如何在hdf5文件的多个组之间拆分数据？
我有一个类似以下内容的数据： Generated by trjconv : P/L=1/400 t= 0.00000 11214 1P1 aP1 1 80.48 35.36 4.25 2P1 aP1 2 37.45 3.92 3.96 11210LI aLI11210 61.61 19.15 3.25 1121
..
hdf相关内容
如何检索存储字符串的HDF5数据集
我正在使用下面的命令创建H5数据集，该数据集使用dtype作为S10来存储字符串数组。 create_dataset(dset_name, (0,) , dtype='S10', maxshape=None, chunks=True) 它将数据正确存储在hdf5文件的组中。我甚至可以在HDF5查看器中看到正确的数据。但是，当我使用group.keys()时，我看不到数据集。数据集的图标也
..
如何使用HDF文件(固定格式，多个密钥)作为 pandas 数据帧？
我得到了一个使用PANDA创建的20 GB HDF5文件，但不幸的是，它是以固定格式(而不是表)编写的，每一列都写为一个单独的键。这对于快速加载一个功能非常有效，但它不支持方便的面向表格的过程(例如，统计分析或绘图)。 尝试将文件作为一个整体加载时出现以下错误： ValueError: key must be provided when HDF5 file contains multi
..
在Java中读取流媒体中的HDF5
我想读取一些几GB的HDF5流。为了便于移植，我还想继续使用原生Java。 我尝试过Java HDF对象包和Java HDF5接口(JHI5)，但这些都是一些JNI解决方案(如果找不到更好的选择，我可能会重新考虑)。 https://github.com/jamesmudd/jhdf是本机Java库，但不支持切片或流，因此不适用于大文件。 本机Java中是否有更多选项？ 编辑：
..
为什么我必须在析构函数中调用MPI.Finalize()？
我目前正在尝试理解mpi4py。我设置mpi4py.rc.initialize = False和mpi4py.rc.finalize = False是因为我不明白为什么我们需要自动初始化和结束。默认行为是在导入MPI时调用MPI.Init()。我认为这是因为对于每个级别，都在运行Python解释器的一个实例，每个实例都将运行整个脚本，但这只是猜测。归根结底，我喜欢直截了当地说。 现在这引入了
..
可以从 C 或 Fortran 读取 .Rdata 文件格式吗?
我正在编写一些关于 C 的 R 扩展(要从 R 调用的 C 函数). 我的代码需要同时使用 2 个不同的数据集计算统计数据，并且我需要使用所有可能的配对组合来执行此操作.然后，我需要所有这些统计数据(非常大的数组)来继续 C 端的计算.这些文件非常大，通常约为 40GB，这就是我的问题. 要在 R 调用的 C 上执行此操作，首先我需要加载 R 中的所有数据集以将它们传递给 C 函数调用
..
Nifi java.lang.NoSuchMethodError: org.apache.hadoop.conf.Configuration.reloadExistingConfigurations
我正在点击此链接设置 Nifi putHDFS 以写入 Azure 数据湖.从 NiFi 数据流连接到 Azure Data Lake Nifi 在 HDF 3.1 VM 中，Nifi 版本为 1.5. 我们从一个HD Insight(v 3.6，支持hadoop 2.7)头节点得到了上面链接中提到的jar文件，这些jar文件是: adls2-oauth2-token-provide
..
如何在 Apache NiFi 中将值从 executeSQL 动态传递到 SelectHiveQL
我有两个表，一个在 mysql test.employee 中，另一个在 hive default.dept我想通过 test.employee 表的 empid 作为参数在 hive 表中查询并将数据存储到 HDFS ExecuteSQL -> 从 test.employee 中选择 empid(给出 10 条记录) SelectHiveQL -> SELECT * FROM def
..
使用Spark无法将CSV数据正确加载为Parquet
我在配置单元 中有一个表格 CREATE TABLE tab_data(rec_id INT，rec_name STRING，rec_value DECIMAL(3,1)，rec_created TIMESTAMP)存储为PARQUET； ，我想用这些 .csv 文件中的数据填充该表 10 | customer1 | 10.0 | 2016-09-07 08:38:00.020 |
..
从Python读取3D HDF的特定Z组件切片
有人知道如何修改以下代码，以便我可以在Python中读取3D hdf数据的特定z分量切片吗?从所附图像中可以看到，z值范围从0到160，我只想绘制'80'.尺寸为400x160x160.这是我的代码. import h5handler as h5h h5h.manager.setPath('E:\data\Data5', False) for i in np.arange(0,1,500
..
查询HDF存储
我创建了一个hd5文件 hdf=pandas.HDFStore(pfad) hdf.append('df', df, data_columns=True) 我有一个包含numpy.datetime64值的列表，这些值称为expirations，并尝试将hd5表的一部分读取到数据帧中，该数据帧的值在expiration列中的expirations [1]和expirations [0]之间
..
Nifi java.lang.NoSuchMethodError:org.apache.hadoop.conf.Configuration.reloadExistingConfigurations
我正在单击此链接来设置Nifi putHDFS以写入Azure Data Lake. Nifi在HDF 3.1 VM中，Nifi版本为1.5. 我们从HD Insight(v 3.6，支持hadoop 2.7)头节点获得了上面链接中提到的jar文件，这些jar是: adls2-oauth2-token-provider-1.0.jar azure-data-lake-store-sd
..
如何使用此R函数拼接相同的HDF文件?
一个文件夹中有1000多个MODIS HDF图像: M:\join 他们的名字告诉我们哪些文件必须镶嵌在一起. 例如，在以下文件中， 2009090 意味着这三个图像必须镶嵌在一起: MOD05_L2.A2009090.0420.051.2010336084010 MOD05_L2.A2009090.0555.051.2010336100338 MOD05_L2.A20090
..
熊猫to_hdf成功，但随后read_hdf失败
熊猫to_hdf成功，但是当我使用自定义对象作为列标题时，read_hdf失败(我使用自定义对象，因为我需要在其中存储其他信息). 有什么办法可以使这项工作成功吗?还是仅仅是Pandas错误或PyTables错误? 作为一个例子，下面，我将首先显示一个使用字符串列标题的DataFrame foo，并且所有内容在to_hdf/read_hdf上都可以正常工作，然后将foo更改为使用自定义
..
HDFql使用表
我对HDFql的可用性有疑问: HDFql是否支持创建行类型不同的表? 如何将数据追加到表中? 如何遍历表格的行? 我要创建的表将具有1到2 ^ n行的任何内容，并且无法事先确定. 解决方案 以下是有关您有关 HDFql 的问题的一些信息a>: 如果通过"对行具有不同类型的表创建HDFql支持"，则表示HDFql支持复合数据类型，但答案尚无. (编辑:因为现在支持HD
..
无法使用pyhdf读取HDF4数据集(pyhdf.error.HDF4Error:select:不存在的数据集)
我正在尝试读取HDF4文件(import os import numpy as np from pyhdf.SD import SD, SDC # Open file. FILE_NAME = 'MOD13A2.A2016001.h23v05.006.2016029070140.hdf' hdf = SD(FILE_NAME, SDC.READ) # List available SDS data
..
比较H5文件
我经常不得不比较hdf文件.我可以通过二进制diff(即使内部的实际数字相同也可以告诉我文件是不同的)或通过使用h5dump将内容转储到txt文件中并比较两者的内容来实现文件(也很烦人). 我想知道是否有更聪明的方法可以做到这一点，也许是h5或HDFView或Panoply之类的软件的功能. 解决方案 也许
..
确定熊猫HDF文件中DataFrame的格式
有一个HDF文件'file.h5'，保存到其中的pandas DataFrame(或系列)的键名是'df'.如何确定"df"以哪种格式(即“固定"或“表格")保存到文件中? 谢谢您的帮助！ 解决方案 有点晚了，但也许有人会觉得有用. 您可以解析 HDFStore.info() . table格式的对象的类型为appendable: >>> print(h5_table.i
..
C/C ++ HDF5读取字符串属性
我的一位同事使用labview将ASCII字符串作为属性写入HDF5文件中.我可以看到该属性存在，并且可以读取，但是无法打印. 该属性是，如HDF Viewer中所示: 日期= 2015 \ 07 \ 09 所以“日期"是它的名字. 我正在尝试使用此代码读取属性 hsize_t sz = H5Aget_storage_size(dateAttribHandler);
..
图像另存为HDF5彩色
我目前正在开发将文本文件和jpg图像转换为HDF5-Format的程序.用HDFView 3.0打开后，图像似乎只保存为灰度. hdf = h5py.File("Sample.h5") img = Image.open("Image.jpg") data = np.asarray((img), dtype="uint8") hdf.create_dataset("Photos/Image 1
..