ZLIB的编译问题 [英] Compilation problems with ZLIB

问题描述

我想编译一些第三方软件，但是我遇到了ZLIB的问题。

如下：

  $ sudo make 
 gcc -Wall -pedantic -DVERSION = 1.2 -lz -O3 sliding.o trim_single.o trim_paired.o sickle.o -o sickle 
 trim_paired.o：在函数`ks_getuntil'中：
 trim_paired.c： .text + 0x78）：未定义对`gzread'的引用
 trim_paired.o：在函数`kseq_read'中：
 trim_paired.c :( .text + 0x48d）：未定义`gzread'引用
 trim_paired.c :(。text + 0x4dc）：未定义的引用`gzread'
 trim_paired.c :(。+ 0x60a）：未定义的引用`gzread'
 trim_paired.c :(。 + 0x687）：未定义的引用`gzread'
 trim_paired.o：在函数`paired_main'中：
 trim_paired.c :(。text + 0xc62）：未定义的`gzopen'引用
 trim_paired .c :(。text + 0xc83）：未定义的`gzopen'引用
 trim_paired.c :(。+ 0x1142）：未定义的`gzclose`引用
 trim_paired.c :(。 ）：undefined reference to'gzclose'
 trim_single.o：在函数`ks_getuntil'中：
 trim_single.c :(。text + 0x78）：未定义的引用`gzread'
 trim_single.o ：在函数`single_main'：
 trim_single.c :(。text + 0x688）：未定义的引用`gzopen'
 trim_single.c :(。text + 0x8ad）：未定义的引用`gzread'
 trim_single.c :(。text + 0x8f5）：未定义的引用`gzread'
 trim_single.c :(。text + 0xb11）：未定义引用`gzread'
 trim_single.c :( .text + 0xb96）：未定义的引用`gzread'
 trim_single.c :(。text + 0xc58）：未定义的`gzclose'引用
 collect2：ld返回1退出状态
 make： *** [build]错误1 
  

我使用Ubuntu和我安装ZLIB 1.2.6 / usr / local / lib

这里是Makefile：

  PROGRAM_NAME = sickle 
 VERSION = 1.2 
 CC = gcc 
 CFLAGS = -Wall -pedantic -DVERSION = $（VERSION）
 DEBUG = -g 
 OPT = -O3 
 ARCHIVE = $（PROGRAM_NAME）_ $（VERSION）
 LDFLAGS = -lz 
 SDIR = src 
 
 .PHONY：clean default build distclean dist debug 
 
默认值：build 
 
 sliding.o：$（SDIR）/sliding.c $（SDIR）/kseq.h $（SDIR）/sickle.h 
 $ CC）$（CFLAGS）$（OPT）-c $（SDIR）/ $ *。c 
 
 trim_single.o：$（SDIR）/trim_single.c $（SDIR）/sickle.h $ （SDIR）/kseq.h 
 $（CC）$（CFLAGS）$（OPT）-c $（SDIR）/ $ *。c 
 
 trim_paired.o：$ /trim_paired.c $（SDIR）/sickle.h $（SDIR）/kseq.h 
 $（CC）$（CFLAGS）$（OPT）-c $（SDIR）/ $ *。c 
 
 sickle.o：$（SDIR）/sickle.c $（SDIR）/sickle.h 
 $（CC）$（CFLAGS）$（OPT）-c $（SDIR）/ $ * .c 
 
 clean：
 rm -rf * .o $（SDIR）/ *。gch ./sickle 
 
 distclean：clean 
 rm  - rf * .tar.gz 
 
 dist：
 tar -zcf $（ARCHIVE）.tar.gz src Makefile 
 
 build：sliding.o trim_single.o trim_paired .o sickle.o 
 $（CC）$（CFLAGS）$（LDFLAGS）$（OPT）$？ -o sickle 
 
 debug：
 $（MAKE）buildCFLAGS = -Wall -pedantic -g -DDEBUG
  
  
 
 
 
 < >解决方案
我自己找到答案！ 
它的工作原理是改变：
  $（CC）$（CFLAGS）$（LDFLAGS）$（OPT）$ ？ -o sickle 
  
到
  $（CC）$（CFLAGS）$（OPT）$？ -o sickle $（LDFLAGS）
  
 -lz选项必须在结尾。
 
I would like to compile some third-party software but I encounter a problem with ZLIB apparently. 

See below:
 $sudo make
    gcc -Wall -pedantic -DVERSION=1.2 -lz -O3 sliding.o trim_single.o trim_paired.o sickle.o -o sickle
    trim_paired.o: In function `ks_getuntil':
    trim_paired.c:(.text+0x78): undefined reference to `gzread'
    trim_paired.o: In function `kseq_read':
    trim_paired.c:(.text+0x48d): undefined reference to `gzread'
    trim_paired.c:(.text+0x4dc): undefined reference to `gzread'
    trim_paired.c:(.text+0x60a): undefined reference to `gzread'
    trim_paired.c:(.text+0x687): undefined reference to `gzread'
    trim_paired.o: In function `paired_main':
    trim_paired.c:(.text+0xc62): undefined reference to `gzopen'
    trim_paired.c:(.text+0xc83): undefined reference to `gzopen'
    trim_paired.c:(.text+0x1142): undefined reference to `gzclose'
    trim_paired.c:(.text+0x114f): undefined reference to `gzclose'
    trim_single.o: In function `ks_getuntil':
    trim_single.c:(.text+0x78): undefined reference to `gzread'
    trim_single.o: In function `single_main':
    trim_single.c:(.text+0x688): undefined reference to `gzopen'
    trim_single.c:(.text+0x8ad): undefined reference to `gzread'
    trim_single.c:(.text+0x8f5): undefined reference to `gzread'
    trim_single.c:(.text+0xb11): undefined reference to `gzread'
    trim_single.c:(.text+0xb96): undefined reference to `gzread'
    trim_single.c:(.text+0xc58): undefined reference to `gzclose'
    collect2: ld returned 1 exit status
    make: *** [build] Error 1
I am using Ubuntu and I did install ZLIB 1.2.6 in /usr/local/lib 

Here is the Makefile:
PROGRAM_NAME = sickle
VERSION = 1.2
CC = gcc
CFLAGS = -Wall -pedantic -DVERSION=$(VERSION)
DEBUG = -g
OPT = -O3
ARCHIVE = $(PROGRAM_NAME)_$(VERSION)
LDFLAGS = -lz
SDIR = src

.PHONY: clean default build distclean dist debug

default: build

sliding.o: $(SDIR)/sliding.c $(SDIR)/kseq.h $(SDIR)/sickle.h
    $(CC) $(CFLAGS) $(OPT) -c $(SDIR)/$*.c

trim_single.o: $(SDIR)/trim_single.c $(SDIR)/sickle.h $(SDIR)/kseq.h
    $(CC) $(CFLAGS) $(OPT) -c $(SDIR)/$*.c

trim_paired.o: $(SDIR)/trim_paired.c $(SDIR)/sickle.h $(SDIR)/kseq.h
    $(CC) $(CFLAGS) $(OPT) -c $(SDIR)/$*.c

sickle.o: $(SDIR)/sickle.c $(SDIR)/sickle.h
    $(CC) $(CFLAGS) $(OPT) -c $(SDIR)/$*.c

clean:
    rm -rf *.o $(SDIR)/*.gch ./sickle

distclean: clean
    rm -rf *.tar.gz

dist:
    tar -zcf $(ARCHIVE).tar.gz src Makefile

build: sliding.o trim_single.o trim_paired.o sickle.o
    $(CC) $(CFLAGS) $(LDFLAGS) $(OPT) $? -o sickle

debug:
    $(MAKE) build "CFLAGS=-Wall -pedantic -g -DDEBUG"
Any help is appreciated ;)

Thanks
解决方案
I found the answer myself !
It works by changing:
$(CC) $(CFLAGS) $(LDFLAGS) $(OPT) $? -o sickle
to 
$(CC) $(CFLAGS)  $(OPT) $? -o sickle $(LDFLAGS)
the -lz option has to be at the end.

                        
这篇关于ZLIB的编译问题的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！