Hadoop溢出失败 [英] Hadoop Spill failure

问题描述

我目前正在使用Hadoop 0.21.0,985326和一个由6个工作节点和一个头节点构成的项目。
提交常规mapreduce作业失败，但我不知道为什么。

  org.apache.hadoop.mapred.Child：运行child的异常：java.io.IOException ：溢出失败
在org.apache.hadoop.mapred.MapTask $ MapOutputBuffer.checkSpillException（MapTask.java:1379）
 at org.apache.hadoop.mapred.MapTask $ MapOutputBuffer.access $ 200（MapTask。 java：711）
 at org.apache.hadoop.mapred.MapTask $ MapOutputBuffer $ Buffer.write（MapTask.java:1193）
 at java.io.DataOutputStream.write（DataOutputStream.java:90） 
 at org.apache.hadoop.io.Text.write（Text.java:290）
 at org.apache.hadoop.io.serializer.WritableSerialization $ WritableSerializer.serialize（WritableSerialization.java:100） 
 at org.apache.hadoop.io.serializer.WritableSerialization $ WritableSerializer.serialize（WritableSerialization.java:84）
 at org.apache.hadoop.mapred.MapTask $ MapOutputBuffer.collect（MapTask.java： 967）
在org.apache.hadoop.mapred.MapTask $ NewOutputCollector.write（MapTask.java:583）
 at org.apache.hadoop.mapreduce.task.TaskInputOutputContextImpl.write（TaskInputOutputContextImpl.java:92）
 at org.apache.hadoop.mapreduce.lib.map.WrappedMapper $ Context.write（WrappedMapper.java： 111）
，位于be.ac.ua.comp.ronny.riki.invertedindex.FilteredInvertedIndexBuilder $ Map.map（FilteredInvertedIndexBuilder.java:113）
位于be.ac.ua.comp.ronny.riki。 invertedindex.FilteredInvertedIndexBuilder $ Map.map（FilteredInvertedIndexBuilder.java:1）
 at org.apache.hadoop.mapreduce.Mapper.run（Mapper.java:144）
 at org.apache.hadoop.mapred。 MapTask.runNewMapper（MapTask.java:652）
在org.apache.hadoop.mapred.MapTask.run（MapTask.java:328）
在org.apache.hadoop.mapred.Child $ 4.run （Child.java:217）
 at java.security.AccessController.doPrivileged（Native Method）
 at javax.security.auth.Subject.doAs（Subject.java:396）
 at org .apache.hadoop.security.UserGroupInformation.doAs（UserGroupInformation.java:742）
在org.apache.hadoop。 mapred.Child.main（Child.java:211）
导致：java.lang.RuntimeException：java.lang.NoSuchMethodException：org.apache.hadoop.io.ArrayWritable。< init>（）
在org.apache.hadoop.util.ReflectionUtils.newInstance（ReflectionUtils.java:123）
在org.apache.hadoop.io.serializer.WritableSerialization $ WritableDeserializer.deserialize（WritableSerialization.java:68）
 org.apache.hadoop.mapreduce.task.ReduceContextImpl.nextKeyValue（ReduceContextImpl.java:145）
 $ b at org.apache.hadoop.mapreduce.task.ReduceContextImpl.nextKey（ReduceContextImpl.java:121）
 at org.apache.hadoop.mapreduce.lib.reduce.WrappedReducer $ Context.nextKey（WrappedReducer.java ：291）
 at org.apache.hadoop.mapreduce.Reducer.run（Reducer.java:168）
 at org.apache.hadoop.mapred.Task $ NewCombinerRunner.combine（Task.java:1432 ）在org.apache.had处
 oop.mapred.MapTask $ MapOutputBuffer.sortAndSpill（MapTask.java:1457）
 at org.apache.hadoop.mapred.MapTask $ MapOutputBuffer.access $ 600（MapTask.java:711）
 at org.apache .hadoop.mapred.MapTask $ MapOutputBuffer $ SpillThread.run（MapTask.java:1349）
导致：java.lang.NoSuchMethodException：org.apache.hadoop.io.ArrayWritable。< init>（）
 at java.lang.Class.getConstructor0（Class.java:2706）
 at java.lang.Class.getDeclaredConstructor（Class.java:1985）
 at org.apache.hadoop.util.ReflectionUtils .newInstance（ReflectionUtils.java:117）
 ... 10 more 
  

目前，我正在试验一些希望这个错误消失的配置参数，但直到现在这还没有成功。
我正在调整的配置参数是：
$ b

• mapred.map.tasks = 60


• mapred.reduce.tasks = 12


• Job.MAP_OUTPUT_COMPRESS（或mapreduce.map.output.compress）= true


• Job.IO_SORT_FACTOR （或mapreduce.task.io.sort.factor）= 10


• Job.IO_SORT_MB（或mapreduce.task.io.sort.mb）= 256


• Job.MAP_JAVA_OPTS（或mapreduce.map.java.opts）=-Xmx256或-Xmx512
  
• Job.REDUCE_JAVA_OPTS（或mapreduce.reduce.java.opts） =-Xmx256或-Xmx512
  

任何人都可以解释为什么发生上述异常吗？以及如何避免它？或者只是一个简短的解释，说明hadoop spill操作意味着什么？ 解决方案

好的，所有问题都解决了。

Map-Reduce序列化操作需要为 org.apache.hadoop.io.ArrayWritable 创建默认构造函数。

Hadoops实现没有为ArrayWritable提供默认构造函数。

这就是为什么抛出java.lang.NoSuchMethodException：org.apache.hadoop.io.ArrayWritable。（）并导致奇怪的溢出异常。

一个简单的包装器使得ArrayWritable真正可写并修复它！奇怪的是，Hadoop没有提供这个。

I'am currently working on a project using Hadoop 0.21.0, 985326 and a cluster of 6 worker nodes and a head node. Submitting a regular mapreduce job fails, but I have no idea why. Has anybody seen this exception before?

org.apache.hadoop.mapred.Child: Exception running child : java.io.IOException: Spill failed
    at org.apache.hadoop.mapred.MapTask$MapOutputBuffer.checkSpillException(MapTask.java:1379)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapTask$MapOutputBuffer.access$200(MapTask.java:711)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapTask$MapOutputBuffer$Buffer.write(MapTask.java:1193)
    at java.io.DataOutputStream.write(DataOutputStream.java:90)
    at org.apache.hadoop.io.Text.write(Text.java:290)
    at org.apache.hadoop.io.serializer.WritableSerialization$WritableSerializer.serialize(WritableSerialization.java:100)
    at org.apache.hadoop.io.serializer.WritableSerialization$WritableSerializer.serialize(WritableSerialization.java:84)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapTask$MapOutputBuffer.collect(MapTask.java:967)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapTask$NewOutputCollector.write(MapTask.java:583)
    at org.apache.hadoop.mapreduce.task.TaskInputOutputContextImpl.write(TaskInputOutputContextImpl.java:92)
    at org.apache.hadoop.mapreduce.lib.map.WrappedMapper$Context.write(WrappedMapper.java:111)
    at be.ac.ua.comp.ronny.riki.invertedindex.FilteredInvertedIndexBuilder$Map.map(FilteredInvertedIndexBuilder.java:113)
    at be.ac.ua.comp.ronny.riki.invertedindex.FilteredInvertedIndexBuilder$Map.map(FilteredInvertedIndexBuilder.java:1)
    at org.apache.hadoop.mapreduce.Mapper.run(Mapper.java:144)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapTask.runNewMapper(MapTask.java:652)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapTask.run(MapTask.java:328)
    at org.apache.hadoop.mapred.Child$4.run(Child.java:217)
    at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)
    at javax.security.auth.Subject.doAs(Subject.java:396)
    at org.apache.hadoop.security.UserGroupInformation.doAs(UserGroupInformation.java:742)
    at org.apache.hadoop.mapred.Child.main(Child.java:211)
Caused by: java.lang.RuntimeException: java.lang.NoSuchMethodException: org.apache.hadoop.io.ArrayWritable.<init>()
    at org.apache.hadoop.util.ReflectionUtils.newInstance(ReflectionUtils.java:123)
    at org.apache.hadoop.io.serializer.WritableSerialization$WritableDeserializer.deserialize(WritableSerialization.java:68)
    at org.apache.hadoop.io.serializer.WritableSerialization$WritableDeserializer.deserialize(WritableSerialization.java:44)
    at org.apache.hadoop.mapreduce.task.ReduceContextImpl.nextKeyValue(ReduceContextImpl.java:145)
    at org.apache.hadoop.mapreduce.task.ReduceContextImpl.nextKey(ReduceContextImpl.java:121)
    at org.apache.hadoop.mapreduce.lib.reduce.WrappedReducer$Context.nextKey(WrappedReducer.java:291)
    at org.apache.hadoop.mapreduce.Reducer.run(Reducer.java:168)
    at org.apache.hadoop.mapred.Task$NewCombinerRunner.combine(Task.java:1432)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapTask$MapOutputBuffer.sortAndSpill(MapTask.java:1457)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapTask$MapOutputBuffer.access$600(MapTask.java:711)
    at org.apache.hadoop.mapred.MapTask$MapOutputBuffer$SpillThread.run(MapTask.java:1349)
Caused by: java.lang.NoSuchMethodException: org.apache.hadoop.io.ArrayWritable.<init>()
    at java.lang.Class.getConstructor0(Class.java:2706)
    at java.lang.Class.getDeclaredConstructor(Class.java:1985)
    at org.apache.hadoop.util.ReflectionUtils.newInstance(ReflectionUtils.java:117)
    ... 10 more

Currently, I'm experimenting with some configuration parameters hoping that this error disappears, but until now this was unsuccessful. The configuration parameters I'm tweaking are:

• mapred.map.tasks = 60
• mapred.reduce.tasks = 12
• Job.MAP_OUTPUT_COMPRESS (or mapreduce.map.output.compress) = true
• Job.IO_SORT_FACTOR (or mapreduce.task.io.sort.factor) = 10
• Job.IO_SORT_MB (or mapreduce.task.io.sort.mb) = 256
• Job.MAP_JAVA_OPTS (or mapreduce.map.java.opts) = "-Xmx256" or "-Xmx512"
• Job.REDUCE_JAVA_OPTS (or mapreduce.reduce.java.opts) = "-Xmx256" or "-Xmx512"

Can anybody explain why the exception above occurs? And how to avoid it? Or just a short explanation what the hadoop spill operation implies?

解决方案

Ok, all problems are solved.

The Map-Reduce serialization operation needs intern a default constructor for org.apache.hadoop.io.ArrayWritable.
Hadoops implementation didn't provide a default constructor for ArrayWritable.
That's why the java.lang.NoSuchMethodException: org.apache.hadoop.io.ArrayWritable.() was thrown and caused the weird spill exception.

A simple wrapper made ArrayWritable really writable and fixed it! Strange that Hadoop did not provide this.

这篇关于Hadoop溢出失败的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！