在python中访问包含matlab类的.mat文件 [英] Access .mat file containing matlab classes in python

问题描述

我有一个.mat文件从matlab生成2012b。它包含一个带有用户定义的matlab类的变量。

在python 3.3中使用scipy.io.loadmat加载文件时，我得到以下结果：

  mat = scipy.io.loadmat（'D：\test.mat'）
 mat 
 {'__header__ '：b'MATLAB 5.0 MAT文件，平台：PCWIN64，创建日期：Fri Feb 22 15:26:28 2013'，'__function_workspace__'：array（[[0,1,73，...，0， 0]]，dtype = uint8），'__globals__'：[]，'__version__'：'1.0'，'None'：MatlabOpaque（[b'futureDS'，b'MCOS'，b'cStream'，[[3707764736 ]'，
 dtype = [（'s0'，'O'），（'s1'，'O'，[2]，[1]，[1] ），（'s2'，'O'），（'arr'，'O'）]）
  

我想要访问类型cStream的futureDS对象，但似乎无法这样使用mat ['无']。调用mat ['None']简单的结果是：

  MatlabOpaque（[（b'futureDS'，b'MCOS'，b 'cStream'，[[3707764736]，[2]，[1]，[1]，[1]，[1]]]，
 dtype = [（'s0'，'O'）， 's1'，'O'），（'s2'，'O'），（'arr'，'O'）]）
  

我被困在这里。我是新的python和尝试从我的旧工作从matlab。

解决方案

不幸的是， ，SciPy不支持包含新式类对象（用 classdef 定义的对象）的mat文件，也不支持任何第三方mat文件读取器知道的。在返回的 mat 字典中的 __ function_workspace __ 元素包含您在一些未记录和尚未

最简单的解决方案是在Matlab中将您的自定义类转换为基本的 struct 对象将其保存到磁盘。这可以通过简单地调用 struct（futureDS）来实现（尽管有警告）。它将所有公共和私有属性暴露为纯字段，任何第三方读者都可以阅读它的价值。

（更技术上，Matlab使用Matlab数组类型ID为17; 官方文档（PDF）仅列举类型到15）。

I have a .mat file generated from matlab 2012b. It contains a variable with a user-defined matlab class.

When loading the file using scipy.io.loadmat in python 3.3, I get the following:

mat=scipy.io.loadmat('D:\test.mat')
mat
{'__header__': b'MATLAB 5.0 MAT-file, Platform: PCWIN64, Created on: Fri Feb 22 15:26:28 2013', '__function_workspace__': array([[ 0,  1, 73, ...,  0,  0,  0]], dtype=uint8), '__globals__': [], '__version__': '1.0', 'None': MatlabOpaque([ (b'futureDS', b'MCOS', b'cStream', [[3707764736], [2], [1], [1], [1], [1]])], 
      dtype=[('s0', 'O'), ('s1', 'O'), ('s2', 'O'), ('arr', 'O')])}

I am looking to access the "futureDS" object of type "cStream" but seem unable to do so using mat['None']. Calling mat['None'] simple results in:

MatlabOpaque([ (b'futureDS', b'MCOS', b'cStream', [[3707764736], [2], [1], [1], [1], [1]])], 
      dtype=[('s0', 'O'), ('s1', 'O'), ('s2', 'O'), ('arr', 'O')])

I am stuck here. I am new to python and trying to port my old work from matlab. Any help would be appreciated.

Thank you.

解决方案

Unfortunately, SciPy does not support mat files that contain new-style class objects (those defined with classdef), nor does any third-party mat-file reader as far as I'm aware. That __function_workspace__ element in the returned mat dictionary contains the information you're after in some undocumented and as-yet-not-reverse-engineered way.

The easiest solution is to convert your custom classes into basic struct objects within Matlab before saving them to disk. This can be achieved (albeit with a warning) by simply calling struct(futureDS). It exposes all public and private properties as plain fields, which can be read by any third-party reader worth its salt.

(More technically, Matlab saves these objects with the Matlab Array type id of 17; the official documentation (PDF) only enumerates types up through 15).

这篇关于在python中访问包含matlab类的.mat文件的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！