如何保存在闪亮的应用程序中制作的绘图 [英] How to save plots that are made in a shiny app

问题描述

我正在尝试找出如何使用downloadButton保存带有SHINY的绘图。包中的示例演示了downloadButton/downloadHandler保存.csv。在此基础上，我将制作一个可重复使用的示例。

对于ui.R

shinyUI(pageWithSidebar(
  headerPanel('Downloading Data'),
  sidebarPanel(
selectInput("dataset", "Choose a dataset:", 
            choices = c("rock", "pressure", "cars")),
    downloadButton('downloadData', 'Download Data'),
    downloadButton('downloadPlot', 'Download Plot')
  ),
  mainPanel(
    plotOutput('plot')
  )
))

对于server.R

library(ggplot2)
shinyServer(function(input, output) {
  datasetInput <- reactive({
    switch(input$dataset,
           "rock" = rock,
           "pressure" = pressure,
           "cars" = cars)
  })
  
  plotInput <- reactive({
    df <- datasetInput()
    p <-ggplot(df, aes_string(x=names(df)[1], y=names(df)[2])) +
      geom_point()
  })
  
  output$plot <- renderPlot({
    print(plotInput())
  })
  
  output$downloadData <- downloadHandler(
    filename = function() { paste(input$dataset, '.csv', sep='') },
    content = function(file) {
      write.csv(datatasetInput(), file)
    }
  )
  output$downloadPlot <- downloadHandler(
    filename = function() { paste(input$dataset, '.png', sep='') },
    content = function(file) {
      ggsave(file,plotInput())
    }
  )
})

如果您正在回答这个问题，您可能对此很熟悉，但是要使其正常工作，请将上面的脚本(ui.R和server.R)保存到工作目录中的一个文件夹(foo)中。若要运行闪亮的应用程序，请运行runApp("foo")。

使用ggsave时，我得到一条错误消息，指出ggsave不能使用filename函数(我想)。如果我使用标准图形设备(如下所示)，Download Plot可以正常工作，但它不会写入图形。

让downloadHandler编写绘图的任何提示都将不胜感激。

推荐答案

不确定此问题是否仍处于活动状态，但它是搜索"在闪亮的应用程序中保存绘图"时出现的第一个问题，所以我想按照原始问题的思路快速添加如何让ggsave与downloadHandler一起使用。

朱巴建议的使用直接输出而不是ggsave的替代策略和alexwhan自己建议的替代策略都很有效，这只适用于那些绝对想在downloadHandler中使用ggsave的人)。

alexwhan报告的问题是由于ggsave尝试将文件扩展名与正确的图形设备匹配而导致的。但是，临时文件没有扩展名，因此匹配失败。这可以通过在ggsave函数调用中专门设置设备来解决，如原始代码示例中所示(对于PNG)：

output$downloadPlot <- downloadHandler(
    filename = function() { paste(input$dataset, '.png', sep='') },
    content = function(file) {
        device <- function(..., width, height) grDevices::png(..., width = width, height = height, res = 300, units = "in")
        ggsave(file, plot = plotInput(), device = device)
    }
)

这个调用基本上接受ggsave内部赋值的device函数(您可以查看ggsave函数代码来查看jpg、pdf等的语法)。也许在理想情况下，可以将文件扩展名(如果与文件名不同-就像这里临时文件的情况一样)指定为ggsave参数，但此选项当前在ggsave中不可用。

---

一个最小的自包含工作示例：

library(shiny)
library(ggplot2)
runApp(list(
  ui = fluidPage(downloadButton('foo')),
  server = function(input, output) {
    plotInput = function() {
      qplot(speed, dist, data = cars)
    }
    output$foo = downloadHandler(
      filename = 'test.png',
      content = function(file) {
        device <- function(..., width, height) {
          grDevices::png(..., width = width, height = height,
                         res = 300, units = "in")
        }
        ggsave(file, plot = plotInput(), device = device)
      })
  }
))

sessionInfo()
# R version 3.1.1 (2014-07-10)
# Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
# 
# locale:
#  [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
#  [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
#  [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
#  [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                 
#  [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
# [11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       
# 
# attached base packages:
# [1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     
# 
# other attached packages:
# [1] ggplot2_1.0.0 shiny_0.10.1 
# 
# loaded via a namespace (and not attached):
#  [1] bitops_1.0-6     caTools_1.17     colorspace_1.2-4 digest_0.6.4    
#  [5] formatR_1.0      grid_3.1.1       gtable_0.1.2     htmltools_0.2.6 
#  [9] httpuv_1.3.0     labeling_0.2     MASS_7.3-34      munsell_0.4.2   
# [13] plyr_1.8.1       proto_0.3-10     Rcpp_0.11.2      reshape2_1.4    
# [17] RJSONIO_1.3-0    scales_0.2.4     stringr_0.6.2    tools_3.1.1     
# [21] xtable_1.7-3    

更新

从ggplot2版本2.0.0开始，ggsave函数支持device参数的字符输入，这意味着现在可以通过直接调用ggsave来保存由downloadHandler创建的临时文件，方法是指定要使用的扩展名例如为"pdf"(而不是传入设备函数)。这将上面的示例简化为以下

output$downloadPlot <- downloadHandler(
    filename = function() { paste(input$dataset, '.png', sep='') },
    content = function(file) {
        ggsave(file, plot = plotInput(), device = "png")
    }
)

这篇关于如何保存在闪亮的应用程序中制作的绘图的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！