基于文件的第一和第二列和第二文件的第三和第四列连接2个文件 [英] join 2 files based on 1st & 2nd column of file AND 3rd & 4th column of second file
本文介绍了基于文件的第一和第二列和第二文件的第三和第四列连接2个文件的处理方法,对大家解决问题具有一定的参考价值,需要的朋友们下面随着小编来一起学习吧!
问题描述
文件1
rs12345 G C
rs78901 A T
文件2
3 22745180 rs12345 G C,G
12 67182999 rs78901 A G,T
所需输出
3 22745180 rs12345 G C
12 67182999 rs78901 A T
我试了
awk 'NR==FNR {h[$1] = $3; next} {print $1,$2,$3,h[$2]}' file1 file2
生成的输出
3 22745180 rs12345
将文件2的前4列和文件1的第3列打印为输出中的第5列
推荐答案
您可以使用awk
:
awk 'FNR == NR {map[$1,$2] = $3; next} ($3,$4) in map {$NF = map[$3,$4]} 1' f1 f2 | column -t
3 22745180 rs12345 G C
12 67182999 rs78901 A T
可读性更强的版本:
awk '
FNR == NR {
map[$1,$2] = $3
next
}
($3,$4) in map {
$NF = map[$3,$4]
}
1' file1 file2 | column -t
仅用于表格输出的column -t
。
这篇关于基于文件的第一和第二列和第二文件的第三和第四列连接2个文件的文章就介绍到这了,希望我们推荐的答案对大家有所帮助,也希望大家多多支持IT屋!
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