如何在没有 X11 的服务器上运行 R，并避免依赖关系中断 [英] How to run R on a server without X11, and avoid broken dependencies

问题描述

我在大型 EC2 Ubuntu 实例上运行 R 2.9，加载了 RAM，但没有终端.当我加载具有显示依赖项的库(例如 sqldf 包)时，收到以下错误:

I'm running R 2.9 on a large EC2 Ubuntu instance, loaded with RAM, but without a terminal. When I load a library that has display dependencies, such as the sqldf package, I receive the following error:

library(sqldf)
...
Loading required package: tcltk
Loading Tcl/Tk interface ... Error in fun(...) : couldn't connect to display "localhost:11.0"
Error : .onLoad failed in 'loadNamespace' for 'tcltk'
Error: package 'tcltk' could not be loaded

这似乎是一个普遍的问题，我想知道其他人是如何解决的.安装 X11 服务器不是一个理想的解决方案.

This seems to be a general problem, and I'm wondering how others have solved it. Installing an X11 server is not a desirable solution.

推荐答案

使用虚拟帧缓冲 X11 服务器——我们用同样的方法在无头 chroot 中构建需要 X11 的包.以例如来自 rggobi 的 Build-Depends 部分:

Use the virtual framebuffer X11 server -- we do the same to build packages requiring X11 for R builds in headless chroots. Taking e.g. pars of the Build-Depends from rggobi:

xvfb xauth xfonts-base

xvfb xauth xfonts-base

安装这些后，您可以使用 xvfb-run 命令.如果你通过例如

After installing these you can use the xvfb-run command. If you start R via e.g.

xvfb-run R --no-save

您现在应该能够使用需要 X11 的例程和命令，例如一些绘图设备，或 tcl/tk 初始化也坚持使用 X11.

you should now be able to use routines and commands requiring X11 as e.g. some of the plotting devices, or the tcl/tk initialization which also insists on having X11.

同样的技巧对于网络服务器也很有用.

The same trick is useful for web servers.

这篇关于如何在没有 X11 的服务器上运行 R，并避免依赖关系中断的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！