ggplot2图中的主题元素 [英] Theme elements in ggplot2 figure

问题描述

我试图调整ggplot2图中的几个主题元素。我对此多层数字的三个问题/目标是（数据代码如下）：
$ b $ ol <

创建一个x轴刻度标记所有八年的标签，即2004 - 2011年。虽然我不想要'xlab'。

从感染的茎图例中删除两个填充点b / c这些geom_bars不应该有与它们相关的点。

将线条/点图例的图例标题更改为SOD-dead Stems。 $ b

我的代码对许多人来说可能是多余的，所以随时随地提供建议，例如只有一个图例。我是ggplot的新手（喜欢它），但迄今为止在音阶方面遇到了麻烦...... b
$ b

---

我的代码FOR FIGURE：

  #####建立数据框：
 quag.infect = c（31，52， 58,74,76,85,99,102）
 quke.infect = c（10，13，17，20，23，27，28，27）
 qusp.hosts =（rep（c （QUAG，QUKE），每个= 8））
 year = rep（2004：2011,2）
 quag.dead = c（NA，4，11，19，33，38 ，48，49）
 quke.dead = c（NA，1，1，2，3，7，8）
 
 my.df = data.frame（Species = qusp .hosts，Year = year，
 Inf.ct = c（quag.infect，quke.infect），Sod.Dead = c（quag.dead，quke.dead））
 
＃ ####为条形建立灰色：
 grays = c（QUAG =gray50，QUKE =gray66）
 
 #####制作多层图形：
 library（ggplot2）
 plot_x = ggplot（my.df，aes（Year，Inf.ct，fill = Species））+ 
 geom_bar（stat =identity，position =dodge ）+ 
 ylab（表达式（茎数（dbh> =1-cm），sep =））+ 
 xlab（）+ 
 scale_fill_手册（值=灰色，感染茎，标签= c（黑橡树，海岸活橡树））+ 
 geom_line（aes（y = Sod.Dead，linetype = Species））+ 
 geom_point（aes（y = Sod.Dead，shape = Species））
 plot_x 
  

---

谢谢，
Sarah

解决方案

。

对于第1点：代替 xlab ，使用 scale_x_continuous ，设置中断，然后指定一个空标题。

对于第二点：移动<$ c将全局 aes 函数中的$ c> fill = Species 转换为 aes 函数 geom_bar 。

对于第3点：在 scale_shape 和 scale_linetype 函数，确保同一个标题进入这两个函数。

对代码进行这些更改对于ggplot：

pre $ plot_x = ggplot（my.df，aes（Year，Inf.ct））+
geom_bar（aes（fill =物种），stat =identity，position =dodge）+
ylab（表达式（茎的数量（dbh> =1-cm），sep = ））+
scale_x_continuous（，breaks = seq（2004,2011,1））+
scale_fill_manual（values = grey，Infected Stems，labels = c（Black Oak海岸活橡树））+
geom_line（aes（y = Sod.Dead，linetype = Species））+
geom_point（aes（y = Sod.Dead，shape = Species））+
scale_shape（SOD-dead Stems）+
scale_linetype（SOD-dead Stems）
plot_x


给出以下图表：

I am trying to tweak a few thematic elements in a ggplot2 figure. My three questions/goals for this multi-layered figure are (code for data follows at end):

1. Create a x-axis tick mark label for all eight year, i.e., 2004-2011. I do not want a 'xlab' though.
2. Remove the two filled dots from the "Infected Stems" legend b/c these "geom_bars" should not have dots associated with them (???).
3. Change the Legend Title for the lines/points legend to "SOD-dead Stems".

My code is probably redundant to many of you, so feel free to provide suggestions anywhere, such as having only a single legend. I am new to ggplot (like it) but have trouble with "scales" thus far....

---

MY CODE FOR FIGURE:

##### BUILD UP DATAFRAME:
quag.infect= c(31, 52, 58, 74, 76, 85, 99, 102)
quke.infect= c(10, 13, 17, 20, 23, 27, 28, 27)
qusp.hosts = (rep(c("QUAG", "QUKE"), each=8))
year = rep(2004:2011, 2)
quag.dead = c(NA, 4,  11, 19, 33, 38, 48, 49)
quke.dead = c(NA,  1,  1,  1,  2,  3,  7,  8)

my.df = data.frame(Species=qusp.hosts, Year=year, 
Inf.ct = c(quag.infect, quke.infect), Sod.Dead=c(quag.dead, quke.dead))

##### Establish grey colors for bars:
grays = c(QUAG="gray50", QUKE="gray66")

##### Make multi-layered graphic:
library(ggplot2)
plot_x = ggplot(my.df, aes(Year, Inf.ct, fill=Species)) +
  geom_bar(stat="identity", position="dodge") +
  ylab(expression("Number of stems (dbh">="1-cm)", sep="")) +
  xlab("") +          
  scale_fill_manual(values=grays, "Infected Stems", labels = c("Black Oak", "Coast Live           Oak")) +
  geom_line(aes(y=Sod.Dead, linetype=Species)) +
  geom_point(aes(y=Sod.Dead, shape=Species)) 
plot_x 

---

Thanks, Sarah

解决方案

You're not far off.

For point 1: In place of xlab, use scale_x_continuous, setting the breaks, and specifying an empty title.

For point 2: Move fill = Species out of the global aes function into an aes function for geom_bar.

For point 3: Change the legend title within scale_shape and scale_linetype functions, making sure the same title goes into both.

Making these changes to the code for ggplot:

plot_x = ggplot(my.df, aes(Year, Inf.ct)) +
  geom_bar(aes(fill=Species), stat="identity", position="dodge") +
  ylab(expression("Number of stems (dbh">="1-cm)", sep="")) +
  scale_x_continuous("", breaks = seq(2004, 2011, 1)) +
  scale_fill_manual(values=grays, "Infected Stems", labels = c("Black Oak", "Coast Live Oak")) +
  geom_line(aes(y=Sod.Dead, linetype=Species)) +
  geom_point(aes(y=Sod.Dead, shape=Species)) +
  scale_shape("SOD-dead Stems") +
  scale_linetype("SOD-dead Stems")
plot_x 

gives the following plot:

这篇关于ggplot2图中的主题元素的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！