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目标 我有一个 3D 空间中大约 500K 点的列表.我想找到第一近邻距离最大的两个坐标. 方法 我正在使用 scipy 计算稀疏距离矩阵: from scipy.spatial import cKDTree树 = cKDTree(点数,40)spd = tree.sparse_distance_matrix(树,0.01)spo = spd.tocsr()spo.elimin
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我要解决的线性系统是由大型稀疏矩阵组成的. 我一直在使用 scipy.sparse 库及其 linalg 子库来执行此操作,但是我无法获得一些线性求解器工作. 这是一个有效的示例,可以为我重现此问题: 来自numpy.random的 随机导入从scipy.sparse导入csc_matrix从scipy.sparse.linalg导入溶解度,分钟N = 10A = csc_matr
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是否可以快速添加列/行以稀疏矩阵? a = sparse([1,2],[1,2],[1,1])具有2个Int64条目的2x2稀疏矩阵:[1,1] = 1[2,2] = 1 如何添加f.x a [3,3] = 1 无需提取每个值并重新初始化 解决方案 您可以使用Julia的矩阵常规连接功能来实现此功能,例如 julia>a =稀疏([1,2],[1,2],[1,1])具有
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我有一个Scipy稀疏CSR矩阵,它是由SVM-Light格式的稀疏TF-IDF特征矩阵创建的.功能数量巨大且稀疏,因此我必须使用SparseTensor,否则速度太慢. 例如,特征数量为5,示例文件如下所示: 0 4:11 1:3 3:40 5:10 2:1 解析后,训练集如下: trainX =trainY = np.array([0,1,00])
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我是C ++的新手,并且习惯于MATLAB.不幸的是,我的矩阵大小对于MATLAB来说太大了,所以我想在C ++中尝试一下.我发现本征库3.3.7可以进行矩阵处理.为此,我需要将矩阵市场文件导入Visual Studio2019.我了解C ++的一些基础知识,并尝试使用loadMarket导入文件.尝试编译后,在MarketIO.h文件中收到30个错误. 这是我正在使用的文件. https:
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在我的应用程序中,除类构造函数外,我需要避免动态内存分配(类似malloc).我有一个稀疏的半定矩阵M,其元素在程序执行过程中会发生变化,但它具有固定的稀疏性模式. 为了尽可能快地求解许多线性系统M * x = b,其想法是在类构造函数中使用就地分解,如 cs_symperm_noalloc 是CSparse库的 cs_symperm 函数的次要重构. 这似乎行得通,至少与我的特
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我正在尝试在GPU上实现矩阵向量乘法(使用CUDA). 在我的C ++代码(CPU)中,我将矩阵加载为密集矩阵,然后使用CUDA执行矩阵向量乘法.我还使用共享内存来提高性能. 知道我的矩阵是稀疏矩阵,如何高效地加载矩阵? 下面是我的C ++函数,用于加载矩阵: int readMatrix(char *文件名,float *&矩阵,unsigned int * dim = N
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我有一个非常大且稀疏的矩阵(531K x 315K),总细胞数约为1670亿.非零值仅为1s.非零值的总数约为45K.是否有有效的NMF软件包来解决我的问题?我知道有几个软件包,它们仅适用于较小的数据矩阵.任何想法都可以.预先感谢. 解决方案 输出: X-shape:(531000,315000)X nnzs:45000类型(X):
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我是R的初学者.我正在使用R studio的Cplex进行线性编程来求解模型.在我的模型中,约束之一是Xl(i,j,t)≤D(i,j,t).我可以使用小尺寸(16X16X6)的嵌套for循环来做到这一点.但是我想运行更大的模型,例如2500X2500X60.我需要节省内存并比嵌套的for循环更快地运行它.我考虑过使用Apply,但是我不知道如何使它工作.任何帮助将不胜感激! 位置
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我想在BigTable上保留一个非常稀疏的Spark Dataframe(> 100,000列)(其中99%的值为空),同时仅保留非null值(以避免存储成本). 是否有一种方法可以在Spark中指定在写入时忽略空值? 谢谢! 解决方案 可能(未对其进行测试),在将Spark DataFrame写入HBase/BigTable之前,您可以通过使用以下方法滤除每行中具有空值的列来
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我正在尝试构建一种通用方法来计算许多稀疏向量(长度为250k的100k个向量)的距离矩阵.在我的示例中,数据以Scipy CSR矩阵表示.这就是我正在做的: 首先,我要定义一种将csr行转换为pyspark SparseVectors的方法: def csr_to_sparse_vector(row):返回SparseVector(row.shape [1],sorted(row.ind
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我正在使用 GA软件包,我的目标是为k均值聚类算法找到最佳的初始质心位置.我的数据是TF-IDF分数中的单词稀疏矩阵,可以在此处下载.以下是我已实现的一些阶段: 0.库和数据集 library(clusterSim) ## for index.DB() library(GA) ## for ga() corpus
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我有一个问题,就是将本机稀疏格式转换为稀疏矩阵的QR分解要花很多时间.但是,我需要CSC格式的它才能将其用于进一步的计算. using LinearAlgebra, SparseArrays N = 1000 A = sprand(N,N,1e-4) @time F = qr(A) @time F.Q @time Q_sparse = sparse(F.Q) 0.000420 second
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我是Spark的新手.我想将稀疏矩阵用作专门用于推荐引擎的用户ID项目ID矩阵.我知道我将如何在python中做到这一点.如何在PySpark中做到这一点?这是我将如何在矩阵中完成的操作.该表现在看起来像这样. Session ID| Item ID | Rating 1 2 1 1 3 5 impo
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我有一个非常简单的问题,但仍然无法解决. 我想要一个块对角n ^ 2 * n ^ 2矩阵.块是只有对角线的稀疏n * n矩阵,首先是对角线,然后是对角线.对于n=4的简单情况,可以轻松完成 datanew = ones((5,n1)) datanew[2] = -2*datanew[2] diagsn = [-4,-1,0,1,4] DD2 = sparse.spdiags(datanew,
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作为一个较大问题的一部分,在处理Eigen中的稀疏矩阵时,我遇到了性能瓶颈. 我需要从稀疏矩阵(G)中的每个元素中减去一个浮点数(x),包括系数为零的位置.因此零个元素的值应为-x 此刻我的操作方式如下: //calculate G x=0.01; for(int i=0;i
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我正在尝试将apriori算法应用于二进制矩阵,但是我所有的值都返回0. 我对矩阵执行了汇总函数,以确认其具有非零值.我尝试使用以下方法强制进入交易表格: trans
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我试图用数字和分类数据创建一个稀疏矩阵,将其用作cv.glmnet的输入.当只涉及数字数据时,我可以使用以下语法创建sparseMatrix sparseMatrix(i=c(1,3,5,2), j=c(1,1,1,2), x=c(1,2,4,3), dims=c(5,2)) 对于分类变量,以下方法似乎有效: sparse.model.matrix(~-1+automobile,
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我正在尝试在具有预先计算的距离值的非常稀疏的矩阵上显示tsne,但遇到了麻烦. 归结为: row = np.array([0, 2, 2, 0, 1, 2]) col = np.array([0, 0, 1, 2, 2, 2]) distances = np.array([.1, .2, .3, .4, .5, .6]) X = csc_matrix((distances, (row,
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我有一个大的稀疏矩阵,称为P: > str(P) Formal class 'dgCMatrix' [package "Matrix"] with 6 slots ..@ i : int [1:7868093] 4221 6098 8780 10313 11102 14243 20570 22145 24468 24977 ... ..@ p :
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