igraph相关内容

安装python-igraph时出现UnicodeDecodeError

我在64位Linux Mint 16上使用python 2.7,并且试图安装python-igraph.但是,当我运行sudo pip install python-igraph时,会得到以下日志: Downloading/unpacking python-igraph Downloading python-igraph-0.7.1-1.tar.gz (375kB): 375kB dow ..
发布时间:2020-11-26 19:15:22 Python

如何检查igraph中两个顶点之间是否存在唯一的最短路径

我想用igraph识别两个顶点之间是否存在唯一的最短路径或多个最短路径.如果我使用length(all_shortest_paths(g, i,j),这实际上对我有帮助,但是我觉得有很多多余的操作.我宁愿先使用get.shortest.paths(g, i,j)获得一条最短的路径,然后再查看是否存在另一条路径.但是,我不知道如何做到这一点. 有人可以帮我确定是否存在与get.shortest ..
发布时间:2020-11-26 19:15:18 其他开发

在igraph中使用bfs查找生成树

我想使用igraph函数graph.bfs在图中找到生成树. 你能告诉我怎么做吗? PS:我尝试使用从graph.bfs返回的值的$father信息,但结果使我感到困惑.这是一个示例: g ..
发布时间:2020-11-26 19:15:12 其他开发

从文件读取边缘.我无法定义图

我是R语言的新手.我正在使用igraph库.我是新来的使用这种库的人. 我有问题: 我在文本文件中有一个边列表.它有两列.第一个具有初始节点,第二个具有终止节点. 我正在使用以下文件读取文件: g1 ..
发布时间:2020-11-26 19:13:59 其他开发

在剧情和图例之间同步颜色

我有此命令可以从igraph生成网络图: plot(ig, layout=layout.fruchterman.reingold(ig),vertex.label=NA,vertex.label.color="black",vertex.frame.color="black",edge.color="black", vertex.color=rainbow(9)[data2$Group], ..
发布时间:2020-11-26 19:13:58 其他开发

如何传播或整理网络?

我正在尝试扩展网络或更好地可视化网络.问题是我似乎分散了一些隔离株,并迫使簇进入紧凑的空间,使得很难看到图案. 任何人都没有任何指南来分发群集或更好地可视化数据.如果需要,我可以在代码中进行编辑. 谢谢 解决方案 以下是获得更好布局的两种方法.两种解决方案都只需要做一点试验就可以找到好的设置.首先,由于您不提供任何数据,因此我将举一个与您类似的示例. library(igrap ..
发布时间:2020-11-26 19:13:50 其他开发

使用R igraph根据权重绘制边线

我正在尝试在R中绘制带有igraph的网络,其中边缘按权重排序.我已经分配了颜色,但是我想要背面的弱边缘和前面的强边缘.有没有办法做到这一点? 谢谢 解决方案 这是一个可能的解决方案.这实际上取决于您使用的是什么,因此使用代码示例可以改善这一点. 基本上,边缘按出现的顺序绘制.因此,我们需要根据其权重属性对边缘进行排序.在同一张图中似乎不可能做到这一点,因此可能只需要创建一个具有相同 ..
发布时间:2020-11-26 19:12:48 其他开发

Rigograph祖先python

我有一个网络,如图所示.在python中有祖先函数.当我在节点5上使用它时,它将提供节点1,2和3的列表.igraph R中的等效功能是什么?我尝试了子组件,但对我而言不起作用. 我的实际网络也很安静,我不想使用父子功能,因为我不知道每种情况的程度 解决方案 R函数是neighborhood和mode="in": http://igraph.org/r/doc/neighborhoo ..
发布时间:2020-11-26 19:12:44 其他开发

PNG图像作为R中的顶点(igraph)

[R帮助] 您好,有什么方法可以将png图像用作R中的顶点吗?特别是在仍在使用igraph软件包时? 例如,我有一些PNG图片 1.png 2.png 3.png 我可以用1.png替换某些顶点,用2.png替换其他顶点,用3.png替换其余顶点吗? 解决方案 使用新的raster顶点形状很简单: library(png) library(igraph) # To ..
发布时间:2020-11-26 19:12:43 其他开发

在R中使用iGraph获得路径的权重

我有一个从数据框创建的图形,其格式为from, to, cost列.我也有一条有效的路径(作为一系列顶点,以igraph的vpath格式)(我的图形是有向的). 给定我的图形和路径,是否有任何函数会给我该路径的成本? 我并没有要求最短的路径,因为我是从all_shortest_paths获得路径的.但是,我只获得节点继承,而没有获得路径的权重,这也是我所需要的. 修改:数据 ..
发布时间:2020-11-26 19:12:40 其他开发

在R中,是否有与heatmap()类似的函数来可视化大型矩阵中的组?

我目前在R中有一个1000 by 1000矩阵.矩阵中有100个组/社区,我希望以某种方式验证这100个组是否正在出现.例如,前10列/行定义一个组,后10列/行定义另一个组,依此类推. 有没有一种方法可以直观地看到这样的分组?理想情况下,我将具有一个热图,该热图可以显示10 by 10的对角线块.我尝试了heatmap函数,但似乎没有做到这一点. 有人在这里有什么想法吗? 解决 ..
发布时间:2020-11-26 19:12:36 其他开发

如何在R中模拟具有分类性或同质性的图?

在R中,我当前正在使用软件包igraph.我想知道是否有任何方法可以模拟具有同构或分类结构的图-还是其他R包允许这样做.谢谢! 解决方案 您是否看过 ergm 包?使用指数随机图模型,您可以模拟带有nodematch项的分类网络.有关该术语的说明,请参见?"ergm-terms". library(ergm) test.net = as.network(matrix(0,10,10 ..
发布时间:2020-11-26 19:12:32 其他开发