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我正在使用 SimpleITK 阅读一组 o 3D 卷 将 SimpleITK 导入为 sitk对于文件名中的文件名:图像 = sitk.ReadImage(文件名) 每个卷都有不同的大小、间距、原点和方向.此代码为不同的图像生成不同的值: 打印(image.GetSize())打印(图像.GetOrigin())打印(图像.GetSpacing())打印(图像.GetDirection(
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我有一组o正在使用 SimpleITK 读取的3D卷 将SimpleITK导入为sitk用于文件名中的文件名:图片= sitk.ReadImage(文件名) 每个体积都有不同的大小,间距,原点和方向.这段代码针对不同的图像产生不同的值: print(image.GetSize())打印(image.GetOrigin())打印(image.GetSpacing())打印(image.G
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似乎有人在GitHub上报告了此问题,但我仍然找不到一个明确的解决方案-在Windows上安装python模块的最后一步中,没有这样的文件夹,名为"/Wrapping/Python/Packaging"在"SimpleITK-build"下,其中没有名为"setup.py"的文件.人们指出,这可能是由于不正确的Python路径引起的问题.我尝试将Anaconda下的Python路径添加到系统中,以
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我对3D图像配准和分割有一些疑问: 加载dicom图像:在DCE-MRI中,有4000个切片,共100个堆栈,因此每个堆栈40个.如何使用GDCM simpleITK函数将它们加载到4D数组中 注册:注册非常简单,我们必须将所有100个堆栈注册到第一个堆栈中. 套准精度:SimpleITK重叠率度量或hausdroff距离需要分段和标记.现在,对于所有类型的图像而言,使用区域增长
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所以...我尝试了几种方法来在Python上下载SimpleITK(点安装),但根本无法正常工作! (在这里: SimpleITK python 2.7.12安装问题)现在,我m使用easy_install时出现此错误: 搜索simpleitk 阅读https://pypi.python.org / simple / simpleitk / https://pypi.python.or
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我正在Ubuntu上运行.当调用SimpleITK的Show方法时,无法在FIJI(ImageJ2)窗口中查看此类图像. 鉴于FIJI是可移植的应用程序,是否有必要执行更多处理才能正确链接Show方法? 预先感谢 解决方案 SimpleITK需要外部图像查看器来显示图像(ImageJ,3DSlicer,ITK-Snap等). ImageJ安装 转到 https://
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我正在尝试对从* .nii.gz文件读取的所有图像进行直方图均衡化. 我已经尝试过以下代码: import SimpleITK as sitk flair_file = '/content/gdrive/My Drive/Colab Notebooks/.../FLAIR.nii.gz' images = sitk.ReadImage(flair_file) print("Width
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我想要分割图片。我使用简单的阈值方法。为此,我读取图像并将其转换为数组,然后img被转换 将SimpleITK导入为sitk import numpy as np header = sitk.ReadImage(“Sub1.png”) img = sitk.GetArrayFromImage(header) a = img img =(( img> 20)* 255).asty
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我一直在研究一些dicom系列,发现厚度属性和itkimage.GetSpacing()[2]值并不总是一致的。 例如在dcm文件中编码的厚度(0018,0050)值 1.5 mm,但z轴上指示simpleITK的相应间距 1.00 。那么我应该用什么值来表示z轴上相邻体素中心之间的物理距离?如果它们是不同的东西,那么间距实际意味着什么? 我在python中检索厚度和间距值,如下所示:
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