使用pybind11共享MPI通信器 [英] Sharing an MPI communicator using pybind11

问题描述

假设我已经在MPI通信器周围创建了一个包装器：

class Communicator {
   public:
      Communicator() : comm(MPI_COMM_WORLD) {}

      Communicator(int const color, int const key) {
        MPI_Comm_split(MPI_COMM_WORLD, color, key, &comm);
      }

      Communicator(MPI_Comm comm) : comm(comm) {}

      MPI_Comm GetComm() const { return comm; }
    private:
      MPI_Comm comm;
}; 

我想使用pybind11在此对象周围创建一个python包装器，如下所示：

void CommunicatorWrapper(pybind11::module &m) {
   py::class_<Communicator, std::shared_ptr<Communicator> > commWrap(m, "Communicator");

   commWrap.def(py::init( []() { return new Communicator(); } ));
   commWrap.def(py::init( [](int const color, int const key) { return new Communicator(color, key); } ));
   commWrap.def(py::init( [](MPI_Comm comm) { return new Communicator(comm); } ));
   commWrap.def("GetComm", &Communicator::GetComm);
}

但是，我希望python看到的MPI_Comm类型是mpi4py.MPI.Comm。这个是可能的吗？如果是，如何？

上述(朴素)实现会导致以下行为：

comm = Communicator(MPI.COMM_WORLD)

错误：

TypeError: __init__(): incompatible constructor arguments. The following argument types are supported:
1. Communicator()
2. Communicator(arg0: int, arg1: int)
3. Communicator(arg0: int)

和

comm = Communicator()
print(comm.GetComm())

打印-2080374784。考虑到MPI_Comm是什么，此行为是有意义的，但显然不是我需要的功能。

推荐答案

我通过将包装器更改为

解决了此问题

#include <mpi4py/mpi4py.h>

pybind11::handle CallGetComm(Communicator *comm) {
    const int rc = import_mpi4py();
    return pybind11::handle(PyMPIComm_New(comm->GetComm()));;
}

void CommunicatorWrapper(pybind11::module &m) {
   py::class_<Communicator, std::shared_ptr<Communicator> > commWrap(m, "Communicator");

   commWrap.def(py::init( []() { return new Communicator(); } ));
   commWrap.def(py::init( [](int const color, int const key) { return new Communicator(color, key); } ));
   commWrap.def(py::init( [](pybind11::handle const& comm) {
     const int rc = import_mpi4py();
     assert(rc==0);
     return new Communicator(*PyMPIComm_Get(comm.ptr()));
    } ));
   commWrap.def("GetComm", &CallGetComm);
}

这篇关于使用pybind11共享MPI通信器的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！