python - 基因组中寻找特定要求序列，求一个计算速度快的方法

问题描述

问 题

已知的基因组序列是由ACGT四个字母组成的一大串字符如ATCGCTCGCTCGAGCAGTCAGTCA......,求所有在500bp(即500个字母)内所有的出现了3次的连续9bp(即9个字母)的类型,在多个500bp窗口出现的重复的只记为一个。!

解决方案

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