IndexError：数组，datetime字符串和numpy genfromtxt的索引太多 [英] IndexError: too many indices for array, datetime strings and numpy genfromtxt

问题描述

我的数据示例如下所示：

  file1.txt 
 
时间：ID：W：X：Y：Z：
 2016/02/25：19：08 ：41 006124189X 769 372 363 348 
 2016/02/25：21：41：13 006124189X 769 362 308 390 
 2016/02/25：22：38：20 006124189X 769 362 363 390 
 2016/02/26：07：37：42 006124189X 769 372 272 366 
 2016/02/26：08：54：34 006124189X 769 372 272 366 
 2016/02/26：09：57 ：04 006124189X 769 372 363 371 
  

其中第一列是datetime字符串，第二列是id由数字和字母组成，其余的只是0-10000之间的整数。

我将最终尝试根据记录的时间值绘制一些这些整数值，但是目前我只是想要正确地调用数据。我当前的代码设置：

  import numpy as np 
 import matplotlib.pyplot as plt 
 import pylab 
 import datetime 
 
＃数据输入的文件名。 
 datafile ='file1.txt'
 
＃要用于列标题的名称。 
 names = ['时间'，'ID'，'W，'X'，'Y'，'Z'] 
 
＃读取从文件到数组的数据。跳过第一行。 
 #Datatypes used，对象为Time，String为ID，整数为其余部分。 
 data = np.genfromtxt（datafile，skip_header = 1，dtype =Object，S11，i8，i8，i8，i8，names = ['Time'，'ID'，'W'，'X' ，'Y'，'Z']）
 
＃打印调用的数据来检查它的工作原理。 
打印数据
 
＃将每列指定为一个名称。 
时间=数据[：，0] 
 ID =数据[：，1] 
 W =数据[：，2] 
 X =数据[：，3] 
 Y = data [：，4] 
 Z = data [：，5] 
 
＃打印指定列。 
打印时间
  

我试图尽可能地确定我在

最终我想使用matplotlib添加一个这样的结局：

  plt.plot（Time，W，label ='W vs Time'）
 plt.xlabel（'Time'，fontsize = 12）
 plt.ylabel 'W'，fontsize = 12）
 plt.show（）
  

但是，当脚本以其当前形式运行，它提供错误：

 第15行，在< module> 
时间=数据[：，0] 
 IndexError：数组太多索引
  

每个相应列的错误是相同的，即

 第16行在< module> 
 W = data [：，2] 
 IndexError：数组
的太多索引 

以前的打印数据行将正确输出文件中的所有数据，每次显示为包含引号的2016/02/25：19：08：32的字符串。

我不确定如何在这里正确处理数据表单。如果我只是设置dtype = i8，那么我可以调用任何数据列，除了时间和ID列之外，它会记住所有行的-1值，可以理解。

我试过以下这个scipy文档，也试过这个类似的东西的堆栈页面，我无法上班。

任何帮助都不胜感激。

解决方案

数据是一个结构化的数组。检查其形状和 dtype 。它已命名字段而不是列。

  ID = data ['ISBN'] 
  

应该工作而不是数据[：，1] 。

或者

  Time = data [names [0]] 
 ID = data [names [1]] 
 
  

genfromtxt 文档。它需要强调，如果使用名称，结果将是一个具有复合 dtype 的结构化数组，用户需要相应地访问数据。

I am having problems with correctly calling data from .txt files.

A sample of my data looks like so:

file1.txt

Time: ID: W: X: Y: Z:
2016/02/25:19:08:41 006124189X 769 372 363 348
2016/02/25:21:41:13 006124189X 769 362 308 390
2016/02/25:22:38:20 006124189X 769 362 363 390
2016/02/26:07:37:42 006124189X 769 372 272 366
2016/02/26:08:54:34 006124189X 769 372 272 366
2016/02/26:09:57:04 006124189X 769 372 363 371

Where the first column is a datetime string, the second is an id consisting of numbers and letters, the others are just integers ranging from 0-10000.

I will eventually try to plot some of these integer values against the time value recorded, but currently I am just trying to get the data to be called correctly. My current code setup:

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import pylab
import datetime

#File name for data input.
datafile = 'file1.txt'

#Names to be used for column headers.
names = ['Time', 'ID', 'W, 'X', 'Y', 'Z']

#Read Data from file into array. Skipping the first line. 
#Datatypes used, object for Time, String for ID and Integer for the rest.
data = np.genfromtxt(datafile, skip_header=1, dtype="Object,S11,i8,i8,i8,i8", names = ['Time', 'ID', 'W', 'X', 'Y', 'Z'])

#Print the data called to check it works.
print data

#Designating each column to a name.
Time = data[:,0]
ID = data[:,1]
W = data[:,2]
X = data[:,3]
Y = data[:,4]
Z = data[:,5]

#Print designated column.
print Time

I've tried to be as conclusive as possible in what I'm trying to do.

Eventually I want to include a plot using matplotlib adding something like so to the end:

plt.plot(Time,W, label='W vs Time')
plt.xlabel('Time',fontsize=12)
plt.ylabel('W',fontsize=12) 
plt.show()

However, when the script is run in its current form it gives the error:

line 15, in <module>
Time = data[:,0]
IndexError: too many indices for array

This error is the same for each respective column i.e

line 16, in <module>
W = data[:,2]
IndexError: too many indices for array

The print Data line before, will correctly output all the data in the file, showing each time as a string like so '2016/02/25:19:08:32' including the quotes.

I am unsure how to correctly handle the data form here. If I just set dtype =i8 then I can call any of the data columns fine except the Time and ID column which will recall -1 values for all rows, understandably.

I have tried following this scipy doc, also tried this stack page of a similar thing which I couldn't get to work.

Any help is appreciated.

解决方案

data is a structured array. Check its shape and dtype. It has named fields instead of columns.

ID = data['ISBN']

Should work instead of data[:,1].

Or

Time = data[names[0]]
ID = data[names[1]]
...

Something is wrong with the genfromtxt documentation. It needs to stress that if using names the result will be a structured array with a compound dtype, and that users need to access the data accordingly.

这篇关于IndexError：数组，datetime字符串和numpy genfromtxt的索引太多的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！