在ggplot2示例中，从素食中绘制或省略号不起作用 [英] Plot ordiellipse from vegan in ggplot2 example not working

问题描述

我正在尝试用椭球体为组在gggraph中绘制一个PCA双图，我在 this thread here。

但是，我不能重现结果。我运行了Didzis Elfer解决方案的两个版本，但df_ell数据帧仍然为空。当我运行最后一个命令时：

ggplot(data = NMDS, aes(MDS1, MDS2)) + geom_point(aes(color = group)) +
geom_path(data=df_ell, aes(x=NMDS1, y=NMDS2,colour=group), size=1, linetype=2)

我收到以下错误：Error in FUN(X[[i]], ...) : object 'NMDS1' not found

因此，该函数似乎不起作用。这是否与最新版本的素食包有关？

感谢所有帮助。

推荐答案

很晚，但我遇到了同样的问题。

检查levels(NMDS$group)是否返回NULL。 将您的分组变量从字符转换为因子确实解决了我的问题。在Didzis Elfer的解中，一个简单的

NMDS$group <- as.factor(NMDS$group)

足以使函数运行。

这篇关于在ggplot2示例中，从素食中绘制或省略号不起作用的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！