Matplotlib绘制的三维表面不均匀的数据 [英] Matplotlib plotting non uniform data in 3D surface

问题描述

我有一个简单的code积点在3D的Matplotlib如下 -

 从mpl_toolkits.mplot3d进口axes3d
进口matplotlib.pyplot为PLT
进口numpy的为NP
从numpy的进口genfromtxt
导入CSV

图= plt.figure（）
AX = fig.add_subplot（111，投影='3D'）

my_data = genfromtxt（'points1.csv'，分隔符='，'）
points1X = my_data [：，0]
points1Y = my_data [：1]
points1Z = my_data [：，2]

##我删除的CSV文件的标题。
points1X = np.delete（points1X，0）
points1Y = np.delete（points1Y，0）
points1Z = np.delete（points1Z，0）

＃转换数组一维数组
points1X = np.reshape（points1X，points1X.size）
points1Y = np.reshape（points1Y，points1Y.size）
points1Z = np.reshape（points1Z，points1Z.size）

my_data = genfromtxt（'points2.csv'，分隔符='，'）
points2X = my_data [：，0]
points2Y = my_data [：1]
points2Z = my_data [：，2]
##我删除的CSV文件的标题。
points2X = np.delete（points2X，0）
points2Y = np.delete（points2Y，0）
points2Z = np.delete（points2Z，0）

＃转换数组一维数组
points2X = np.reshape（points2X，points2X.size）
points2Y = np.reshape（points2Y，points2Y.size）
points2Z = np.reshape（points2Z，points2Z.size）

ax.plot（points1X，points1Y，points1Z，D，markersize = 8，markerfacecolor ='红'，标签='points1'）
ax.plot（points2X，points2Y，points2Z，D，markersize = 8，markerfacecolor ='蓝'，标签='points2'）

plt.show（）
 

我的问题是，我试图让一个体面面积出来的这些数据点，我有。我已经尝试过使用 ax.plot_surface（）功能，使它看起来不错。为此，我消除了一些点，并重新计算矩阵那种需要此功能的输入。 不过，我产生的图形是困难得多国米preT和理解。所以有可能是两个可能性：要么我不使用的功能正确，否则，我想情节数据是不利于表面图。

我所期待的是3D图形这将对我们有三维饼图的效果类似。我们看到，一块（也被萃取出来）是另一块的一部分。我没想到它是完全相同的那样，而是某种类似的效果。

我想问的是：

1. 你是否认为这将有可能做出这样的3D图形？
2. 有没有什么办法更好，我可以前preSS我在3维数据？

下面是2个文件 -

points1.csv

  DIM1，DIM2，DIM3
3,8,1
3,8,2
3,8,3
3,8,4
3,8,5
3,9,1
3,9,2
3,9,3
3,9,4
3,9,5
3,10,1
3,10,2
3,10,3
3,10,4
3,10,5
3,11,1
3,11,2
3,11,3
3,11,4
3,11,5
3,12,1
3,12,2
3,13,1
3,13,2
3,14,1
3,14,2
3,15,1
3,15,2
3,16,1
3,16,2
3,17,1
3,17,2
3,18,1
3,18,2
4,8,1
4,8,2
4,8,3
4,8,4
4,8,5
4,9,1
4,9,2
4,9,3
4,9,4
4,9,5
4,10,1
4,10,2
4,10,3
4,10,4
4,10,5
4,11,1
4,11,2
4,11,3
4,11,4
4,11,5
4,12,1
4,13,1
4,14,1
4,15,1
4,16,1
4,17,1
4,18,1
5,8,1
5,8,2
5,8,3
5,8,4
5,8,5
5,9,1
5,9,2
5,9,3
5,9,4
5,9,5
5,10,1
5,10,2
5,10,3
5,10,4
5,10,5
5,11,1
5,11,2
5,11,3
5,11,4
5,11,5
5,12,1
5,13,​​1
5,14,1
5,15,1
5,16,1
5,17,1
5,18,1
6,8,1
6,8,2
6,8,3
6,8,4
6,8,5
6,9,1
6,9,2
6,9,3
6,9,4
6,9,5
6,10,1
6,11,1
6,12,1
6,13,1
6,14,1
6,15,1
6,16,1
6,17,1
6,18,1
7,8,1
7,8,2
7,8,3
7,8,4
7,8,5
7,9,1
7,9,2
7,9,3
7,9,4
7,9,5
 

和points2.csv

  DIM1，DIM2，DIM3
3,12,3
3,12,4
3,12,5
3,13,3
3,13,4
3,13,5
3,14,3
3,14,4
3,14,5
3,15,3
3,15,4
3,15,5
3,16,3
3,16,4
3,16,5
3,17,3
3,17,4
3,17,5
3,18,3
3,18,4
3,18,5
4,12,2
4,12,3
4,12,4
4,12,5
4,13,2
4,13,3
4,13,4
4,13,5
4,14,2
4,14,3
4,14,4
4,14,5
4,15,2
4,15,3
4,15,4
4,15,5
4,16,2
4,16,3
4,16,4
4,16,5
4,17,2
4,17,3
4,17,4
4,17,5
4,18,2
4,18,3
4,18,4
4,18,5
5,12,2
5,12,3
5,12,4
5,12,5
5,13,​​2
5,13,​​3
5,13,​​4
5,13,​​5
5,14,2
5,14,3
5,14,4
5,14,5
5,15,2
5,15,3
5,15,4
5,15,5
5,16,2
5,16,3
5,16,4
5,16,5
5,17,2
5,17,3
5,17,4
5,17,5
5,18,2
5,18,3
5,18,4
5,18,5
6,10,2
6,10,3
6,10,4
6,10,5
6,11,2
6,11,3
6,11,4
6,11,5
6,12,2
6,12,3
6,12,4
6,12,5
6,13,2
6,13,3
6,13,4
6,13,5
6,14,2
6,14,3
6,14,4
6,14,5
6,15,2
6,15,3
6,15,4
6,15,5
6,16,2
6,16,3
6,16,4
6,16,5
6,17,2
6,17,3
6,17,4
6,17,5
6,18,2
6,18,3
6,18,4
6,18,5
7,10,1
7,10,2
7,10,3
7,10,4
7,10,5
7,11,1
7,11,2
7,11,3
7,11,4
7,11,5
7,12,1
7,12,2
7,12,3
7,12,4
7,12,5
7,13,1
7,13,2
7,13,3
7,13,4
7,13,5
7,14,1
7,14,2
7,14,3
7,14,4
7,14,5
7,15,1
7,15,2
7,15,3
7,15,4
7,15,5
7,16,1
7,16,2
7,16,3
7,16,4
7,16,5
7,17,1
7,17,2
7,17,3
7,17,4
7,17,5
7,18,1
7,18,2
7,18,3
7,18,4
7,18,5
 

解决方案

我看不出哪里是你的问题，除了你需要的网格数据。 这里是如何从 points1.csv 您的数据是这样的：

 进口numpy的为NP
从mpl_toolkits.mplot3d进口Axes3D
进口matplotlib.pyplot为PLT
从scipy.interpolate进口的GridData

图= plt.figure（figsize = plt.figaspect（0.5））
斧= fig.add_subplot（1，2，1，投影=3D）
＃注意：您可以跳过行！
my_data = np.genfromtxt（'file1.csv'，分隔符='，'，skiprows = 1）
X = my_data [：，0]
Y = my_data [：1]
Z = my_data [：，2]

喜= np.linspace（X.min（），X.max（），100）
YI = np.linspace（Y.min（），Y.max（），100）
＃很重要，告诉matplotlib是如何将数据组织
滋=的GridData（（X，Y），Z（十一[无,:]，易建联[：，无]），方法='立方'）

CS = plt.contour（喜，苡仁，紫，15，线宽= 0.5，颜色='K'）
斧= fig.add_subplot（1，2，2，投影=3D）

XIG，YIG = np.meshgrid（十一，彝族）

冲浪= ax.plot_surface（XIG，YIG，紫，
        线宽= 0）

plt.show（）
 

我希望这有助于。

I have a simple code to plot the points in 3D for Matplotlib as below -

from mpl_toolkits.mplot3d import axes3d
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
from numpy import genfromtxt
import csv

fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')

my_data = genfromtxt('points1.csv', delimiter=',')
points1X = my_data[:,0]
points1Y = my_data[:,1]
points1Z = my_data[:,2]

## I remove the header of the CSV File.
points1X = np.delete(points1X, 0)
points1Y = np.delete(points1Y, 0)
points1Z = np.delete(points1Z, 0)

# Convert the array to 1D array
points1X = np.reshape(points1X,points1X.size)
points1Y = np.reshape(points1Y,points1Y.size)
points1Z = np.reshape(points1Z,points1Z.size)

my_data = genfromtxt('points2.csv', delimiter=',')
points2X = my_data[:,0]
points2Y = my_data[:,1]
points2Z = my_data[:,2]
## I remove the header of the CSV File.
points2X = np.delete(points2X, 0)
points2Y = np.delete(points2Y, 0)
points2Z = np.delete(points2Z, 0)

# Convert the array to 1D array
points2X = np.reshape(points2X,points2X.size)
points2Y = np.reshape(points2Y,points2Y.size)
points2Z = np.reshape(points2Z,points2Z.size)

ax.plot(points1X, points1Y, points1Z, 'd', markersize=8, markerfacecolor='red', label='points1')
ax.plot(points2X, points2Y, points2Z, 'd', markersize=8, markerfacecolor='blue', label='points2')

plt.show()

My problem is that I tried to make a decent surface plot out of these data points that I have. I already tried to use ax.plot_surface() function to make it look nice. For this I eliminated some points, and recalculated the matrix kind of input needed by this function. However, the graph I generated was far more difficult to interpret and understand. So there might be 2 possibilities: either I am not using the function correctly, or otherwise, the data I am trying to plot is not good for the surface plot.

What I was expecting was 3D graph which would have an effect similar to that we have of 3D pie chart. We see that one piece (that which is extracted out) is part of another piece. I was not expecting it to be exactly same like that, but some kind of effect like that.

What I would like to ask is:

1. Do you think it will be possible to make such 3D graph?
2. Is there any way better, I could express my data in 3 dimension?

Here are the 2 files -

points1.csv

Dim1,Dim2,Dim3
3,8,1
3,8,2
3,8,3
3,8,4
3,8,5
3,9,1
3,9,2
3,9,3
3,9,4
3,9,5
3,10,1
3,10,2
3,10,3
3,10,4
3,10,5
3,11,1
3,11,2
3,11,3
3,11,4
3,11,5
3,12,1
3,12,2
3,13,1
3,13,2
3,14,1
3,14,2
3,15,1
3,15,2
3,16,1
3,16,2
3,17,1
3,17,2
3,18,1
3,18,2
4,8,1
4,8,2
4,8,3
4,8,4
4,8,5
4,9,1
4,9,2
4,9,3
4,9,4
4,9,5
4,10,1
4,10,2
4,10,3
4,10,4
4,10,5
4,11,1
4,11,2
4,11,3
4,11,4
4,11,5
4,12,1
4,13,1
4,14,1
4,15,1
4,16,1
4,17,1
4,18,1
5,8,1
5,8,2
5,8,3
5,8,4
5,8,5
5,9,1
5,9,2
5,9,3
5,9,4
5,9,5
5,10,1
5,10,2
5,10,3
5,10,4
5,10,5
5,11,1
5,11,2
5,11,3
5,11,4
5,11,5
5,12,1
5,13,1
5,14,1
5,15,1
5,16,1
5,17,1
5,18,1
6,8,1
6,8,2
6,8,3
6,8,4
6,8,5
6,9,1
6,9,2
6,9,3
6,9,4
6,9,5
6,10,1
6,11,1
6,12,1
6,13,1
6,14,1
6,15,1
6,16,1
6,17,1
6,18,1
7,8,1
7,8,2
7,8,3
7,8,4
7,8,5
7,9,1
7,9,2
7,9,3
7,9,4
7,9,5

and points2.csv

Dim1,Dim2,Dim3
3,12,3
3,12,4
3,12,5
3,13,3
3,13,4
3,13,5
3,14,3
3,14,4
3,14,5
3,15,3
3,15,4
3,15,5
3,16,3
3,16,4
3,16,5
3,17,3
3,17,4
3,17,5
3,18,3
3,18,4
3,18,5
4,12,2
4,12,3
4,12,4
4,12,5
4,13,2
4,13,3
4,13,4
4,13,5
4,14,2
4,14,3
4,14,4
4,14,5
4,15,2
4,15,3
4,15,4
4,15,5
4,16,2
4,16,3
4,16,4
4,16,5
4,17,2
4,17,3
4,17,4
4,17,5
4,18,2
4,18,3
4,18,4
4,18,5
5,12,2
5,12,3
5,12,4
5,12,5
5,13,2
5,13,3
5,13,4
5,13,5
5,14,2
5,14,3
5,14,4
5,14,5
5,15,2
5,15,3
5,15,4
5,15,5
5,16,2
5,16,3
5,16,4
5,16,5
5,17,2
5,17,3
5,17,4
5,17,5
5,18,2
5,18,3
5,18,4
5,18,5
6,10,2
6,10,3
6,10,4
6,10,5
6,11,2
6,11,3
6,11,4
6,11,5
6,12,2
6,12,3
6,12,4
6,12,5
6,13,2
6,13,3
6,13,4
6,13,5
6,14,2
6,14,3
6,14,4
6,14,5
6,15,2
6,15,3
6,15,4
6,15,5
6,16,2
6,16,3
6,16,4
6,16,5
6,17,2
6,17,3
6,17,4
6,17,5
6,18,2
6,18,3
6,18,4
6,18,5
7,10,1
7,10,2
7,10,3
7,10,4
7,10,5
7,11,1
7,11,2
7,11,3
7,11,4
7,11,5
7,12,1
7,12,2
7,12,3
7,12,4
7,12,5
7,13,1
7,13,2
7,13,3
7,13,4
7,13,5
7,14,1
7,14,2
7,14,3
7,14,4
7,14,5
7,15,1
7,15,2
7,15,3
7,15,4
7,15,5
7,16,1
7,16,2
7,16,3
7,16,4
7,16,5
7,17,1
7,17,2
7,17,3
7,17,4
7,17,5
7,18,1
7,18,2
7,18,3
7,18,4
7,18,5

解决方案

I don't see where is your problem, besides that you need to grid your data. Here is how your data from points1.csv looks like:

import numpy as np
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import matplotlib.pyplot as plt
from scipy.interpolate import griddata

fig = plt.figure(figsize=plt.figaspect(0.5))
ax = fig.add_subplot(1, 2, 1, projection='3d')
# note this: you can skip rows!
my_data = np.genfromtxt('file1.csv', delimiter=',',skiprows=1)
X = my_data[:,0]
Y = my_data[:,1]
Z = my_data[:,2]

xi = np.linspace(X.min(),X.max(),100)
yi = np.linspace(Y.min(),Y.max(),100)
# VERY IMPORTANT, to tell matplotlib how is your data organized
zi = griddata((X, Y), Z, (xi[None,:], yi[:,None]), method='cubic')

CS = plt.contour(xi,yi,zi,15,linewidths=0.5,color='k')
ax = fig.add_subplot(1, 2, 2, projection='3d')

xig, yig = np.meshgrid(xi, yi)

surf = ax.plot_surface(xig, yig, zi,
        linewidth=0)

plt.show()

I hope this helps.

这篇关于Matplotlib绘制的三维表面不均匀的数据的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！