将R中的地块另存为GIF [英] Saving plots in R as GIFs

问题描述

在R中，我使用函数savePlot将图形保存到图像文件中。但我的同事只能打开.jpgs和.gif(可能是因为他在度假，在手机上看电子邮件)。我讨厌创建jpeg，因为特别是盒子情节看起来非常难看(胡须模糊等)。但savePlot函数仅支持以下类型：

type = c("wmf", "emf", "png", "jpg", "jpeg", "bmp",
                  "tif", "tiff", "ps", "eps", "pdf")

如何在R中保存GIF格式的绘图？

编辑：如果可能，理想的解决方案应该可以在不安装ImageMagick的情况下工作(这样R脚本就可以轻松移植)。

推荐答案

R没有原生的GIF图形驱动程序，基本上(完全？)由于GIF格式的专利产权负担，请参阅http://tolstoy.newcastle.edu.au/R/help/05/02/12809.html。

caTools包中有一个函数(write.gif())，但它是专门为写入图像而设计的。如果你想使用它，你必须做一些棘手的事情，首先将你的曲线图转换成图像(例如，另存为PNG，然后将其读回R作为图像)。例如：

png("myPlot.png")
plot(rnorm(1000),rnorm(1000))
dev.off()
library(png)
P1 <- readPNG("myPlot.png")
library(caTools)
write.gif(P1,"myPlot.gif")
showGIF <- function(fn) system(paste("display",fn))
showGIF("myPlot.gif")
unlink("myPlot.gif")  ## clean up

?write.gif()有很多我没有读过的关于颜色索引的内容，但这对于更复杂的图表可能很重要...

animation包有saveGIF()保存GIF的函数，但(1)它是为保存多帧动画(非常规图形)而设计的，(2)它是通过调用ImageMagick来实现的。

只需自己构造该函数就更容易了。

• 安装ImageMagick(http://imagemagick.org)
• 另存为PNG，然后使用ImageMagick进行转换。

例如：

png("myPlot.png")
plot(rnorm(1000),rnorm(1000))
dev.off()
system("convert myPlot.png myPlot.gif")
unlink("myPlot.png") ## clean up
showGIF("myPlot.gif")
unlink("myPlot.gif") ## clean up

当然，如果您想要经常使用它们，您可以在函数中使用它们中的任何一个。

更新：我在这上面花了一段时间，试图获得一个纯R解决方案，但还没有一个有效的解决方案。欢迎建议或编辑...

## needs ImageMagick: just for testing ...
showGIF <- function(fn) system(paste("display",fn))

主函数：

saveGIF <- function(fn,verbose=FALSE,debug=FALSE) {
    require(png)
    require(caTools)
    tmpfn <- tempfile()
    on.exit(unlink(tmpfn))
    savePlot(tmpfn,type="png")
    P1 <- readPNG(tmpfn)
    dd <- dim(P1)
    P1 <- aperm(P1,c(3,1,2),resize=TRUE)  ## P1[,1,15]
    dim(P1) <- c(dd[3],prod(dd[1:2]))
    P1 <- t(P1)
    if (verbose) cat("finding unique colours ...
")
    P1u <- unique(P1)
    rgbMat <- function(x) {
        rgb(x[,1],x[,2],x[,3])
    }
    if (verbose) cat("creating colour index ...
")
    pp <- paste(P1[,1],P1[,2],P1[,3],sep=".")
    ## make sure factor is correctly ordered
    ind <- as.numeric(factor(pp,levels=unique(pp))) 
    if (verbose) cat("finding colour palette ...
")
    if (nrow(P1u)>256) {
        if (verbose) cat("kmeans clustering ...
")
        kk <- kmeans(P1u,centers=256)
        ind <- kk$cluster[ind]
        pal <- rgbMat(kk$centers)
    } else {
        pal <- rgbMat(P1u)
    }
    ## test:
    if (debug) {
        dev.new()
        par(mar=rep(0,4))
        image(t(matrix(ind-1,nrow=dd[1])),col=pal,axes=FALSE,ann=FALSE)
    }
    if (verbose) cat("writing GIF ...
")
    indmat <- matrix(ind-1,nrow=dd[1])
    storage.mode(indmat) <- "integer"
    write.gif(indmat,fn,col=as.list(pal),scale="never")
}


X11.options(antialias="none")
image(matrix(1:64,nrow=8),col=rainbow(10))
saveGIF("tmp.gif",verbose=TRUE,debug=TRUE)
showGIF("tmp.gif")

这篇关于将R中的地块另存为GIF的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！