匹配的合并范围中的R [英] Matched Range Merge in R

问题描述

我想合并/合并两个文件，​​所以，如果在我的第一个文件的B列中的条目分为列B和C在我的第二个文件的范围内，输出将包含所有包含在这两个资料文件。

I would like to merge/combine two files, so that if an entry in column B of my first file falls into the range of columns B and C in my second file, the output will contain all of the information contained in both files.

这样的：

文件1

     A      B
    rs10    23353
    rs100   10000
    rs234   54440

文件2

    A        B      C
    E235    20000   30000
    E255    50000   60000

在哪里，因为23353瀑布20000到30000之间，并且54440瀑布输出文件应该是这样的50000和60000之间：

where, because 23353 falls between 20000 and 30000, and 54440 falls between 50000 and 60000 the output file would look like this:

rs      23353   E235    20000   30000
rs234   54440   E255    50000   60000

和RS100将被删除（从输出文件），因为它不会在文件2落入范围内的任何行的范围内。

and rs100 would be removed (from the output file) because it does not fall within a range of any row in file 2.

有什么建议？

感谢您！

推荐答案

更新：这个问题是不是在这里表示更复杂。该解决方案可以在这里找到： R中被合并范围 - 应用循环，由Bioconductor的中使用 GenomicRanges 包交付。非常有用的包！

UPDATE: This question was more complicated than indicated here. The solution can be found here: Merge by Range in R - Applying Loops, and is delivered by using the GenomicRangespackage in Bioconductor. Very useful package!

这篇关于匹配的合并范围中的R的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！