读取用 Python Paramiko SFTPClient.open 方法打开的文件很慢 [英] Reading file opened with Python Paramiko SFTPClient.open method is slow

问题描述

我正在尝试远程读取 netcdf 文件.
我使用 Paramiko 包来读取我的文件，如下所示:

I am trying to remote read a netcdf file.
I used Paramiko package to read my file, like this:

import paramiko
from netCDF4 import Dataset

client = paramiko.SSHClient()
client.set_missing_host_key_policy(paramiko.AutoAddPolicy())
client.connect(hostname=’hostname’, username=’usrname’, password=’mypassword’)

sftp_client = client.open_sftp()
ncfile = sftp_client.open('mynetCDFfile')
b_ncfile = ncfile.read()    # ****

nc = Dataset('test.nc', memory=b_ncfile)

但是ncfile.read()的运行速度非常慢.

But the run speed of ncfile.read() is VERY SLOW.

所以我的问题是:有没有其他方法可以远程读取 netcdf 文件，或者有什么方法可以加快 paramiko.sftp_file.SFTPFile.read() 的速度?

So my question is: Is there any alternative way to read a netcdf file remotely, or is there any approach to speed up paramiko.sftp_file.SFTPFile.read()?

推荐答案

调用 SFTPFile.prefetch 应该会提高读取速度:

Calling SFTPFile.prefetch should increase the read speed:

ncfile = sftp_client.open('mynetCDFfile')
ncfile.prefetch()
b_ncfile = ncfile.read()

<小时>

另一个选项是使用SFTPClient.open:

---

Another option is enabling read buffering, using bufsize parameter of SFTPClient.open:

ncfile = sftp_client.open('mynetCDFfile', bufsize=32768)
b_ncfile = ncfile.read()

(32768 是 SFTPFile.MAX_REQUEST_SIZE 的值)

同样适用于写入/上传:
写入使用 pysftp open"打开的 SFTP 服务器上的文件方法很慢.

Similarly for writes/uploads:
Writing to a file on SFTP server opened using pysftp "open" method is slow.

另一种选择是明确指定要读取的数据量(它使 BufferedFile.read 采取更高效的代码路径):

Yet another option is to explicitly specify the amount of data to read (it makes BufferedFile.read take a more efficient code path):

ncfile = sftp_client.open('mynetCDFfile')
b_ncfile = ncfile.read(ncfile.stat().st_size)

<小时>

如果这些都不起作用，您可以将整个文件下载到内存中:
使用 pdfplumber 和 Paramiko 从 SFTP 服务器读取 PDF 文件

强制性警告:请勿以这种方式使用 AutoAddPolicy - 您将失去对 MITM 攻击 这样做.如需正确的解决方案，请参阅Paramiko未知服务器".

Obligatory warning: Do not use AutoAddPolicy this way – You are losing a protection against MITM attacks by doing so. For a correct solution, see Paramiko "Unknown Server".

这篇关于读取用 Python Paramiko SFTPClient.open 方法打开的文件很慢的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！