条件分支指令本身对其
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ColumnTransformer失败，管道中有CountVectorizer/HashingVectorizer(多个文本功能)
类似于此问题(ColumnTransformer fails with CountVectorizer in a pipeline)，我希望使用管道中的ColumnTransformer对具有文本功能的列应用CountVectorizer/HashingVectorizer。但我不是只有一个文字功能，而是多个。如果我传递了一个功能(而不是像另一个问题的解决方案中建议的那样作为列表)，它工作得很好，
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使用KNeighbors分类器的SKLearning管道
我正在尝试使用KNeighbors分类器和支持向量机在sklear中构建一个GridSearchCV管道。到目前为止，我已经尝试了以下代码： from sklearn.model_selection import GridSearchCV from sklearn.pipeline import Pipeline from sklearn.neighbors import KNeighbor
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在Python3中使用管道获取对RFE的支持和排名属性
到目前为止，我拥有的代码如下所示，它工作得很好。但是，我要为每个测试的功能打印以下RFE属性："；rfe.Support_[i]"；、&rfe.ranking_[i]"；和所选功能的名称。i"；引用索引后，第一个属性返回True或False(如果选择了列)，第二个属性返回它们各自的排名。 换句话说，我想打印每个RFE中考虑的列，并且它们不会保留为抽象的东西。
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是否有可能在不知道总共有多少个阶段的情况下，在Azure管道中运行最后阶段？
是否有办法让阶段作为最后一个阶段运行(不包括作业后/报告生成状态)？ 问题是：我有一个元素数量未知的each-循环，每个元素都有自己的阶段。 因此，我们不能只在最后一个阶段使用"；DependOn；，因为以前的每个阶段在运行时都有一个唯一的名称。 各阶段的顺序如下： 准备 2-n)使用特定的停靠容器构建/编译/测试 最后)移除所有容器 目前运行正常，但
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用管道和网格搜索绘制最佳决策树
我有一个使用决策树作为估计器的流水线GridearchCV 现在我想绘制与GridearchCV的Best_Estiator相对应的决策树 有一些关于堆栈溢出的回复，但没有人考虑在GridearchCV内建立管道 from sklearn.preprocessing import StandardScaler from sklearn.tree import DecisionTr
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Azure DevOps&Quot；所需模板检查不起作用(&Q)
我正在通过YML管道(mainpieline.yml)中的存储库资源扩展模板，一切都运行得很好。下面是项目的repo文件夹结构详细信息。 我的模板在orga-&>；proj1->；repoX-&>；分支-&>模板/set1/template1.yml(此模板中只有一个阶段，有一个作业和三个任务) 我的主管道位于orga->；proj2->；repoY->；分支->；
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在蔚蓝管道出现故障的情况下如何执行分支任务？
我有以下3项任务。 我想要做的是，当NPM1成功时，它将执行npm2a并跳过npm2b。 当NPM1失败时，它将跳过npm2a并执行npm2b。 如何在Azure管道中做到这一点？ 请不要给我指点教程。 推荐答案 发生故障时如何在Azure管道中执行任务分支？ 您可以在npm1和npm2a之间添加命令行或内联PowerShell任务以调用Logging Commands：
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GitLab CI/CD如何捕捉管线中的卷曲响应
我有启动一些应用程序的pipeline，现在我想添加test阶段，在那里我检查应用程序是否启动成功，例如当构建阶段完成时，我检查curl，我的意思是cURL127.0.0.1:8080如果响应200OK，否则失败。 如何使用Gitlab pipline? 创建 stages: - build - deploy - test build: stage: build scri
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C++中的泛型多功能函数组合/流水线
是否可以在C++20中实现泛型多功能函数组合/流水线？ struct F{//1st multi-functor template void operator()(const T& t){/*...*/} }; struct G{//2nd multi-functor template void operator()(const T&
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SkLearning管道匹配：属性错误：找不到下部
我想在skLearning中使用管道，如下所示： corpus = load_files('corpus/train') stop_words = [x for x in open('stopwords.txt', 'r').read().split(' ')] # Uppercase! countvec = CountVectorizer(stop_words=stop_words,
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Azure DEVOPS：将变量组作为参数传递给模板
我在代码库使用Azure devopYML管道。 我已在管道创建了变量组(称为‘My_VG’的管道；库；变量组) 在我的管道(YML)文件中，我希望将此变量组my_vg作为参数发送到模板my_template.yml。 但是，当我在‘Variable’下使用此参数my_vg时，它不会被展开(尽管在打印时它会给我赋值) 如何在模板HERE组中获取此MY_VG的值：${参数.变量_组}}
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SCRKIT学习管道是否将StandardScaler应用于y？
鉴于我的渠道 pipe = Pipeline([('scaler', StandardScaler()), ('regressor', LinearRegression())]) 然后我调用pipe.fit(X_train, y_train)，管道是将缩放器同时应用于功能和目标，还是仅应用于功能？ 如果不是，y参数在StandardScaler的fit_transform方法中有什么作
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使用SimpleImputer和OneHotEncode的管道-如何正确使用？
我面临的挑战是创建一个管道来计算(SI)一个类别变量(如颜色)，然后输入(OHE)2个变量(如颜色和星期几)。在两个步骤中使用了颜色。 我想将SI和OHE放在1 ColumnTransformer中。我刚刚了解到SI和OHE是并行运行的，这意味着OHE不会对推算的颜色进行编码。 然后我尝试： si = SimpleImputer(strategy='mean', add_indi
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如何在上游作业中获取下游作业的控制台产量？
我正在尝试寻找解决方法，因为第一个问题仍未得到回答。 can't run Start-Job with credentials from Jenkins 我有作业A。作业A在服务器上启动PowerShell脚本并显示一些输出。 我还有一个管道B，它在不同的服务器上运行作业A的多个副本。 以下是groovy代码 stage 'Copy sources from Git' build j
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