R中的匹配范围合并 [英] Matched Range Merge in R

问题描述

我想合并/合并两个文件，这样如果我的第一个文件的 B 列中的条目落入我的第二个文件的 B 列和 C 列的范围内，输出将包含两个文件中包含的所有信息文件.

I would like to merge/combine two files, so that if an entry in column B of my first file falls into the range of columns B and C in my second file, the output will contain all of the information contained in both files.

像这样:

文件 1

     A      B
    rs10    23353
    rs100   10000
    rs234   54440

文件 2

    A        B      C
    E235    20000   30000
    E255    50000   60000

其中，因为 23353 介于 20000 和 30000 之间，而 54440 介于 50000 和 60000 之间，所以输出文件如下所示:

where, because 23353 falls between 20000 and 30000, and 54440 falls between 50000 and 60000 the output file would look like this:

rs      23353   E235    20000   30000
rs234   54440   E255    50000   60000

并且 rs100 将被删除(从输出文件中)，因为它不在文件 2 中任何行的范围内.

and rs100 would be removed (from the output file) because it does not fall within a range of any row in file 2.

有什么建议吗?

谢谢！

推荐答案

更新:这个问题比这里指出的要复杂.可以在此处找到解决方案:R 中按范围合并 - 应用循环，并使用 Bioconductor 中的 GenomicRanges 包交付.非常有用的包！

UPDATE: This question was more complicated than indicated here. The solution can be found here: Merge by Range in R - Applying Loops, and is delivered by using the GenomicRangespackage in Bioconductor. Very useful package!

这篇关于R中的匹配范围合并的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！