openmpi相关内容

MPI的Scatterv操作

我不确定我是否正确理解了MPI_Scatterv应该做什么.我有79个项目可以分散数量可变的节点.但是，当我使用MPI_Scatterv命令时，我得到了荒谬的数字(好像接收缓冲区的数组元素未初始化).这是相关的代码段: MPI_Init(&argc, &argv); int id, procs; MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &id); MPI_Comm_si ..
发布时间：2020-05-12 20:06:27 C/C++开发

为什么此MPI代码执行不正确?

我正在尝试创建一个“你好，世界！" (Open)MPI中的应用程序，这样每个进程将按顺序打印出来. 我的想法是让第一个进程完成时向第二个进程发送消息，然后第二个进程向第三个进程发送消息，等等: #include #include int main(int argc,char **argv) { int rank, size; M ..
发布时间：2020-05-12 20:06:13 其他开发

开放的MPI排名不正确

当我运行"Open MPI"程序时，它通常以我想知道的随机顺序分配等级 有没有办法总是按顺序分配等级? 所以代替这个 Hello, World. I am 2 of 3 Hello, World. I am 0 of 3 Hello, World. I am 1 of 3 我能得到这个吗 Hello, World. I am 0 of 3 Hello, World. I a ..
发布时间：2020-05-12 20:06:08 其他开发

在服务器群集上运行openMPI期间无限等待?

我已经成功在服务器和计算机之间设置了密码less ssh. 有一个简单的openMPI程序，可以在单台计算机上很好地运行. 但是，不幸的是，当我在集群上尝试此操作时，我既没有收到密码提示(因为我已经设置了ssh授权)，也没有执行进展. 主机文件如下所示， # The Hostfile for Open MPI # The master node, 'slots=8' is used ..
发布时间：2020-05-12 20:06:06 其他开发

MPI_COMM_SPAWN的控制节点映射

上下文: 整个问题可以概括为:我正在尝试复制对system(或fork)的调用的行为，但是在mpi环境中. (结果是您不能并行调用system.)这意味着我有一个程序在多个节点上运行，每个节点上有一个进程，然后我希望每个进程都调用一个外部程序(因此对于n节点而言)我要运行外部程序的n个副本)，等待所有这些副本完成，然后继续运行原始程序. 为了在并行环境中以安全的方式实现此目的，我一直使 ..
发布时间：2020-05-12 20:05:46 其他开发

尝试安装openmpi的分段错误

我正在尝试安装openmpi，但是经过不同的尝试后，我仍然无法使用它. 这是这是我从终端上获得的内容:mpirun timmy@timmy-Lenovo-G50-80 ~/openmpi-1.8.1 $ mpirun [timmy-Lenovo-G50-80:21817] *** Process received signal *** [timmy-Lenovo-G50-80:2181 ..
发布时间：2020-05-12 20:04:44 服务器开发

如何以“串行"方式编译MPI应用程序.模式(不使用MPI编译器)?

这个问题听起来有点奇怪... 想象一下我有一个MPI应用程序，但是我没有安装MPI的系统. 所以我想在不修改MPI支持(1进程1线程)的情况下编译应用程序，而无需修改源代码. 有可能吗? 我在某个地方找到了一个"mimic_mpi.h"包装器，该包装器应该可以完全满足我的要求.但是那里缺少一些MPI函数(例如MPI_Cart_create，MPI_Cart_get等)，所以我没有成功. ..
发布时间：2020-05-12 20:04:30 其他开发

MPI_Scatter-无法正常工作

我正在使用MPI编写我的第一个程序，但是我很难尝试使用MPI_Scatter将数据正确发送到其他进程，对其进行修改并使用MPI_Gather接收值.代码如下: int** matrix; int m = 2, n = 2; int status; // could have been int matrix[2][2]; matrix = malloc(m*sizeof(int*)); ..
发布时间：2020-05-12 20:04:21 其他开发

MPI_Reduce选择前k个结果

我想使用MPI在所有节点上找到前k个结果.为此，我想将MPI_Reduce与自己的函数一起使用.但是我的代码不起作用，因为该函数的len参数与给MPI_Reduce的count参数不同. 我在此处找到了实现可以这样做以流水线计算. 我的代码与此代码相似: inline void MPI_user_select_top_k(int *invec, acctbal_pair *inout ..
发布时间：2020-05-12 20:04:14 C/C++开发

Rmpi，OpenCPU和Apparmor:拒绝请求"/".

我有一个R软件包，可以通过Rmpi软件包将作业发送到我正在运行的OpenMPI集群. R会话中的所有工作都可以从控制台运行.但是，当我尝试从这样的OpenCPU服务器执行相关功能时(更改了细节以保护无辜的人): curl -XPOST http://99.999.999.99/ocpu/library/MyPackage/R/my_cluster_function 我收到此错误: ..
发布时间：2020-05-12 20:04:07 其他开发

在Ubuntu 16.04 VirtualBox上安装Rmpi

我在VM VirtualBox上创建了新的ubuntu-16.04.2-desktop-amd64计算机，并且希望能够将R环境与Rmpi一起使用. 以下两种方法都给出类似的错误. 更新的简化的预构建二进制方法: 在安装Ubuntu后，我打开了一个终端并执行以下命令: ~$ sudo apt-get update ~$ sudo apt-get install openmpi ..
发布时间：2020-05-12 20:03:56 其他开发

MPI_Reduce无法正常工作

我对MPI还是很陌生，我正在尝试使用MPI_Reduce查找整数数组的最大值.我有一个大小为arraysize的整数数组arr，这是我的代码: MPI_Init(&argc, &argv); MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &number_of_processes); MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &my_process_id); M ..
发布时间：2020-05-12 20:02:46 其他开发

在C中执行简单的MPI程序时，群集挂起/显示错误

我正在尝试运行一个简单的MPI程序(添加了多个数组)，它在我的PC上运行完美，但只是挂起或在群集中显示以下错误. 我正在使用open mpi和以下命令来执行 集群的Netwok配置(主节点1) MASTER eth0链接encap:以太网HWaddr 00:22:19:A4:52:74 inet地址:10.1.1.1广播:10.1.255.255掩码:255.25 ..
发布时间：2020-05-12 20:02:39 其他开发

使用MPI_Gather openmpi c收集字符串

我想为每个进程生成一个字符串，然后收集所有内容.但是在每个进程中创建的字符串都是通过附加int和chars来创建的. 我仍然无法正确收集所有内容.我可以一张一张地打印所有部分字符串，但是如果尝试打印rcv_string，我只会得到一个部分字符串，或者可能是分段错误. 我尝试使用memset在字符串的末尾放置零，以动态和静态方式为字符串保留内存，但是我找不到办法. 如果有人知道如何 ..
发布时间：2020-05-12 20:02:34 其他开发

为什么mpirun不尊重我对BTL的选择?

我正在Windows 7计算机上的Cygwin上使用Open MPI(1.8.3).我想只在这台机器上运行MPI代码，而不用在任何外部网络上交谈.我了解我应该能够使用MCA选项将mpirun限制为自我和共享内存通信: mpirun -n 8 --mca btl sm,self ./hello.exe 但是，当我尝试此操作时，Windows询问我是否要使防火墙例外，这表明我的工作正在尝试通 ..
发布时间：2020-05-12 20:02:26 其他开发

运行mpirun时无效的数据类型

我有一个简单的程序，我想将结构分散在多台计算机上，但是即使程序可以很好地编译，但看来我错误地定义了数据类型.我有以下代码. #include #include #include typedef struct small_pixel_s { double red; double green; double bl ..
发布时间：2020-05-12 20:02:16 其他开发

OpenMPI 1.4.3 mpirun主机文件错误

我正在尝试在4个节点上运行一个简单的MPI程序.我正在使用在Centos 5.5上运行的OpenMPI 1.4.3.当我使用主机文件/机器文件提交MPIRUN命令时，没有任何输出，收到空白屏幕.因此，我必须取消工作.. 我使用以下运行命令::mpirun --hostfile hostfile -np 4 new46 OUTPUT ON KILLING JOB: mpirun: k ..
发布时间：2020-05-12 20:01:25 其他开发