在 Rcpp 中的另一个 cpp 文件中定义的函数中使用在一个 cpp 文件中定义的函数
我在文件 add.cpp 中定义了一个名为 add 的 C++ 函数(下面是 add.cpp 的内容): #include 使用命名空间 Rcpp；//[[Rcpp::export]]双加(双 a，双 b){返回 a + b;} 我在 multiplyandadd.cpp 文件(下面的 multiplyandadd.cpp 的内容)中定义了另一个名为 multiplyandadd 的 C++
..
rcpp相关内容
从 R 对象中提取 long[]
我正在尝试为一些基于 C 的稀疏矩阵处理代码制作一个包装器(参见 上一个问题).为了调用主力 C 函数，我需要创建一个如下所示的结构: struct smat {长排；长列；长值；/* 非零条目总数.*/长*指针；/* 对于每个列(加 1)，第一个非零条目的索引.*/长*rowind;/* 对于每个 nz 条目，行索引.*/双*值；/* 对于每个 nz 条目，值.*/}; 这些很好地对应于 d
..
在 Rcpp 中公开类 - 工厂而不是构造函数
有一个类我必须移植到 R.我将它作为 Rcpp 模块公开.但是，我还需要在 R 之外使用该类.我的意思是我想用谷歌测试来测试这门课.为了编译测试，该类不得使用 Rcpp 中的任何内容. 不幸的是，创建类实例的函数必须具有相当灵活的参数列表.我想使用命名参数，因为您可以选择指定许多参数.出于这个原因，我不能声明在 R 中有任何用处的构造函数.如果我可以定义一个作为工厂方法执行的函数，那就没问题
..
为 Windows 设置 Rcpp GSL
我正在尝试为 Windows 设置 Rcpp GSL.. 我阅读了很多关于这个主题的帖子，但我已经有一段时间找不到解决方案了.. 提前抱歉.. 所以我在 Windows 8.1 上运行 R 3.1.Rcpp 和 Rcpp Armadillo 都工作正常.. R 版本 3.1.0 (2014-04-10)平台:x86_64-w64-mingw32/x64(64位)语言环境:[1] LC_CO
..
Rcpp 快速统计模式功能，具有任意类型的矢量输入
我正在尝试为 R 构建一个超快速模式函数，用于聚合大型分类数据集.该函数应采用所有支持的 R 类型的向量输入并返回模式.我已阅读这篇文章、本帮助页面等，但我无法使该函数接受所有 R 数据类型.我的代码现在适用于数字向量，我依赖于 Rcpp 糖包装函数: #include 使用命名空间 Rcpp；//[[Rcpp::export]]int Mode(NumericVector x, bool na
..
为什么 rasterToPoints 在第一次调用时产生错误而不是第二次调用?
我有一些代码可以遍历研究 ID 列表 (ids) 并将它们转换为单独的多边形/空间点.在第一次执行循环时，它会产生以下错误: (函数(x)中的错误:尝试应用非函数 这是来自 raster::rasterToPoints 函数.我已经查看了此函数的帮助部分中的示例，并且传递 fun=NULL 似乎是一种可接受的方法(过滤掉所有 NA 值).无论如何，所有值都等于 1，所以我尝试传递一个像
..
在 Rcpp 中编译多个源文件
我有以下目录结构 my_func- my_func_r.cpp- my_func.c- my_func.h- my_func_test.c- 矩阵/- 矩阵.h- 矩阵.c matrix 目录在matrix.h 中包含一些矩阵结构，在matrix.c 中包含一些初始化、自由、打印等功能.my_func.h 文件类似于 #include #include #include #include "
..
RcppModules:手动构建/向 R 公开 C+ 类
目标是包装相当大的现有 C++ 类集合，以便从 R 调用.第一种方法是手动定义 R 引用类并调用“SEXP 包装"入口点 - 这工作正常，没有问题.我目前正在评估的另一种方法是 RcppModules.我可以成功地将它与玩具示例 in R 一起使用 - 使用 Rcpp::SourceCPP.但是在手动执行此操作时遇到麻烦.示例: //---example.cpp#include "Rcpp.h"
..
使用 Rmath.h 中的 pnorm 和 Rcpp
我正在尝试使用 pnorm 和 qnorm 等函数使用 Rcpp 编写一段 C++ 代码.我可以将这些的 Rcpp 糖版本用于矢量，如 https://stackoverflow.com/a/9738848/567015，但我不需要在向量上执行此操作，而只需在双精度上执行此操作. 如果我理解正确，我可以使用 Rf_ 前缀从 Rmath.h 获取标量版本.但是，Rf_pnorm 不起作用:
..
'const Rcpp::CharacterVector&'的转换元素到“标准::字符串"
我想知道是否有一种 Rcpp 方法可以将 const CharacterVector& 的元素或迭代器转换为 std::string.如果我尝试以下代码 void as(const CharacterVector& src) {std::string 胶水；for(int i = 0;i
..
为多个会话保留 XPtr
我有一个 R 函数，它创建一个 Primebase Cpp 类，然后返回一个 XPtr 指针. 由于构建过程需要大量时间，我想将 Primebase 的实例保存到我的会话中，以便下次打开 RI 时可以直接访问 Primebase 实例. 不幸的是，一旦我关闭 R 并且 XPtr 变成一个 空指针，底层对象就会被删除. 有没有办法阻止 R 删除对象或以任何其他方式保存底层对象?
..
一个包内的rcpp omp_set_num_threads
我使用 Rcpp 和 OpenMP 编写了以下简单示例，当我从 RStudio 获取 cpp 文件时，该示例工作正常: #include #include //[[Rcpp::plugins(openmp)]]使用命名空间 Rcpp；//[[Rcpp::export]]NumericMatrix my_matrix(int I, int J, int nthreads) {数值矩阵 A(I,J)
..
在 Rcpp(Eigen) 中的 NumericVector/Matrix 和 VectorXd/MatrixXd 之间转换以执行 Cholesky 求解
编辑:从下面德克的回答中得到一些线索，我解决了这个问题，现在问题正文中的解决方案. 我确定这必须在某处记录，但我的谷歌技能让我失望. 我正在开发一个我认为不需要的 Rcpp 包对 Eigen 的依赖，所以我非常广泛地使用 NumericVector/Matrix.但是，我现在需要一个 Cholesky decomp/solve:我知道如何做到这一点使用 RcppEigen 但我需要 V
..
Rcpp分位数实现
我有一个包含 NumericVector x 的 Rcpp double.我想在 Rcpp 代码流中获得此类 x 的 .95 分位数.我不知道我怎样才能得到它.是否有 RcppArmadillo 实现? 解决方案 我不是 Rcpp 专家，我的功能可能需要很多改进，但似乎您可以轻松创建自己的Rcpp 分位数函数(由于偏斜的可能性很大，并且在非整数索引上存在索引问题，因此在小向量上不太准确，但
..
Rcpp:从 Rcpp 中的包调用 C 函数
我想用 Rcpp 编写一个 C++ 函数，该函数使用包 hypred 中的 C 函数，该包位于 CRAN 这里. 我阅读了在 Rcpp 中使用其他包中的 C 函数，但不明白这是否适用于我，如果适用，该怎么做. 所需的函数位于源文件 /src/hypredRoutines.c 中，名为 meiosisFUNAllChr. 到目前为止我根据这个 SO 问题做了什么这里 是: 我
..
使用 Rcpp Sugar 将均值和标准差传递给 dnorm()
我正在将一些 R 代码转换为 Rcpp 代码，并且需要计算给定均值向量和标准差向量的观察向量的似然性.如果我假设均值为 0 且标准差为 1，我可以编写此函数(运行此函数需要加载 'inline' 和 'Rcpp' 包)， dtest1 = cxxfunction(signature( x = "numeric"),'Rcpp::NumericVector xx(x);return::wrap(d
..
Rcpp 中的值和参考参数之间的差异
考虑这两个函数: 库(Rcpp)cppFunction("NumericVector func1(NumericVector &x){for (int i = 0; i
..
如何使用 Rcpp 注册本机例程?
我正在编写一个 Bioconductor 包.为此，它需要通过 BiocCheck. 我使用 Rcpp 和 Rstudio 使 C++ 代码可用于 R 使用标签 //[[Rcpp::export]] 和 Rcpp 类，而不是 SEXP 类.Rstudio 自动生成 Rcpp_export.cpp 和 Rcpp_export.R 并且它工作正常. 然而，BiocCheck 对此表示不满:
..
如何使用默认参数导出 Rcpp 类方法
我有一个 c++ 类 myClass，它有一个方法 foo(int x=0) 并且它有一个参数 x，默认值为 0.c++ 类可以通过 导出到R RCPP_MODULE(my_module) {类_( "myClass" ).构造函数().method( "foo", &myClass::foo );} 但是，在 R 中，我无法在不指定 x 的值的情况下调用 myClass$foo.无论默认值
..
如何使用 Rcpp 将 C 结构从 C 库暴露给 R
我正在尝试将 C 库中的 C 结构公开到 R 中.例如: struct A {整数标志；//...} 库提供API来构造和销毁A是很常见的: A* initA();void freeA(A* a); 感谢 RCPP_MODULE，不用考虑析构函数就很容易暴露它: #include 使用命名空间 Rcpp；RCPP_EXPOSED_CLASS(A)RCPP_MODULE(A) {class
..