pdist相关内容

数据帧列中字符串行的列表之间的成对距离

我有一个数据帧,其中有一列字符串ID列表。(见下文)。 我想在所有行之间的所有成对距离之间创建距离矩阵 (例如,如果是10行,则它是10x10矩阵)。 这些行是ID列表,所以我不确定如何使用像pdist这样的东西。 这些值是字符串ID。就像字符串名称 ids 0 [58545-19, 462423-43, 277581-25] 1 [0] 2 [454950-82, 43 ..
发布时间:2022-04-15 13:35:47 Python

对于某些特定索引,scipy 的 pdist 函数是否有特定用途?

我的问题是关于 scipy.spatial.distance 的 pdist 函数的使用.尽管我必须计算 1x64 向量与存储在二维数组中的其他数百万个 1x64 向量中的每一个向量之间的汉明距离,但我无法使用 pdist 来完成.因为它返回同一二维数组内任意两个向量之间的汉明距离.我想知道是否有任何方法可以让它计算特定索引向量与所有其他向量之间的汉明距离. 这是我当前的代码,我现在使用 1 ..
发布时间:2021-07-16 21:18:50 Python

Python中使用pdist的字符串距离矩阵

如何在Python中计算字符串的Jaro Winkler距离矩阵? 我有很多手工输入的字符串(名称和记录号),我试图在列表中查找重复项,包括可能在拼写上稍有不同的重复项.建议使用Scipy的pdist函数和自定义距离函数来回答类似的问题.我尝试使用Levenshtein软件包中的jaro_winkler函数来实现此解决方案.问题在于jaro_winkler函数需要字符串输入,而pdict函数 ..
发布时间:2020-07-23 19:17:45 Python

在大型numpy三维数组上计算二维成对距离

我有一个以[pt_id, x, y, z]形式的300万个点的numpy数组.目标是返回所有具有欧氏距离的两个数字min_d和max_d的所有点对. 欧几里德距离在x和y之间,而不在z上.但是,我想保留具有pt_id_from,pt_id_to,distance属性的数组. 我正在使用scipy的dist计算距离: import scipy.spatial.distance co ..
发布时间:2020-05-18 21:39:06 Python

python numpy成对编辑距离

因此,我有一个字符串数组,我想使用以下函数计算每对元素之间的成对编辑距离:scipy.spatial.distance.pdist from 我的数组的示例如下: >>> d[0:10] array(['TTTTT', 'ATTTT', 'CTTTT', 'GTTTT', 'TATTT', 'AATTT', 'CATTT', 'GATTT', 'TCTTT', 'ACTTT'], ..
发布时间:2020-05-18 21:34:00 Python