R热图：为值指定颜色 [英] R heatmap: assign colors to values

问题描述

我在热图的R图库(https://www.r-graph-gallery.com/79-levelplot-with-ggplot2.html)中找到了以下R代码，并对其进行了一些修改：

# Library
library(ggplot2)

set.seed(10)

# Dummy data
x <- LETTERS[1:20]
y <- paste0("var", seq(1,20))
data <- expand.grid(X=x, Y=y)
data$Z <- runif(400, -1, 2)

print (data)

# Heatmap 
ggplot(data, aes(X, Y, fill= Z)) + 
  geom_tile(color = "white",
            lwd = 0.5,
            linetype = 1)

我的问题：我有三列的值范围从-1到2。现在我想为这些值分配定义的颜色F.E.详情如下： -1：红色，0：绿色，1：黄色，2：蓝色。

有没有办法使用geom_tile函数来解决我的问题？

谢谢！

推荐答案

如果希望具有离散的间隔和比例，则应将df$Z的值转换为整数因子，然后使用scale_fill_manual获得所需的配色方案。

data$Z <- factor(round(data$Z))

# Heatmap 
ggplot(data, aes(X, Y, fill= Z)) + 
    geom_tile(color = "white",
              lwd = 0.5,
              linetype = 1)+
    scale_fill_manual(values = c('red', 'green', 'yellow', 'blue'))

#or simply

ggplot(data, aes(X, Y, fill= factor(round(data$Z)))) + 
    geom_tile(color = "white",
              lwd = 0.5,
              linetype = 1)+
    scale_fill_manual(values = c('red', 'green', 'yellow', 'blue'), name = 'Z')

要将Z值转换为可以使用的字符串：

library(plyr)

data$Z <- factor(round(data$Z))

ata$Z <- revalue(data$Z, c('-1'='negative'))
data$Z <- revalue(data$Z, c('0' = 'no'))
data$Z <- revalue(data$Z, c('1' = 'yes'))
data$Z <- revalue(data$Z, c('2' = 'other'))

# Heatmap 
ggplot(data, aes(X, Y, fill= Z)) + 
    geom_tile(color = "white",
              lwd = 0.5,
              linetype = 1)+
    scale_fill_manual(values = c('red', 'green', 'yellow', 'blue'), name = 'Z')

这篇关于R热图：为值指定颜色的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！