ggplot2盒须图：显示95％置信区间&删除异常值 [英] ggplot2 box-whisker plot: show 95% confidence intervals & remove outliers

问题描述

我想要一个盒子情节，看起来就像下面的情节。但不是缺省值，我想提出（1）95％置信区间和（2）没有异常值。

95％的置信区间可能意味着（i）延长盒子和除去胡须，或者（ii）只有一个胡须和胡须，然后取出盒子。或者如果人们有其他想法在这样的情节中呈现95％的置信区间，我愿意提供建议。最终目标是显示同一图上多个类别数据的平均值和conf间隔。

  set.seed（1234） 
 df < -  data.frame（cond = factor（rep（c（A，B），each = 200）），
 rating = c（rnorm（200），rnorm 200，mean = .8））
 ggplot（df，aes（x = cond，y = rating，fill = cond））+ geom_boxplot（）+ 
 guides（fill = FALSE）+ coord_flip（） 
  

图片和源代码： http://www.cookbook-r.com/Graphs/Plotting_distributions_（ggplot2）/

解决方案

您可以将大小设置为0来隐藏异常值：

  ggplot（df，aes （x = cond，y = rating，fill = cond））+ 
 geom_boxplot（outlier.size = 0）+ 
 guides（fill = FALSE）+ coord_flip（）
  

您可以使用 stat_summary 函数将平均值添加到图中：

$ b $

  ggplot（df，aes（x = cond，y = rating，fill = cond））+ 
 geom_boxplot（outlier.size = 0）+ 
 stat_summary（fun.y =mean，geom =point，shape = 23，size = 4，fill =white）+ 
 guides（fill = FALSE）+ 
 coord_flip（）
  

I'd like a box plot that looks just like the one below. But instead of the default, I'd like to present (1) 95% confidence intervals and (2) without the outliers.

The 95% confidence intervals could mean (i) extending the boxes and removing the whiskers, or (ii) having just a mean and whiskers, and removing the boxes. Or if people have other ideas for presenting 95% confidence intervals in a plot like this, I'm open to suggestions. The final goals is to show mean and conf intervals for data across multiple categories on the same plot.

set.seed(1234)
df <- data.frame(cond = factor( rep(c("A","B"), each=200) ), 
                   rating = c(rnorm(200),rnorm(200, mean=.8))
ggplot(df, aes(x=cond, y=rating, fill=cond)) + geom_boxplot() + 
    guides(fill=FALSE) + coord_flip()

Image and code source: http://www.cookbook-r.com/Graphs/Plotting_distributions_(ggplot2)/

解决方案

You can hide the outliers by setting the size to 0:

ggplot(df, aes(x=cond, y=rating, fill=cond)) + 
  geom_boxplot(outlier.size = 0) + 
  guides(fill=FALSE) + coord_flip()

You can add the mean to the plot with the stat_summary function:

ggplot(df, aes(x=cond, y=rating, fill=cond)) + 
  geom_boxplot(outlier.size = 0) + 
  stat_summary(fun.y="mean", geom="point", shape=23, size=4, fill="white") +
  guides(fill=FALSE) + 
  coord_flip()

这篇关于ggplot2盒须图：显示95％置信区间&删除异常值的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！