读取输入号码和它在一个文件重定向到列 [英] Read an input number and redirect it to a column in a file
问题描述
我有这样的表文件：
我已经做了我的程序返回我的值（最大，最小和平均），从我在寻找基因的线。现在我的目标是相同的，但不是的话，用户将打印列数。自我到只有从一列获得这些值，但
在这里有我的code：
＃！/斌/庆典FICHERO =affy.txt功能选项
{
回声_____________OPTIONS_____________
回声
回声1.选择一个基因和它的测试结果
回声2.选择一列，其测试结果
回声3.退出
}功能基因
{
如果[-eaffy.txt];然后＃硅EL fichero existe ...
回声打印您正在寻找基因的名字：
阅读-p姓名：NAME
OLDIFS = $ IFS
IFS =，;
＃Calcular最大值，最小值Y平均值。
分=`grep的-M1$ NAMEaffy.txt | TR -s'，'''。 | TR -s''的'\\ n'|切-d'-f3- |排序-n |头-1`
最大=`grep的-M1$ NAMEaffy.txt | TR -s''''| TR -s'，''。 |切-d'-f3- | TR -s''的'\\ n'|排序-n |尾-1`
平均=`grep的-M1$ NAMEaffy.txt | TR -s''''| TR -s'，''。 |切-d'-f3- | TR -s''的'\\ n'| AWK'{总和+ = $ 1} END {打印总和/ NR}'` 回声最小值：$分钟
回声最大值：$最大
回声平均值$意思
其他
回声无效的基因的名字！
科幻 回声
}功能栏
{
如果[-e $ FICHERO]。然后
回声打印您正在寻找的列数：
阅读-p姓名：NAME
其他
回声厄尔尼诺fichero没有existe O否contiene入住日期恩拉议程
科幻
}OPC = 0
退出= 5而[$ OPC -ne $退出]
做
明确
选项＃Dibujamos埃尔菜单连接pantalla
阅读-pOpcion：......OPC＃Escogemos拉opcion deseada 如果[$ OPC -ge 1]安培;＆安培; [$ OPC -le 5];然后
明确
在＃Acciones对拉斯维加斯diferentes opciones德尔菜单的情况下$ OPC 1）基因
;; 2）柱
;;
ESAC
其他
回声插入正确的选项！ 科幻
回声preSS任意键......
读
DONE
选项号1正在工作。
我想这样的事情在指定的列的功能，但它不工作...：
功能栏
{
如果[-s $ FICHERO]。然后
回声打印您正在寻找的列数：
阅读-p列：列
因为我在$栏
做
COL + =$ {I＃ - }，
回声：你跟列号工作：$ COL
DONE 其他
回声厄尔尼诺fichero没有existe O否contiene入住日期恩拉议程
科幻 如果[$ COL=];然后
回声插入列，请！
其他
因为我在$关口;
做
回声
回声微量columna =`TR -s'，''。 affy.txt | TR -s''的'\\ n'|切-d''-f$山坳|排序-n |头-1`
回声格言columna$ I=`grep的$ COLaffy.txt | TR -s''''| TR -s'，''。 |切-d''-f$ I|排序-n |尾-1`
回声平均columna$ I=`grep的$ COLaffy.txt | TR -s''''| TR -s'，''。 |切-d''-f$ I| AWK'{总和+ = $ 0} END {打印总和/ NR}'` 转移
DONE
科幻
有一个简单的方法。忘掉整个程序，并只专注于手头的问题。你会如何普遍得到一栏打印？鉴于你的文件。
基因RESULT1 RESULT2 RESULT3
基因1 1 6 9
基因2 2 6 7
基因3 2 4 9
GENE4 1 6 9
目标：获取由位置数的结果值（1，2，3，等等。）。
输入：正整数> = 1，但＆LT; = 3 {X | 1所述; = X＆下; = 3}
输出：一列数字
隐式的真理：第1列（$ 1）是用于标签和它没有返回的列应该永远都头信息。这使得下面的真正公平的竞争环境：
1 6 9
2 6 7
2 4 9
1 6 9
解决方案：
用户输入。
-
你的程序应该做使人们有可能用数字1眼下的第一本节中，$ 1将引用GENE标贴的列。因此，输入的任何值时，加1，这样你总能得到你真正想要的列。因此，零和负号不从用户接受的答复。另外，还有一些只有三个在场上总列。因此，数字3是你的程序应该处理（现在）数量最多的。
-
你应该使用一个命令，将打印所有行考虑的第二件事除了的第一行。头部和尾部的命令有很多选择。
尾-n 4
这是yeilds ...
基因1 1 6 9
基因2 2 6 7
基因3 2 4 9
GENE4 1 6 9
因此，当命令上述通过管道输送到awk的
阅读$ REPLY（2）*＆LT; ----用户输入2 *REPLY = $（（$ REPLY + 1））尾-n 4 | awk的{$打印}答复（其中$ REPLY真的= 3）6
6
4
6
轰！第二列被打印。
我想你的可能的preFER集成这个解决方案到你的程序比这里列出的其他人。
I have a file with a table like this:
I have done that my program returns me the values (max, min and mean) from the line of the gene that I'm looking for. Now my goal is the same, but instead of words, the user will print the number of the column. Ego to obtain these values but only from one column.
Here there is my code:
#!/bin/bash
FICHERO="affy.txt"
function OPTIONS
{
echo "_____________OPTIONS_____________"
echo ""
echo " 1. Select one gene and its test results"
echo " 2. Select one column and its test results"
echo " 3. Exit"
}
function gene
{
if [ -e "affy.txt" ]; then # Si el fichero existe...
echo "Print the name of the gene you are looking for: "
read -p "Name:" NAME
OLDIFS=$IFS
IFS=",";
# Calcular max, min y mean.
min=` grep -m1 "$NAME" affy.txt |tr -s ',' '.' | tr -s ' ' '\n' | cut -d' ' -f3- | sort -n | head -1`
max=` grep -m1 "$NAME" affy.txt | tr -s ' ' ' ' |tr -s ',' '.' | cut -d ' ' -f3- | tr -s ' ' '\n' | sort -n | tail -1`
mean=` grep -m1 "$NAME" affy.txt | tr -s ' ' ' ' |tr -s ',' '.' | cut -d ' ' -f3- | tr -s ' ' '\n' | awk '{sum+=$1} END {print sum/NR}'`
echo "Min value: "$min
echo "Max value: "$max
echo "Mean value: "$mean
else
echo "Invalid gene name!"
fi
echo
}
function column
{
if [ -e $FICHERO ]; then
echo "Print the column number you are looking for: "
read -p "Name: " NAME
else
echo "El fichero no existe o no contiene entradas en la agenda"
fi
}
opc=0
exit=5
while [ $opc -ne $exit ];
do
clear
OPTIONS # Dibujamos el menu en pantalla
read -p "Opcion:..." opc # Escogemos la opcion deseada
if [ $opc -ge 1 ] && [ $opc -le 5 ]; then
clear
case $opc in # Acciones para las diferentes opciones del menu
1)gene
;;
2)column
;;
esac
else
echo "Insert a correct option!!"
fi
echo "Press any key..."
read
done
OPTION NUMBER 1 IS WORKING.
I tried something like this in the function named column, but it doesn't works...:
function column
{
if [ -s $FICHERO ]; then
echo "Print the column number you are looking for: "
read -p "column: " column
for i in "$column"
do
col+="${i#-}"","
echo "You are working with column number:" $col
done
else
echo "El fichero no existe o no contiene entradas en la agenda"
fi
if [ "$col" = "" ]; then
echo "Insert Columns please!"
else
for i in $col;
do
echo
echo minim columna= `tr -s ',' '.' affy.txt | tr -s ' ' '\n' | cut -d' ' -f"$col" | sort -n | head -1`
echo maxim columna "$i"= `grep "$col" affy.txt | tr -s ' ' ' ' |tr -s ',' '.' | cut -d ' ' -f"$i" | sort -n | tail -1`
echo average columna "$i"= `grep "$col" affy.txt | tr -s ' ' ' ' |tr -s ',' '.' | cut -d ' ' -f"$i" | awk '{sum+=$0} END {print sum/NR}'`
shift
done
fi
There is a simpler way. Forget about the entire program and just focus on the problem at hand. How would you generally get a column to print? Given your file.
GENE RESULT1 RESULT2 RESULT3
GENE1 1 6 9
GENE2 2 6 7
GENE3 2 4 9
GENE4 1 6 9
GOAL: Obtain RESULT values by positional number (1, 2, 3, etc..). INPUT: A positive integer >= 1, yet <= 3 {x| 1 <= x <= 3} OUTPUT: A column of numbers.
Implicit truths: Column 1 ($1) is for labels and no returned column should ever have header information in it. That makes the following the real playing field:
1 6 9
2 6 7
2 4 9
1 6 9
Solution:
User input.
The first this section of your program should do make it possible to use the number 1. Right now, $1 would refer to the column of GENE lables. Thus, when any value is entered, add 1 to it so that you always get the column that you really want. Thus, zero and negative numbers are not acceptable replies from the user. Also, there are only three total columns in play. Thus, the number 3 is the largest number your program should handle (right now).
The second thing you should consider is using a command that will print all lines except the first line. The head and tail commands have many options.
tail -n 4
This is yeilds ...
GENE1 1 6 9
GENE2 2 6 7
GENE3 2 4 9
GENE4 1 6 9
Thus, when the a command above is piped to awk
read $REPLY (2) *<----User inputs 2*
REPLY=$(($REPLY + 1))
tail -n 4 | awk "{print $REPLY}" (where $REPLY really = 3)
6
6
4
6
Boom! The second column is printed. I think you may prefer integrating this solution into your program than others listed here.
这篇关于读取输入号码和它在一个文件重定向到列的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！
