从多个文件夹中读取* .csv作为列表 [英] Read *.csv as list from multiple folders

问题描述

我在多个文件夹中有数千个* csv文件 ../ t1 / *。csv ， ../ t2 / *。csv ， ../ t3 / *。csv ...等。

从以下多个文件夹中上传文件：

  filenames<  -  list.files（c（C：/ Example / t1 ，C：/ Example / t2），pattern =*。csv，full.names = TRUE）
 list.df<  -  lapply（filenames，read.csv）
  

但是我必须输入所有目录 C：/ Example / t1 ， C：/ Example / t2 等如何读取所有数据（作为data.frames列表）与一个主目录有如： C ：/ Example / * ？

解决方案

使用 list.files 与 recursive = TRUE 将搜索第一个参数下的所有文件夹匹配文件：

 > list.files（./，recursive = TRUE）
 [1]a / a1.csva / a2.csva / notme.txtb / b1.csv /e/e1.csv
  

这是我当前目录下的所有文件，如果我只想要CSV ：

 > list.files（./，recursive = TRUE，pattern =*。csv）
 [1]a / a1.csva / a2.csvb / b1.csv d / e / e1.csv
  

注意它在第二级的外观 d / e / 文件夹？

如果你只想去一个特定的深度，请尝试 Sys.glob - 这些模式匹配文件夹和文件，这些示例从当前目录工作：

只有第一级：

 > Sys.glob（* / *。csv）
 [1]a / a1.csva / a2.csvb / b1.csv
  

只有第二级：

  Sys.glob（* / * / *。csv）
 [1]d / e / e1.csv
  

I have thousands of *csv files in multiple folders ../t1/*.csv,../t2/*.csv,../t3/*.csv...etc.

I can upload the files from multiple folders as following:

filenames <- list.files(c("C:/Example/t1","C:/Example/t2"), pattern="*.csv", full.names=TRUE)
list.df <- lapply(filenames, read.csv)

However I have to type in all the directories C:/Example/t1, C:/Example/t2 etc. How to read all data (as list of data.frames) with one main directory somethign like: C:/Example/*?

解决方案

Using list.files with recursive=TRUE will search all folders under the first argument for matching files:

> list.files("./",recursive=TRUE)
[1] "a/a1.csv"    "a/a2.csv"    "a/notme.txt" "b/b1.csv"    "d/e/e1.csv" 

That's all the files under my current directory, if I only want CSVs:

> list.files("./",recursive=TRUE,pattern="*.csv")
[1] "a/a1.csv"   "a/a2.csv"   "b/b1.csv"   "d/e/e1.csv"

Notice how it looks in the second-level d/e/ folder?

If you only want to go to a single, specific depth, try Sys.glob - these patterns match folders and files and these examples work from the current directory:

Only first level:

> Sys.glob("*/*.csv")
[1] "a/a1.csv" "a/a2.csv" "b/b1.csv"

Only second level:

> Sys.glob("*/*/*.csv")
[1] "d/e/e1.csv"

这篇关于从多个文件夹中读取* .csv作为列表的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！