在facet'ed geom_boxplot中更改胡须定义 [英] Changing whisker definition in facet'ed geom_boxplot

问题描述

我创建了一个带有多个变量箱形图的 facet_grid 。举个例子，这个图可以通过下面的虚拟数据来重现：

  require（ggplot2）
 require（plyr） 
 library（reshape2）
 
 set.seed（1234）
 x < -  rnorm（100）
 y.1 <-rnorm（100）
 y.2 <-rnorm（100）
 y.3 <-rnorm（100）
 y.4 <-rnorm（100）
 
 df < - （as.data .frame（cbind（x，y.1，y.2，y.3，y.4）））
 dfmelt< -melt（df，measure.vars = 2：5）
  

并将结果图创建为



  dfmelt $ bin < -  factor（round_any（dfmelt $ x，0.5））
 ggplot（dfmelt，aes（x = bin，y = value，fill = variable））+ 
 geom_boxplot ）+ 
 facet_grid（。〜bin，scales =free）+ 
 labs（x =X（binned））+ 
 theme（axis.text.x = element_blank（） ）
  

给出以下结果：



然而，我想重新定义boxplot胡须，所以他们不会represe nt 0.25 - 1.5 IQR / 0.75 + IQR和异常值，但是（i）完整的第5和第95百分位数或（ii）数据的无限和上位数。


解决方案您可以使用 stat_summary 自定义外观，例如

  ggplot（dfmelt，aes（x = bin，y = value，fill = variable））+ 
 stat_summary （x，c（0.05,0.25,0.5,0.75,0.95）），c（ymin，lower，middle）， ，upper，ymax）），
 position =dodge）
  

I created a facet_grid with boxplots of multiple variables. To give an example, the graph can be reproduced by following dummy data

require(ggplot2)
require(plyr)
library(reshape2)

set.seed(1234)
x<- rnorm(100)
y.1<-rnorm(100)
y.2<-rnorm(100)
y.3<-rnorm(100)
y.4<-rnorm(100)

df<- (as.data.frame(cbind(x,y.1,y.2,y.3,y.4)))
dfmelt<-melt(df, measure.vars = 2:5)

and creating the resulting graph as

dfmelt$bin <- factor(round_any(dfmelt$x,0.5))
ggplot(dfmelt, aes(x=bin, y=value, fill=variable))+
  geom_boxplot()+
  facet_grid(.~bin, scales="free")+
  labs(x="X (binned)")+
  theme(axis.text.x=element_blank())

which gives the following result:

However, I would like to redefine the boxplot whiskers so they don't represent 0.25 - 1.5 IQR / 0.75 + IQR and outliers, but (i) the complete 5th and 95th percentile or (ii) the infinum and supremum of the data.

解决方案

You could use stat_summary to customize the appearance, e.g.

ggplot(dfmelt, aes(x=bin, y=value, fill=variable)) + 
stat_summary(geom = "boxplot", 
             fun.data = function(x) setNames(quantile(x, c(0.05, 0.25, 0.5, 0.75, 0.95)), c("ymin", "lower", "middle", "upper", "ymax")), 
             position = "dodge")

这篇关于在facet'ed geom_boxplot中更改胡须定义的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！