OpenMPI mpirun宇宙大小
我不知道我是否可能理解不正确.但是，这就是我想使用OpenMPI达到的目标，特别是仅从mpirun开始: 我想使用-np参数创建一个单一进程，该参数将世界大小指定为1 然后我想将Universe的大小设置为任意数字(出于参数10)，我该怎么做? 以下两个命令: MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD，& world_size); MPI_Attr_get(M
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OpenMPI Secure SHell如何从主节点进入所有计算节点?
首次使用OpenMPI.我很好奇API如何调用运行时环境以在计算节点上运行.我正在考虑设置一个由4个或5个节点组成的Linux集群.我阅读了很多有关为主节点创建无密码ssh访问的文档. OpenMPI是否调用命令行参数以ssh进入--hostfile中声明的任何计算节点，然后开始传播任务? 解决方案 当ssh'到远程计算机时，Open MPI不会添加任何其他参数(默认情况下).您应该只设置
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如何:带Infiniband的Azure OpenMPI-Linux
我不熟悉将Microsoft Azure用于科学计算的目的，并且在设置过程中遇到了一些问题. 我有一个跳箱设置，可以用作我希望使用的软件的许可证服务器，并且还具有一个通用驱动器来存储所有软件. 还设置了6个计算节点(16个核心/节点)，我可以毫无问题地从跳转框"ssh"到计算节点.跳转框和计算节点将CentOS与OpenMPI 1.10.3一起使用 我已经创建了一个脚本，该脚本存储在我
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MPI非阻塞Irecv没有收到数据?
我使用MPI无阻塞通信(MPI_Irecv，MP_Isend)来监视从站的空闲状态，代码就像下面这样. 等级0: int dest = -1; while( dest
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在具有OpenMP依赖性的Mac上安装Lightgbm
我是python新手，想安装 lightgbm 在我的Macbook上.我做了一个pip install lightgbm，它说安装成功.但是，当我尝试将其导入到笔记本中时，出现以下错误消息: ../anaconda/envs/python3/lib/python3.6/ctypes/__init__.py in __init__(self, name, mode, handle, use_
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错误是因为缺少文件libmpi.so.1
我正在使用Omnet ++和Veins进行仿真，并且在昨晚从Ubuntu 15升级到16.04 LTS之前，它运行良好.现在，尝试运行模拟时出现以下错误:error while loading shared libraries: libmpi.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory 我搜索了libmpi.
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具有sudo权限的OpenMPI/mpirun或mpiexec
我正在研究与Epiphany处理器一起使用的代码( http://www.parallella.org/)并运行主显节代码，我需要在主机端程序上具有sudo权限. sudo无法逃脱！ 现在，我需要在多个节点上运行此代码，以执行此操作，我正在使用mpi，但mpi无法与sudo一起正常工作 #sudo mpirun -n 12 --hostfile hosts -x LD_LIBRARY_
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我使用OpenMPI或MPICH进行编译了吗?
我的Linux机器上有一个可执行文件，我知道它是用OpenMPI或MPICH库编译的. 问题:如何确定哪个? 解决方案 以下诊断过程假定MPICH/MPICH2和Open MPI为 您可能已链接的唯一可能的MPI实现.其他 (尤其是商业)MPI实现确实存在，并且可能有不同的实现 库名称和/或库符号. 首先确定您是否动态链接: % ldd my_executable
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是否可以在本地计算机和远程群集上运行OpenMPI?
我有一组需要在集群中执行的计算操作(例如512个MPI进程).现在，我在群集上的根节点打开了一个套接字，并在计算操作之间将数据传输到本地计算机，但是我想知道是否可以仅创建两个MPI组，而这些组之一是我的本地计算机.机器和另一个远程群集，并使用MPI命令在它们之间发送数据. 这可能吗? 解决方案 是的，只要集群节点和您的计算机之间存在网络路径，就可以. MPI标准提供了执行此操作的抽象
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MPI，C，派生类型，向量结构?
我需要创建一个MPI派生类型来表示程序中的类.该类相当简单，但是规模很大(大约有75个数据成员**).所有数据成员都是单个值，一维数组或二维数组.这是一个示例: class RestartData { int dsr; double firea2sorgn; int ifwoody[NUM_PFT]; double rootfrac[MAX_ROT_LAY][NUM_PFT]
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运行基于OpenMPI的库时出错
我已经从Ubuntu中可用的标准apt-get安装程序安装了openmpi库.我运行一个调用MPI库的python代码.我收到以下错误.有什么想法是错误的根源吗?这是OpenMPI配置错误吗?该如何解决? [thebigbang:17162] mca: base: component_find: unable to open /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca_
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使用降雪R初始化MPI集群
我一直试图在大学的集群上运行Rmpi和snowfall，但是由于某种原因，无论我分配了多少个计算节点，我的snowfall初始化都只在一个节点上运行. 这是我的初始化方式: sfInit(parallel=TRUE, cpus=10, type="MPI") 有什么想法吗?我将根据需要提供澄清. 解决方案 要在群集上运行基于Rmpi的程序，您需要使用批处理排队系统请求多个节
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如何在Infiniband中使用GPUDirect RDMA
我有两台机器.每台机器上有多个Tesla卡.每台机器上还有一个InfiniBand卡.我想通过InfiniBand在不同机器上的GPU卡之间进行通信.只是点对点单播就可以了.我当然想使用GPUDirect RDMA，这样我就可以避免进行额外的复制操作. 我知道Mellanox现在提供了驱动程序. InfiniBand卡.但是它没有提供详细的开发指南.我也知道OpenMPI支持我要的功能.但是
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每个核心分配两个MPI流程
如何为每个内核分配2个MPI进程? 例如，如果我执行mpirun -np 4 ./application，则它应使用2个物理内核来运行4个MPI进程(每个内核2个进程).我正在使用Open MPI 1.6.我做了mpirun -np 4 -nc 2 ./application，但无法运行. 它抱怨mpirun was unable to launch the specified app
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有什么更容易学习和调试OpenMP或MPI?
我有一个数字处理C/C ++应用程序.基本上，它是不同数据集的主循环.我们可以访问具有openmp和mpi的100节点群集.我想加快应用程序的速度，但是我是绝对的新手，无论是mpi还是openmp.我只是想知道即使性能不是最好的，最容易学习和调试的是什么. 我还想知道哪种方法最适合我的主循环应用程序. 谢谢 解决方案 如果您的程序只是使用OpenMP的一个大循环，可以像编写这样
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#pragma结尾的隐式屏障
朋友，我正在尝试学习openMP范例. 我使用以下代码来了解#omp编译指示. int main(void){ int tid; int i; omp_set_num_threads(5); #pragma omp parallel \ private(tid) { tid=omp_get_thread_num(); printf("tid=%d started .
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奇怪的乘法结果
在我的代码中，我在C ++代码中具有这种乘法，所有变量类型均为double [] f1[0] = (f1_rot[0] * xu[0]) + (f1_rot[1] * yu[0]); f1[1] = (f1_rot[0] * xu[1]) + (f1_rot[1] * yu[1]); f1[2] = (f1_rot[0] * xu[2]) + (f1_rot[1] * yu[2]);
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MPI_Scatter 2d向量
我需要将vector的片段传递给所有进程，以对matrix进行乘法运算.我想传递一个向量(orginal_size/processes)的向量. std::vector Algorytm::mnozenie(std::vector > matrix,std::vector wektor){
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限制为MPI_Send或MPI_Recv?
我们对MPI_Send或MPI_Recv上的邮件大小有任何限制吗?还是受计算机限制?当我尝试发送大数据时，它无法完成. 这是我的代码: #include #include #include #include #include void AllGather_ring(void* data, in
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MPI中通信器之间的发送和接收操作
我之前的问题:无法实现MPI_Intercomm_create MPI_INTERCOMM_CREATE的问题已解决.但是，当我尝试在颜色0的进程0(全局等级= 0)和颜色1的进程0(即全局等级= 2)之间实现基本的发送接收操作时，代码只是在打印接收到的缓冲区后挂断. 代码: program hello include 'mpif.h' implicit none integer t
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