如何使用boxplots在R中绘制csv数据列 [英] How to plot columns of csv data in R using boxplots

问题描述

我有一个示例数据帧，该数据帧长3600行，宽6列.我想在R中创建一个绘图，该绘图将显示六个框形图，每个六列数据中的一个.我正在使用ggplot.我可以很容易地在excel中创建它们(如下所示)，但是希望能够在R中做到这一点，因为我未来的数据帧将变得更大，而R似乎更容易处理大型数据集.

I have a sample dataframe that is 3600 rows long by 6 columns wide. I want to create plot in R that will show six boxplots, one for each of the 6 columns of data. I am using ggplot. I can create them in excel easy enough (shown below) but want to be able to do it in R as my future dataframes are going to be much larger and R seems to handle large datasets a lot easier.

使用下面的代码，我可以很好地绘制第一列，但无法弄清楚如何添加其他5列中的数据.

Using the code below I can plot the first column fine, but can't figure out how to add the data from the other 5 columns.

ggplot(data=df)+
 geom_boxplot(aes(x="Label", y=col1))

推荐答案

使用 ggplot2

Using geom_boxplot from ggplot2

要使用 ggplot2 为6列中的每列获取一个箱线图，您需要先将数据框重塑为更长的格式，以匹配 ggplot2 的语法(一列用于x值，一列用于y值，一列或多列作为分类值).然后，您可以使用 ggplot2 和 geom_boxplot 函数:

To get a boxplot for each of your 6 columns with ggplot2, you need to reshape first your dataframe into a longer format in order to match the grammar of ggplot2 (one column for x values, one column for y values and one or more column as categorical values). Then, you can use ggplot2 and geom_boxplot function:

以下是使用包含的 iris 数据集的示例:

Here, an example using the included iris dataset:

> head(iris)
  Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
1          5.1         3.5          1.4         0.2  setosa
2          4.9         3.0          1.4         0.2  setosa
3          4.7         3.2          1.3         0.2  setosa
4          4.6         3.1          1.5         0.2  setosa
5          5.0         3.6          1.4         0.2  setosa
6          5.4         3.9          1.7         0.4  setosa

使用 tidyr 包中的

pivot_longer 函数，您可以将此数据集的前4列重塑为更长的格式:

Using, pivot_longer function from tidyr package you can reshape the first 4 columns of this dataset into a longer format:

library(tidyr)
library(dplyr)
iris2 <- iris %>% pivot_longer(cols = Sepal.Length:Petal.Width, names_to = 
"Var", values_to = "val")

# A tibble: 600 x 3
   Species Var            val
   <fct>   <chr>        <dbl>
 1 setosa  Sepal.Length   5.1
 2 setosa  Sepal.Width    3.5
 3 setosa  Petal.Length   1.4
 4 setosa  Petal.Width    0.2
 5 setosa  Sepal.Length   4.9
 6 setosa  Sepal.Width    3  
 7 setosa  Petal.Length   1.4
 8 setosa  Petal.Width    0.2
 9 setosa  Sepal.Length   4.7
10 setosa  Sepal.Width    3.2
# … with 590 more rows

然后，您可以在 ggplot2 中使用此新数据集，以获取 Var 的每个值的箱线图:

And then, you can use this new dataset in ggplot2 for getting boxplot for each of values of Var:

library(ggplot2)
ggplot(iris2, aes(x = Var, y = val, fill  = Var))+
  geom_boxplot()

替代使用 base r

Alternative using base r

无需重新设计数据框，就可以通过使用 base r 中的 boxplot 函数立即获得boxplot:

Without the need to reshape your dataframe, you can get the boxplot right away by using boxplot function in base r:

boxplot(iris[,c(1:4)], col = c("red","green","blue","orange"))

它能回答您的问题吗?

这篇关于如何使用boxplots在R中绘制csv数据列的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！