在ggplot中绘制多个变量 [英] plotting multiple variables in ggplot

问题描述

我有一张看起来像这样的数据表 -

  pos gtt1 gtt2 ftp1 ftp2 
 8 100 123 49 101 
 9 85 93 99 110 
 10 111 102 53 113 
 11 88 110 59 125 
 12 120 118 61 133 
 13 90 136 64 145 
 14 130 140 104 158 
 15 78 147 74 167 
 16 123 161 81 173 
 17 160 173 88 180 
 18 117 180 94 191 
 19 89 188 104 199 
 20 175 197 107 213 
  

我想用 pos （position）使用ggplot在x轴上。我试图用一种颜色和 ftp1 显示 gtt1 和 gtt2 $ c>和 ftp2 为另一种颜色，因为它们是样本的单独组（gtt和ftp）。我已经成功创建了图形，但所有四行都有不同的颜色。我想只保留传说中的gtt和ftp（不是全部四个）。奖金，我怎样才能让这些线条变得光滑。

以下是我到目前为止所做的：

  library（reshape2 ）; library（ggplot2）
 data<  -  read.table（myfile.txt，header = TRUE，sep =\ t）
 data.melt < -  melt（data， id =pos）
 ggplot（data.melt，aes（x = pos，y = value，color = variable））+ geom_line（）
  

提前致谢

解决方案

最简单的方法是重新塑形您的数据的方式稍有不同：

  dd1 = melt（dd [，1：3]，id = c（pos ））
 dd1 $ type =gtt
 dd2 = melt（dd [，c（1,45）]，id = c（pos））
 dd2 $ type =ftp
 dd.melt = rbind（dd1，dd2）
  

现在我们有一个指定变量type的列：

  R>头（dd.melt，2）
 pos变量值类型
 1 8 gtt1 100 gtt 
 2 9 gtt1 85 gtt 
  

数据一旦采用这种格式，ggplot命令很简单：

  ggplot（dd.melt，aes（x = pos，y = value））+ 
 geom_line（aes（color = type，group = variable））+ 
 scale_colour_manual（values = c（gtt =蓝色，ftp =红色））
  

您可以使用 stat_smooth ：

  ## span控制平滑
g + stat_smooth（se = FALSE ，span = 0.5）
  

I have a data table which looks like this-

pos gtt1    gtt2    ftp1    ftp2
8   100 123 49  101
9   85  93  99  110
10  111 102 53  113
11  88  110 59  125
12  120 118 61  133
13  90  136 64  145
14  130 140 104 158
15  78  147 74  167
16  123 161 81  173
17  160 173 88  180
18  117 180 94  191
19  89  188 104 199
20  175 197 107 213

I want to make a line graph with pos (position) on the x-axis using ggplot. I am trying to show gtt1 and gtt2 lines in one colour and ftp1 and ftp2 in another colour, because they are separate groups (gtt and ftp) of samples. I have successfully created the graph, but all four lines are in different colours. I would like to keep only gtt and ftp in the legend (not all four). Bonus, how can I make these lines little smooth.

Here is what I did so far:

library(reshape2);library(ggplot2)
data <- read.table("myfile.txt",header=TRUE,sep="\t")
data.melt <- melt(data,id="pos")
ggplot(data.melt,aes(x=pos, y=value,colour=variable))+geom_line()

Thanks in advance

解决方案

The easiest way is to re-shape your data in a slightly different way:

dd1 = melt(dd[,1:3], id=c("pos"))
dd1$type = "gtt"
dd2 = melt(dd[,c(1, 4:5)], id=c("pos"))
dd2$type = "ftp"
dd.melt = rbind(dd1, dd2)

Now we have a column specifying the variable "type":

R> head(dd.melt, 2)
  pos variable value type
1   8     gtt1   100  gtt
2   9     gtt1    85  gtt

Once the data is in this format, the ggplot command is straightforward:

ggplot(dd.melt,aes(x=pos, y=value))+ 
  geom_line(aes(colour=type, group=variable)) + 
  scale_colour_manual(values=c(gtt="blue", ftp="red"))

You can add smoothed lines using stat_smooth:

 ##span controls the smoothing
 g  + stat_smooth(se=FALSE, span=0.5)

这篇关于在ggplot中绘制多个变量的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！