由数据帧中的二进制和字符变量创建双模网络
SNA人员：我正在尝试从R中的数据框创建一个双模式网络。我有一个组织列表，这些组织通过父组织中的共同成员资格进行连接。我在该组织中的成员身份编码为二进制变量。我已经通过以下代码(来自Create adjacency matrix based on binary variable)成功地基于这些数据创建了一个Social Matrix和后续的网络对象： library(statnet) org
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快速汇总R中大图中相邻属性的方法
我有一个大的图形对象，几乎有1M个节点和1.5M个边。在研究了一段时间后，我找不到一个程序来对节点的邻居属性进行求和，在本例中，它是一个二进制属性。目前，我找到的最佳解决方案如下： V(g)$sum = sapply( ego(g,1,V(g),mode = 'all',mindist = 1), function(v) sum(V(G)[v]$attr) ) 然而，12小时后，它仍然发
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下标越界——一般定义和解决方案?
在使用 R 时，我经常收到错误消息“下标越界".例如: # 加载必要的库和数据图书馆(igraph)图书馆(网络数据)数据(kracknets，包=“NetData")# 减少数据集到非零边krack_full_nonzero_edges 0 |friendship_tie > 0 | reports_t
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在igraph中为社区分配颜色
我正在igraph中使用fastgreedy.community检测算法在R中生成社区.该代码返回了12个社区，但是在绘制时很难识别它们，因为它返回的颜色数量有限.如何绘制十二种不同颜色的图形? l2
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保留原始权重的加权双峰二部图投影
我有一个大的(36k顶点，50k边)加权双峰二部图，我想生成一个投影，不仅像默认的加权实现那样对邻居进行计数，而且还要对边上的权重求和.您可以将其视为包含黑色顶点和蓝色顶点的二部图，在只有蓝色顶点的情况下，我想保留原始图的权重. https://networkx.github.io/documentation/latest/reference/generation/networkx.algo
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如何在igraph中为Louvain模块化设置分辨率参数?
当使用函数 cluster_louvain 检测 igraph 中R的社区时，是否可以设置分辨率参数?由于此参数与节点之间的层次结构差异有关，因此其结果差异很大.谢谢. 解决方案 最简单的方法是通过resolution包(在此链接中可用)它基于本文 http://arxiv.org/pdf/0812.1770.pdf 它几乎具有2个功能cluster_resolution()和clu
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使用文件名将R中for循环的每次迭代结果保存为网络对象
我正在尝试运行一个循环，以循环访问保存为.csv文件的多个邻接列表，将它们转换为边缘列表和网络对象，并使用文件名保存每个邻接列表. 问题是:a)代码似乎在文件名列表中循环，但没有产生任何输出b)它不会使用文件名保存网络对象(似乎每次都覆盖). 请注意，该代码对于用"filename.csv"标识的单个文件代替for循环中的"f"可以正常工作. l.files
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R-顶点属性-'在set.vertex.attribute中给定的不适当的值.
我有一个data.frame，其中包含要用作网络文件中属性的值. 当我尝试手动将值分配为属性时，它们一半有效，但另一半则显示此错误.我仔细查看了数据，但看不到任何内在原因. 格式化矢量输入(此功能有效) visitgo2n%v%"hhid"
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如何有效地从访问位置列表中构造边缘列表?
我的原始data.table由三列组成. site，observation_number和id. 例如以下是对id = z的所有观察 |site|observation_number|id |a | 1| z |b | 2| z |c | 3|
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如何在R中使用sna软件包打开.net文件?
我有很多.net文件，并且软件包教程说可以在sna上使用这种格式. 我的错误消息是: > Error in FUN(X[[1L]], ...) : as.edgelist.sna input must be an > adjacency matrix/array, edgelist matrix, network, or sparse matrix, or > list ther
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在R中将数据帧转换为隶属网络
我有一个具有以下格式的数据框: name workplace a A b B c A d C e D .... 我想将此数据帧转换为R格式的联属网络 A B C D ... a 1 0 0 0 b 0 1 0 0 c 1 0 0 0 d 0 0 1 0 e 0 0 0 1 ... 我使用了以下程序: fo
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两个顶点之间的图形边缘
我是R和igraph的新手，我想知道是否有人可以帮助我进行以下工作? 我想找到图中两个顶点之间的边缘权重.我的图结构由正常的自我(node1)，alter(node2)以及它们之间边缘的权重定义. 我知道我可以使用 E(igraph_friendship)[from(5)] $ weight 获得来自节点编号5的边列表中每个边的权重. 而且我可以使用 E(igraph_friendsh
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从ID和分组向量生成边缘列表
我有一个205,000+行的数据框，其格式如下: df
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在python中将边列表导入igraph的格式
igraph导入到python中的边列表格式是什么?包含我的加权边缘的文本文件应该是什么样? 我以前将igraph与R一起使用，但是在需要使用的计算机上没有可正常工作的R安装---因此我陷入了python. 我有一个egelist.txt这样的内容: 123123, 321321, 1 222222, 333333, 2 123123, 333333, 3 222222, 321
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如何从边缘列表创建加权邻接表/矩阵?
我的问题很简单:我需要从边列表创建邻接列表/矩阵. 我将一个边缘列表存储在csv文档中，其中column1 = node1，column2 = node2，我想将其转换为加权邻接列表或加权邻接矩阵. 更准确地说，这是数据的样子-其中数字只是节点ID: node1,node2 551,548 510,512 548,553 505,504 510,512 552,543 512,5
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如何使用igraph或tnet在R中创建双向网络
我有一个用于两种模式的网络的边缘列表，类似于此: person Event Amy football_game Sam picnic Bob art_show 我想在R中对此进行分析，但是似乎我尝试的所有操作都失败了.将其转换为单模网络会遇到内存限制，而且我不知道如何在igraph或tnet中将其分析为二分法. 在igraph中，对于使用 创建的igra
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如何在r/python中获取三合会的详细信息?
我目前正在使用igraph使用triad_census(g)来获取给定有向图的traid普查.这将返回16个类别中每个类别的三合会计数. 例如16 3 0 10 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 但是，除了这些摘要统计信息，我想了解更多有关三合会的细节. 即假设网络有16个003，它们是什么?假设网络有3个012，它们是什么? 示例:012的3个traid是(
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如何在python中使用networkx在无向图中进行三合会普查
我有一个如下所示的无向networkx图，我想打印该图的triad census.但是，nx.triadic_census(G)不支持无向图. import networkx as nx G = nx.Graph() G.add_edges_from( [('A', 'B'), ('A', 'C'), ('D', 'B'), ('E', 'C'), ('E', 'F'),
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Python 2.7 NetworkX(使其具有交互性)
我是NetworkX的新手.现在，我设法将所有节点连接到该特定节点.我接下来要做的是使其具有交互性，例如能够通过使用光标拖动来使每个节点移动.我知道我必须使用matplotlib，但是我不确定如何使用它.谁能帮我吗? 我的代码是: import matplotlib.pyplot as plt import networkx as nx import itertools d = [n
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将分类属性向量转换为相似度矩阵
我需要使用R将分类属性向量转换为“相同属性矩阵". 例如，我有一个向量，该向量报告N人的性别(男性= 1，女性= 0).我需要将此向量转换为名为A的NxN矩阵(行和列上都有人的名字)，如果两个人(i和j)的性别相同，则每个单元格Aij的值为1，否则为0. 下面是一个示例，其中有3个人(第一位男性，第二位女性，第三位男性)产生此向量: c(1, 0, 1) 我想将其转换为这个
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