匹配不同数据帧上的多个列，并获得其他列作为结果 [英] Matching multiple columns on different data frames and getting other column as result

问题描述

我有两个大数据框，一个（ df1 ）有这样的结构

  chr init 
 1 12 25289552 
 2 3 180418785 
 3 3 180434779 
  

另一个（ df2 ）有这个

  V1 V2 V3 
 10 1 69094 medium 
 11 1 69094 medium 
 12 12 25289552 high 
 13 1 69095 medium 
 14 3 180418785 medium 
 15 3 180434779低
  

我要做的是添加列 V3 df2 到 df1 ，以获取变化的信息

  chr init Mut 
 1 12 25289552 high 
 2 3 180418785 medium 
 3 3 180434779 low 
  

我正在尝试将R加载到R中，然后使用match进行for循环，但不起作用。你有什么特别的做法吗？我也可以使用awk或类似的东西。

解决方案

使用 merge

  df1<  -  read.table（text ='chr init 
 1 12 25289552 
 2 3 180418785 
 3 3 180434779'，header = TRUE）
 
 
 df2<  -  read.table（text ='V1 V2 V3 
 10 1 69094 medium 
 11 1 69094 medium 
 12 12 25289552 high 
 13 1 69095 medium 
 14 3 180418785 medium 
 15 3 180434779 low'，header = TRUE）
 
 
 merge（df1，df2，by.x ='init'，by.y ='V2'）＃这个工程！ 
 init chr V1 V3 
 1 25289552 12 12高
 2 180418785 3 3中等
 3 180434779 3 3低
  

以您的方式显示您想要的输出

 输出< ;  -  merge（df1，df2，by.x ='init'，by.y ='V2'）[，c（2,1,4）] 
 colnames（output）[3]< Mut'
输出
 chr init Mut 
 1 12 25289552 high 
 2 3 180418785 medium 
 3 3 180434779 low 
  / pre> 
I got two big data frames, one (df1) has this structure
   chr    init
1  12  25289552
2   3 180418785
3   3 180434779
The other (df2) has this
    V1    V2     V3
10  1     69094 medium
11  1     69094 medium
12  12 25289552 high
13  1     69095 medium
14  3 180418785 medium
15  3 180434779 low
What I'm trying to do is to add the column V3 of df2 to df1, to get the info of the mutation
   chr    init  Mut
1  12  25289552 high
2   3 180418785 medium
3   3 180434779 low
I'm trying loading both into R and then doing a for loop using match but it doesn't work. Do you know any special way to do this? I am also open to do using awk or something similar
解决方案
Use merge
df1 <- read.table(text='  chr    init
1  12  25289552
2   3 180418785
3   3 180434779', header=TRUE)


df2 <- read.table(text='    V1    V2     V3
10  1     69094 medium
11  1     69094 medium
12  12 25289552 high
13  1     69095 medium
14  3 180418785 medium
15  3 180434779 low', header=TRUE)


merge(df1, df2, by.x='init', by.y='V2') # this works!
       init chr V1     V3
1  25289552  12 12   high
2 180418785   3  3 medium
3 180434779   3  3    low
To get your desired output the way you show it 
output <- merge(df1, df2, by.x='init', by.y='V2')[, c(2,1,4)]
colnames(output)[3] <- 'Mut' 
output
  chr      init    Mut
1  12  25289552   high
2   3 180418785 medium
3   3 180434779    low


                        
这篇关于匹配不同数据帧上的多个列，并获得其他列作为结果的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！