pandas groupby并在新列中使用中位数进行校正 [英] Pandas groupby and correct with median in new column

问题描述

我的数据框看起来像这样

My dataframe look like this

Plate Sample LogRatio
 P1     S1     0.42
 P1     S2     0.23 
 P2     S3     0.41 
 P3     S4     0.36 
 P3     S5     0.18

我已经计算出每个板块的中位数(但也许不是这样开始的最好主意)

I have calculated the median of each plate (but it's probably not the best idea to start like this)

grouped = df.groupby("Plate")
medianesPlate = grouped["LogRatio"].median() 

我想在数据框上添加一列

And I want to add a column on my dataframe

CorrectedLogRatio = LogRatio-median(plate)

我想和:

df["CorrectedLogRatio"] = LogRatio-median(plate)

要拥有这样的东西:

Plate Sample LogRatio CorrectedLogRatio
 P1     S1     0.42    0.42-median(P1)   
 P1     S2     0.23    0.23-median(P1)
 P2     S3     0.41    0.41-median(P2)
 P3     S4     0.36    0.36-median(P3)
 P3     S5     0.18    0.18-median(P3)

但是我不知道如何从medianesPlates获得中位数.我尝试了一些套用和转换功能，但没有用.谢谢您的帮助

But I don't know how to get the median from medianesPlates. I tried some apply and transform functions but it doesn't work. Thanks for any help

推荐答案

您可以使用

You can use transform:

df['CorrectedLogRatio'] = df['LogRatio'] - df.groupby('Plate')['LogRatio'].transform('median')

结果输出:

  Plate Sample  LogRatio  CorrectedLogRatio
0    P1     S1      0.42              0.095
1    P1     S2      0.23             -0.095
2    P2     S3      0.41              0.000
3    P3     S4      0.36              0.090
4    P3     S5      0.18             -0.090

这篇关于 pandas groupby并在新列中使用中位数进行校正的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！