使用ggplot2的时间序列图 [英] Time series plot with groups using ggplot2

问题描述

我有一个实验，随着时间的推移研究了三个不断发展的酵母种群。在离散的时间点，我们测量了他们的增长，这是响应变量。我基本上想要将酵母的增长作为一个时间序列来绘制，使用箱形图来总结每个点的测量结果，并分别绘制三个种群的每一个。基本上，看起来像这样的东西（作为一个新手，我不会发布实际的图像，所以x，y，z指的是三次重复）：

  | xyz 
 | x z xyz 
 | y xyz 
 | xyz y 
 | x z 
 | 
 ----------------------- 
 t0 t1 t2 
  

如何使用ggplot2完成这项工作？我有一种感觉，必须有一个简单而优雅的解决方案，但我找不到它。 解决方案

试试这段代码：

  require（ggplot2）
 
 df<  -  data.frame（
 time = Rep（seq（Sys.Date（），len = 3，by =1 day），10），
y = rep（1：3，10，each = 3）+ rorm（30） b $ b group = rep（c（x，y，z），10，each = 3）
）
 df $ time < -  factor（格式（df $ time ，格式=％Y-％m-％d））
 
p < -  ggplot（df，aes（x = time，y = y，fill = group））+ geom_boxplot b $ b print（p）
  

只有 x =因子（时间）， ggplot（df，aes（x = factor（time），y = y，fill = group））+ geom_boxplot（）+ scale_x_date（） p>

预处理，因子（格式（df $ time，format =％Y-％m-％d）），是这种形式的图形所必需的。

I have an experiment where three evolving populations of yeast have been studied over time. At discrete time points, we measured their growth, which is the response variable. I basically want to plot the growth of yeast as a time series, using boxplots to summarise the measurements taken at each point, and plotting each of the three populations separately. Basically, something that looks like this (as a newbie, I don't get to post actual images, so x,y,z refer to the three replicates):

|              xyz
|       x z    xyz
|  y    xyz
| xyz    y
| x z     
|
-----------------------
  t0     t1    t2

How can this be done using ggplot2? I have a feeling that there must be a simple and elegant solution, but I can't find it.

解决方案

Try this code:

require(ggplot2)

df <- data.frame(
  time = rep(seq(Sys.Date(), len = 3, by = "1 day"), 10),
  y = rep(1:3, 10, each = 3) + rnorm(30),
  group = rep(c("x", "y", "z"), 10, each = 3)
)
df$time <- factor(format(df$time, format = "%Y-%m-%d"))

p <- ggplot(df, aes(x = time, y = y, fill = group)) + geom_boxplot()
print(p)

Only with x = factor(time), ggplot(df, aes(x = factor(time), y = y, fill = group)) + geom_boxplot() + scale_x_date(), was not working.

Pre-processing, factor(format(df$time, format = "%Y-%m-%d")), was required for this form of graphics.

这篇关于使用ggplot2的时间序列图的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！