如何使用Makevars链接到RCPP中已经编译的外部共享库？ [英] How to link to already compiled external shared libraries in RCPP using Makevars?

问题描述

我已经查看了多个地方，但未能找到解决我的问题的简单示例。

我需要的是能够使用我拥有的多个.so文件(以及.h文件)。

一个简单的例子是：

我有以下文件：a.h，a.cpp函数jeden-这是我的R库accesor.cpp，它向R公开外部库libdwa.so中的函数dwa。我有头文件dwa.h和这个库libdwa.so.

只有当我将库文件libdwa.so放入目录‘/usr/lib’(我使用Debian)时，我才能设法构建二进制包(一切工作正常)。但这不是可解析的解决方案。

我应该将库"dwa"文件(dwa.h和libdwa.so)放在哪里，以及在Makevars文件中添加哪些标志以获得可移植的解决方案？

已添加摘要

我在这里总结了我的结果。我相信一些极端简单的例子在开始时是有用的。

1. 2个外部库放入inst：

   /inst/include/dwa.h
   /inst/include/trzy.h
   /inst/jeden/libdwa.so
   /inst/jeden/libtrzy.so
   

2. CONFIGURE文件/CONFIGURE的格式为(Test6是包的名称)：

   #!/bin/bash
   rpath=$(${R_HOME}/bin/Rscript -e 'cat(file.path(.libPaths()[1], "test6", "jeden"))') #'
   sed -e"s|@rpath@|"${rpath}"|" src/Makevars.in > src/Makevars
   
   exit 0
   

3. 文件/src/Makevars.in的格式为：

   CXX_STD = CXX11
   
   PKG_CPPFLAGS = -I../inst/include/ -I.
   PKG_LIBS     = -ldwa -ltrzy -L../inst/jeden -Wl,-rpath,@rpath@
   

4. /src/accesor.cpp将库函数公开给R：

   #include <Rcpp.h>
   #include "../inst/include/dwa.h"
   #include "../inst/include/trzy.h"
   
   // [[Rcpp::export]]
   Rcpp::String r_dwa() {
     Rcpp::String res = dwa();.
     return res;
   }
   
   // [[Rcpp::export]]
   Rcpp::String r_trzy() {
     Rcpp::String res = trzy();.
     return res;
   }
   

5. 纯R库_/src/Hello_World.cpp_也存在：

   #include <Rcpp.h>
   using namespace Rcpp;
   
   // [[Rcpp::export]]
   String hello_world() {
     String hw = "Hello World";
     return hw ;
   }
   

6. 最终/命名空间文件：

   useDynLib("test6", .registration=TRUE)
   
   import("Rcpp")
   importFrom("utils", "object.size", "packageVersion")
   exportPattern("^[[:alpha:]]+")
   

已成功生成源和二进制包，但只有源包有用，因为二进制具有严格写入的库的路径。

推荐答案

假设您的目录结构如下：

/opt/dwa/include/dwa.h
/opt/dwa/lib/libdwa.so

在这种情况下，您可以使用issrc/Makevars：

PKG_CPPFLAGS = -I/opt/dwa/include
PKG_LIBS = -L/opt/dwa/lib -ldwa -Wl,-rpath,/opt/dwa/lib

当然，这仍然是不可移植的，因为库和头文件的路径是硬编码的。为了避免这种情况，可以使用模板文件，例如src/Makevars.in

PKG_CPPFLAGS = @DWA_INC@
PKG_LIBS = @DWA_LIB@

并编写configure脚本，该脚本检查环境并根据发现创建src/Makevars。编写configure脚本有不同的策略。我通常使用autoconf，例如在RcppArrayFire或dqmagic中。

这篇关于如何使用Makevars链接到RCPP中已经编译的外部共享库？的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！