..level ..在ggplot :: stat_density2d中的含义是什么 [英] what does ..level.. mean in ggplot::stat_density2d

问题描述

我在构造一个将 fill 变量设置为 .. level ..

如下例所示：

  library（MASS ）
 geg_density2d（）+ 
 stat_density2d（aes（fill = ..level ..），geom =polygon）
  

我怀疑。 .level .. 意味着 fill 被设置为当前图层的相对数量？也有人可以链接我一个很好的例子来解释这些二维密度图，每个轮廓代表什么等等？我在网上搜索，但找不到任何合适的指南。

解决方案

扩展@hrbrmstr提供的答案 - 首先，调用 geom_density2d（）是多余的。也就是说，您可以通过以下方式获得相同的结果：

  library（ggplot2）
 library（MASS）
 
 gg < -  ggplot（geesser，aes（x = duration，y = waiting））+ 
 geom_point（）+ 
 stat_density2d（aes（fill = ..level ..）， geom =polygon）
  

让我们考虑其他一些方法来可视化这种密度估计，这可能有助于澄清什么：

  base_plot<  -  ggplot（geyser，aes（x = duration，y = waiting））+ 
 geom_point（）
 
 base_plot + 
 stat_density2d（aes（color = ..level ..））
  

  base_plot + 
 stat_density2d （aes（fill = ..density ..），geom =raster，contour = FALSE）
  

  base_plot + 
 stat_density2d （aes（alpha = ..density ..），geom =tile，contour = FALSE）
  

然而，我们再也看不到从 geom_point（）生成的点。

最后，请注意，您可以控制密度估算的带宽。为此，我们将 x 和 y 带宽参数传递给 h （见？kde2d ）：

  base_plot + 
 stat_density2d（aes（fill = ..density ..），geom =raster，contour = FALSE，
h = c（2，5））
  

同样，从 geom_point （）隐藏，因为它们在对 stat_density2d（）的调用之后。

I've seen some examples when constructing a heatmap of having the fill variable set to ..level...

Such as in this example:

library(MASS)
ggplot(geyser, aes(x = duration, y = waiting)) + 
    geom_point() + 
    geom_density2d() + 
    stat_density2d(aes(fill = ..level..), geom = "polygon")

I suspect that the ..level.. means that the fill is set to the relative amount of layers present? Also could someone link me a good example of how to interpret these 2D-density plots, what does each contour represent etc.? I have searched online but couldn't find any suitable guide.

解决方案

Expanding on the answer provided by @hrbrmstr -- first, the call to geom_density2d() is redundant. That is, you can achieve the same results with:

library(ggplot2)
library(MASS)

gg <- ggplot(geyser, aes(x = duration, y = waiting)) + 
    geom_point() + 
    stat_density2d(aes(fill = ..level..), geom = "polygon")

Let's consider some other ways to visualize this density estimate that may help clarify what is going on:

base_plot <- ggplot(geyser, aes(x = duration, y = waiting)) + 
  geom_point()

base_plot + 
  stat_density2d(aes(color = ..level..))

base_plot + 
  stat_density2d(aes(fill = ..density..), geom = "raster", contour = FALSE)

base_plot +
  stat_density2d(aes(alpha = ..density..), geom = "tile", contour = FALSE)

Notice, however, we can no longer see the points generated from geom_point().

Finally, note that you can control the bandwidth of the density estimate. To do this, we pass x and y bandwidth arguments to h (see ?kde2d):

base_plot +
  stat_density2d(aes(fill = ..density..), geom = "raster", contour = FALSE,
                 h = c(2, 5))

Again, the points from geom_point() are hidden as they are behind the call to stat_density2d().

这篇关于..level ..在ggplot :: stat_density2d中的含义是什么的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！