R lme4错误在'/ usr / lib / rstudio / bin / rsession'中：malloc（）：内存损坏： [英] R lme4 Error in '/usr/lib/rstudio/bin/rsession' : malloc(): memory corruption:

问题描述

每当我从 lme4 中运行 lmer 或 glmer 包，我得到以下错误：

'/ usr / lib / rstudio / bin / rsession'中的错误：malloc（）：memory
损坏：

我更新所有R包，但仍然得到相同的错误。任何帮助将高度赞赏。谢谢

sessionInfo（）

  R版本3.3.2（2016-10-31）
平台：i686-pc-linux-gnu（32位）
运行于：Ubuntu 16.04.2 LTS 
 
语言环境：
 [1] LC_CTYPE = en_US.UTF-8 LC_NUMERIC = C LC_TIME = en_US.UTF-8 
 [4] LC_COLLATE = en_US.UTF-8 LC_MONETARY = en_US.UTF-8 LC_MESSAGES = en_US .USF-8 
 [7] LC_PAPER = $ b附加的基础包：
 [1]统计图形grDevices utils数据集方法base 
 
其他附加包：
 [1] lme4_1.1-13 Matrix_1.2-8 
 
通过命名空间加载（并未附加）：
 [1] minqa_1.2.4 MASS_7.3-45 tools_3.3.2 Rcpp_0.12.9 splines_3.3.2 
 [6] nlme_3。 1-131 grid_3.3.2 nloptr_1.0.4 lattice_0.20-34 
  

已编辑

 库（lme4）
 fm1< ;  -  lmer（Reaction〜Days +（Days |主题），sleepstudy）
  

抛出以下错误：

$ b $ '/ usr / lib / rstudio / bin / rsession'中的错误：malloc（）：内存
损坏：

解决方案

有关最新的Matrix软件包1.2-8的问题，有32位操作系统的问题（来自Terry Therneau的pers。 Brian Ripley）。修复可能会在可能需要一段时间（pers。comm。，M. Maechler），所以我会尝试将Matrix降级到1.2-7版本，例如 devtools :: install_version（Matrix，1.2-7）（您需要安装编译工具）。看看Matrix的 NEWS文件，我怀疑这有与...有关：

• C-API：SuiteSparse_long现在在所有平台上定义为int64_t，而现在包括（C99）'inttypes.h'

Whenever I run lmer or glmer from lme4 package, I get the following error:

Error in '/usr/lib/rstudio/bin/rsession' : malloc(): memory corruption:

I update all R packages but still getting the same error. Any help will be highly appreciated. Thanks

sessionInfo()

R version 3.3.2 (2016-10-31)
Platform: i686-pc-linux-gnu (32-bit)
Running under: Ubuntu 16.04.2 LTS

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C               LC_TIME=en_US.UTF-8       
 [4] LC_COLLATE=en_US.UTF-8     LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
 [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                  LC_ADDRESS=C              
[10] LC_TELEPHONE=C             LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] lme4_1.1-13  Matrix_1.2-8

loaded via a namespace (and not attached):
[1] minqa_1.2.4     MASS_7.3-45     tools_3.3.2     Rcpp_0.12.9     splines_3.3.2  
[6] nlme_3.1-131    grid_3.3.2      nloptr_1.0.4    lattice_0.20-34

Edited

library(lme4)
fm1 <- lmer(Reaction ~ Days + (Days | Subject), sleepstudy)

Throws the following error:

Error in '/usr/lib/rstudio/bin/rsession' : malloc(): memory corruption:

解决方案

There have been reports of problems with the latest Matrix package, 1.2-8, on 32-bit OS's (pers. comm. from Terry Therneau and Brian Ripley). A fix is probably on its way may take a while (pers. comm., M. Maechler), so I would try downgrading Matrix to version 1.2-7, e.g. devtools::install_version("Matrix","1.2-7") (you'll need to have compilation tools installed). Looking at the NEWS file for Matrix, I suspect this has something to do with:

• C-API: SuiteSparse_long is now defined as int64_t on all platforms, and we now include (C99) ‘inttypes.h’

这篇关于R lme4错误在'/ usr / lib / rstudio / bin / rsession'中：malloc（）：内存损坏：的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！