使用所有可用的库编译Fortran netCDF程序 [英] Compiling Fortran netCDF programs with all available libraries

问题描述

首先，我已经阅读了本主题，但是我无法编译我的代码。
在Ubuntu上编译Fortran netCDF程序

我在UBUNTU 14.04上，正在编译使用NetCDF的fortran程序。我有这样的编译错误：

  terrain.f :(。text + 0x17efd）：对'ncopn_'$ b的未定义引用$ b terrain.f :(。text + 0x18111）：未定义对'ncopn_'的引用
 terrain.f :(。text + 0x187cc）：未定义对'ncclos_'
 terrain.f :( text + 0x187ea）：对'ncclos_'的未定义引用
  

肯定是说我没有netcdf fortran库。但是我根据这些带有禁用共享和禁用dap选项的网页安装了zlib，HDF5，netcdf C和netcdf Fortran。

http://www.unidata.ucar.edu/software/netcdf/docs/build_default.html
http://www.unidata.ucar.edu/软件/netcdf/docs/netcdf-fortran-install.html

这是nc-config --libs命令的结果：

  -L / usr / local / lib -L ​​/ usr / local -lnetcdf -lhdf5_hl -lhdf5 -ldl -lm -lz 
  

这是nf-config --flibs命令的结果：

  -L / usr / local / lib -lnetcdff -L / usr / local / lib -lnetcdf -lnetcdf -lhdf5_hl -lhdf5 -lz 
  

我用以下命令构建我的项目：

  gfortran地形.f -I / usr / local / include -L / usr / local / lib -lnetcdff -lnetcdf -lhdf5_hl -lhdf5 -lz -lm -ldl 
  

这是什么问题？ p>

编辑：我在配置netcdf C和netcdf fortran时使用--disable-netcdf-4选项，并且可以编译我的代码。因此，这是HDF5的问题。

解决方案

这并不是真正的答案，但是您需要提供更多信息。编写一个基本程序，然后向我们展示代码。然后向我们展示用于尝试编译的命令。

以下是两个示例：

Fortran 77：

  $ cat test_nc.f 
 
程序TEST_NC 
无隐含
包括'netcdf.inc'
整数ncid，nc_err 
 
 nc_err = nf_open（'test.nc'，nf_nowrite，ncid）
 nc_err = nf_close（ncid）
 END程序TEST_NC 
 
 $ gfortran test_nc.f -o test_nc`nf-config --fflags --flibs` 
  

Fortran 90：

  $ cat test_nc.f90 
程序test_nc 
使用netcdf 
隐式无
整数:: ncid，nc_err 
 
 nc_err = nf90_open（'test.nc'，nf90_nowrite，ncid）
 nc_err = nf90_close（ncid） 
最终程序test_nc 
 
 $ gfortran test_nc.f90 -o test_nc`nf-config --fflags --flibs` 
  

这两个文件在我的系统上编译时都没有错误甚至警告。

first of all I've read this topic but I can't compile my code. Compiling Fortran netCDF programs on Ubuntu

I am on UBUNTU 14.04 and compiling a fortran program that uses NetCDF. I have compilation error like this:

terrain.f:(.text+0x17efd): undefined reference to 'ncopn_'
terrain.f:(.text+0x18111): undefined reference to 'ncopn_'
terrain.f:(.text+0x187cc): undefined reference to 'ncclos_'
terrain.f:(.text+0x187ea): undefined reference to 'ncclos_'

Definitely it says I have not netcdf fortran librarries. But I installed zlib, HDF5, netcdf C and netcdf Fortran according these web pages with disable shared and disable dap options.

http://www.unidata.ucar.edu/software/netcdf/docs/build_default.html http://www.unidata.ucar.edu/software/netcdf/docs/netcdf-fortran-install.html

this is result of nc-config --libs command:

-L/usr/local/lib -L/usr/local -lnetcdf -lhdf5_hl -lhdf5 -ldl -lm -lz

this is result of nf-config --flibs command:

-L/usr/local/lib -lnetcdff -L/usr/local/lib -lnetcdf -lnetcdf -lhdf5_hl -lhdf5 -lz

i build my project with this command:

gfortran terrain.f -I/usr/local/include -L/usr/local/lib -lnetcdff -lnetcdf -lhdf5_hl -lhdf5 -lz -lm -ldl

what's wrong with this?

Edit: I use --disable-netcdf-4 option in configuring netcdf C and netcdf fortran and I can compile my code. So it's a problem with HDF5.

解决方案

This isn't really an answer, but you need to produce more info. Write a bare-bones program, and show us the code. Then show us the command you use to try and compile.

Here are two examples:

Fortran 77:

$ cat test_nc.f

      PROGRAM TEST_NC
      IMPLICIT NONE
      include 'netcdf.inc'
      INTEGER ncid, nc_err

      nc_err = nf_open('test.nc', nf_nowrite, ncid)
      nc_err = nf_close(ncid)
      END PROGRAM TEST_NC

$ gfortran test_nc.f -o test_nc `nf-config --fflags --flibs`

Fortran 90:

$ cat test_nc.f90
program test_nc
    use netcdf
    implicit none
    integer :: ncid, nc_err

    nc_err = nf90_open('test.nc', nf90_nowrite, ncid)
    nc_err = nf90_close(ncid)
end program test_nc

$ gfortran test_nc.f90 -o test_nc `nf-config --fflags --flibs`

Both of these compile on my system without errors or even warnings.

这篇关于使用所有可用的库编译Fortran netCDF程序的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！