heatmap相关内容
我使用gplots包的heatmap.2生成了一个热图: library(gplots) abc
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假设我有两个对称矩阵: library(Matrix) set.seed(123) s1
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我呈现了一个从0到6的212行x64列的整数df(Final_Df),作为(无注释的)带注释的热图。我使用fig.write_html()中的一个文件在我的浏览器(Microsoft EDGE)中执行此操作。最终的热图在我的浏览器中呈现得非常慢,以至于我收到“页面未响应”警告,任何放大/缩小图形的操作也都非常慢。考虑到df不是那么大,这很令人惊讶。 有谁能建议为什么会出现这种情况,以及如何加
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我想动态更新用Seborn制作的热图,逐条添加数据行。 下面的示例代码完成了基本工作,但它似乎并没有更新热图,而是在前一个热图中嵌套了一个新的热图。 预先感谢您提供的任何帮助/解决方案。 import numpy as np np.random.seed(0) import seaborn as sns import matplotlib.pyplot as plt data =
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我在一个容器中有多个热图。我想设置颜色轴,以便正数落在绿色范围内,负数落在红色范围内。因此,我将colorAxis: minColor设置为#009933,将colorAxis: maxColor设置为#ff3300。这并不是将所有负片设置为红色范围,将正片设置为红色范围。我可以使用HighChats执行此操作吗? 以下是我的代码: 数据-lang=“js”数据-隐藏=“假”数据-控制台=
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如何更改pheatmap中的文本颜色?我尝试了以下方法,但不更改轴、文本和标签,但不起作用 par( col.lab="#FFFFFF", fg="#FFFFFF", col.main="#FFFFFF", col.axis="#FFFFFF", cex.main=2, cex=2) pheatmap(heat_data, cluster_rows = FALSE, gaps_row = c
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我正在尝试生成一个热图,其中像素值由两个独立的2D高斯分布控制。设它们分别是Kernel1(muX1,muY1,sigmaX1,sigmaY1)和Kernel2(muX2,muY2,sigmaX2,sigmaY2)。更具体地说,每个内核的长度是其标准差的三倍。第一个内核具有sigmaX1=sigmaY1,第二个内核具有sigmaX2<;sigmaY2。两个核函数的协方差矩阵是对角的(X和Y是独
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我正在尝试使用相同的颜色突出显示每行的最小值: 例如,第一行的最小值为0.3。我想用蓝色突出它。同样,对于第二行,为0.042,依此类推。 这是代码。 import numpy as np import seaborn as sns import matplotlib.pylab as plt from matplotlib.patches import Rectangle P
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以下数据框包含一年中每小时的值(千瓦时)。 cons2016.head() Date Hour kWh Month Weekday 0 2016-01-01 00:00 71.48 January Friday 1 2016-01-01 01:00 65.32 January Friday 2 2016-01-01
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这是我的数据 df
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我当前正在为某些数据创建热图,其中每个项目(OTU)的值差异很大,因此我使用scale="row"选项。 我假设这将为每一行使用相同的颜色渐变,因此最大的颜色将始终存在(深绿色),最小的颜色(白色)也将始终存在。然而,正如您在下面看到的,有些颜色从白色变为白色,另一些颜色从浅绿色变为深绿色或深绿色。 以下是我一直使用的代码: library(gplots) library(RCo
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我想在此来源中数字化一个热图,面板D image 作为第一步,我尝试在OpenCV中读取图像并获得矩阵 import cv2 from pprint import pprint def read_as_digital(image): # mage dimensions h = image.shape[0] w = image.shape[1]
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我试着比较3个热图。 我费了好大劲才让这3张地图分享色条上的“暖气”。 加热将相对于每个子图、飞行、飞行1和飞行2的数据集。 而不是相对于不同的次要情节。 有没有办法将子图与共享色条连接起来? 我使用了以下代码: import seaborn as sns import matplotlib.pyplot as plt flights = sns.load_dataset(
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我正在尝试为我的样本中标识的微生物群落创建属级热图。 问题 我想将总和和行总数添加到我的热图(每个样本的所有基因的总丰度和所有样本的每个基因的总丰度)。但是,我很难使用代码,以便在不更改数据和以前的代码的情况下将总值相加。 我尝试的解决方法: 我尝试使用以下代码绘制我的热图。然而,由此产生的情节是奇怪的。 我的数据框: Gene Sample1 S
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我有一个很大的热图。我想通过只显示Spearman相关性大于0.5和小于-0.5的变量来更清楚地绘制它。这导致相关矩阵带有空格以实现更大的相关性。因此,热图也有空格。我想要一个热图,它以描述的方式显示相关性(当p.值低于0.05时使用*),但空白处不是白色,而是适当的颜色。 此代码生成一个带有空格的热图,如何将正确的相关性放回提供热图的矩阵中? 如何避免热图中出现空格? library
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我能够创建热图,但点没有显示: import folium import folium.plugins as plugins import numpy as np import pandas as pd import geopandas as gpd from folium import Choropleth, Circle, Marker from folium.plugins impor
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我是编程和Python方面的新手。我正在做一些教科书上的天线方向图,有一种叫做正弦空间的东西,天线方向图被投影到x-y平面上。生成的图案应包含在单位圆内)。当我使用matplotlib.pColoresh时,我能够获得我想要的模式。但我想不出如何让它与普洛特利一起工作。 我试图在Jupyter笔记本中说明我的问题。使用matplotlib.pColoresh,您可以看到我得到了预期的图。我特
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我将以下数据存储在geopandas.DataFrame对象中。geometry是多边形,x是我要用作热标的值。 id geometry x 9 01001 POLYGON ((-102.10641 22.06035, -102.10368 22.0... 33 19 01002
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几天前我已经发布了一个关于热图的问题:R heatmap: assign colors to values 答案已经对我的问题帮助很大(感谢@Pedro Alencar),所以这个代码可以工作: # Library library(ggplot2) library(plyr) set.seed(10) # Dummy data x
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我希望有人能帮我这个忙。 我有这个数据帧,它是dunnTest()的输出,它包含成对比较和p值。dunnTest()的示例输出如下所示。我尝试做的是将数据帧重塑为矩阵,并创建热图曲线图或关联曲线图平铺图,以可视化哪些组彼此之间有显著差异。输出应如下图所示。但是,块内的数据不是相关值,而是dunnTest() 中的p值 我试图完成的问题与此link中发布的问题类似,但没有给出任何答案。
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